Classification:            DUB/Josephin

※ DUB/Josephin family introduction

    Josephin family represents DUBs with a papain-like cysteine protease catalytic domain. As a well studied Josephin family protein of Ataxin-3, the structure of the Josephin domain was solved by NMR which resembles that of UCH domain deubiquitinating enzymes. Furthermore, the active site residues of Ataxin-3 are positioned in a catalytically competent conformation which has been reported to edit K63-linked chains specifically (1).

1. Reyes-Turcu, F.E., Ventii, K.H. and Wilkinson, K.D. (2009) Regulation and cellular roles of ubiquitin-specific deubiquitinating enzymes. Annu. Rev. Biochem., 78, 363-397. PMID: 19489724



  Aegilops tauschii (1)  Ailuropoda melanoleuca (2)  Amborella trichopoda (2)
  Anas platyrhynchos (1)  Anolis carolinensis (2)  Arabidopsis lyrata (2)
  Arabidopsis thaliana (2)  Aspergillus flavus (1)  Aspergillus fumigatus (2)
  Astyanax mexicanus (3)  Bos taurus (2)  Brachypodium distachyon (2)
  Brassica oleracea (2)  Brassica rapa (2)  Caenorhabditis elegans (2)
  Callithrix jacchus (2)  Canis familiaris (2)  Cavia porcellus (2)
  Chlorocebus sabaeus (2)  Choloepus hoffmanni (1)  Ciona intestinalis (1)
  Ciona savignyi (1)  Colletotrichum gloeosporioides (1)  Cyanidioschyzon merolae (2)
  Danio rerio (2)  Dasypus novemcinctus (2)  Dipodomys ordii (3)
  Drosophila melanogaster (1)  Echinops telfairi (1)  Equus caballus (1)
  Erinaceus europaeus (2)  Felis catus (2)  Ficedula albicollis (1)
  Gadus morhua (3)  Gallus gallus (1)  Gasterosteus aculeatus (3)
  Glycine max (2)  Gorilla gorilla (2)  Homo sapiens (4)
  Hordeum vulgare (2)  Ictidomys tridecemlineatus (3)  Latimeria chalumnae (2)
  Leersia perrieri (2)  Lepisosteus oculatus (1)  Loxodonta africana (1)
  Macaca mulatta (2)  Macropus eugenii (2)  Magnaporthe oryzae (1)
  Medicago truncatula (2)  Melampsora laricipopulina (1)  Meleagris gallopavo (1)
  Monodelphis domestica (1)  Mus musculus (3)  Musa acuminata (1)
  Mustela putorius furo (3)  Myotis lucifugus (2)  Neosartorya fischeri (1)
  Nomascus leucogenys (3)  Ochotona princeps (1)  Oreochromis niloticus (3)
  Ornithorhynchus anatinus (1)  Oryctolagus cuniculus (1)  Oryza barthii (2)
  Oryza brachyantha (2)  Oryza glaberrima (2)  Oryza glumaepatula (2)
  Oryza indica (2)  Oryza longistaminata (2)  Oryza meridionalis (2)
  Oryza nivara (2)  Oryza punctata (2)  Oryza rufipogon (2)
  Oryza sativa (2)  Oryzias latipes (3)  Otolemur garnettii (2)
  Ovis aries (2)  Pan troglodytes (3)  Papio anubis (2)
  Pelodiscus sinensis (1)  Petromyzon marinus (1)  Physcomitrella patens (2)
  Poecilia formosa (3)  Pongo abelii (2)  Populus trichocarpa (1)
  Procavia capensis (3)  Prunus persica (2)  Pteropus vampyrus (2)
  Rattus norvegicus (2)  Sarcophilus harrisii (1)  Selaginella moellendorffii (1)
  Setaria italica (2)  Solanum lycopersicum (2)  Solanum tuberosum (2)
  Sorghum bicolor (2)  Sus scrofa (2)  Taeniopygia guttata (1)
  Takifugu rubripes (3)  Tarsius syrichta (2)  Tetraodon nigroviridis (3)
  Theobroma cacao (2)  Triticum aestivum (2)  Triticum urartu (1)
  Tupaia belangeri (1)  Tursiops truncatus (2)  Ustilago maydis (1)
  Vicugna pacos (1)  Vitis vinifera (2)  Xenopus tropicalis (3)
  Xiphophorus maculatus (3)  Zea mays (2)