Classification:            DUB/UCH


※ DUB/UCH family introduction

    Ubiquitin C-terminal hydrolase (UCH-L1), also called neuronal-specific protein gene product (PGP9.3), is highly abundant in neurons. Generally, UCH enzymes are small, since there is only a proteolytic core domain that functions to cleave small molecular weight adducts from the ubiquitin C terminus (1). There are at least three mammalian isozymes which are tissue specific and developmentally regulated (UCH-L1, L2, L3). A handful of studies suggest that UCH-L1 could serve as a novel biomarker, which has the potential to determine injury severity in TBI patients (2). Four UCH active site residues, Gln84, Cys90, His166 and Asp181 (Yuh1) were identified previously through mutagenesis of UCH-L1 and determination of the crystal structure of UCH-L3 (3).

1. Larsen, C.N., Krantz, B.A. and Wilkinson, K.D. (1998). Substrate specificity of deubiquitinating enzymes: ubiquitin C-terminal hydrolases. Biochemistry, 37, 3358-3368. PMID: 9521656

2. Papa, L., Akinyi, L., Liu, M.C., Pineda, J.A., Tepas, J.J., 3rd, Oli, M.W., Zheng, W., Robinson, G., Robicsek, S.A., Gabrielli, A., Heaton, S. C., Hannay, H. J., Demery, J. A., Brophy, G. M., Layon, J., Robertson, C. S., Hayes, R. L., Wang, K. K. (2010). Ubiquitin C-terminal hydrolase is a novel biomarker in humans for severe traumatic brain injury. Crit. Care. Med., 38, 138-144. PMID: 19726976

3. Johnston, S.C., Riddle, S.M., Cohen, R.E. and Hill, C.P. (1999). Structural basis for the specificity of ubiquitin C-terminal hydrolases. EMBO J., 18, 3877-3887. PMID: 10406793



  Aegilops tauschii (3)  Ailuropoda melanoleuca (4)  Amborella trichopoda (3)
  Anas platyrhynchos (4)  Anolis carolinensis (4)  Arabidopsis lyrata (4)
  Arabidopsis thaliana (3)  Ashbya gossypii (2)  Aspergillus clavatus (2)
  Aspergillus flavus (2)  Aspergillus fumigatus (2)  Aspergillus nidulans (2)
  Aspergillus niger (2)  Aspergillus oryzae (2)  Aspergillus terreus (2)
  Astyanax mexicanus (4)  Blumeria graminis (2)  Bos taurus (4)
  Botrytis cinerea (2)  Brachypodium distachyon (4)  Brassica oleracea (2)
  Brassica rapa (3)  Caenorhabditis elegans (3)  Callithrix jacchus (4)
  Canis familiaris (4)  Cavia porcellus (4)  Chlamydomonas reinhardtii (2)
  Chlorocebus sabaeus (4)  Choloepus hoffmanni (3)  Ciona intestinalis (2)
  Ciona savignyi (2)  Colletotrichum gloeosporioides (3)  Cryptococcus neoformans (2)
  Cyanidioschyzon merolae (2)  Danio rerio (4)  Dasypus novemcinctus (3)
  Dipodomys ordii (2)  Dothistroma septosporum (2)  Drosophila melanogaster (4)
  Echinops telfairi (3)  Equus caballus (4)  Erinaceus europaeus (3)
  Felis catus (3)  Ficedula albicollis (4)  Fusarium oxysporum (2)
  Fusarium solani (2)  Gadus morhua (4)  Gaeumannomyces graminis (2)
  Gallus gallus (4)  Gasterosteus aculeatus (4)  Glycine max (3)
  Gorilla gorilla (4)  Homo sapiens (4)  Hordeum vulgare (2)
  Ictidomys tridecemlineatus (4)  Komagataella pastoris (1)  Latimeria chalumnae (4)
  Leersia perrieri (2)  Lepisosteus oculatus (4)  Leptosphaeria maculans (2)
  Loxodonta africana (4)  Macaca mulatta (4)  Macropus eugenii (2)
  Magnaporthe oryzae (2)  Magnaporthe poae (2)  Medicago truncatula (2)
  Melampsora laricipopulina (2)  Meleagris gallopavo (4)  Microbotryum violaceum (2)
  Microcebus murinus (3)  Monodelphis domestica (4)  Mus musculus (5)
  Musa acuminata (2)  Mustela putorius furo (3)  Myotis lucifugus (5)
  Neosartorya fischeri (2)  Neurospora crassa (2)  Nomascus leucogenys (3)
  Ochotona princeps (4)  Oreochromis niloticus (4)  Ornithorhynchus anatinus (3)
  Oryctolagus cuniculus (4)  Oryza barthii (3)  Oryza brachyantha (4)
  Oryza glaberrima (3)  Oryza glumaepatula (3)  Oryza indica (2)
  Oryza longistaminata (3)  Oryza meridionalis (2)  Oryza nivara (3)
  Oryza punctata (3)  Oryza rufipogon (3)  Oryza sativa (3)
  Oryzias latipes (4)  Ostreococcus lucimarinus (2)  Otolemur garnettii (5)
  Ovis aries (6)  Pan troglodytes (3)  Papio anubis (4)
  Pelodiscus sinensis (4)  Petromyzon marinus (3)  Phaeosphaeria nodorum (2)
  Physcomitrella patens (2)  Poecilia formosa (4)  Pongo abelii (4)
  Populus trichocarpa (3)  Procavia capensis (3)  Prunus persica (2)
  Pteropus vampyrus (3)  Puccinia graminis (2)  Puccinia triticina (2)
  Pyrenophora teres (2)  Pyrenophora triticirepentis (4)  Rattus norvegicus (4)
  Saccharomyces cerevisiae (2)  Sarcophilus harrisii (4)  Schizosaccharomyces japonicus (2)
  Schizosaccharomyces pombe (3)  Sclerotinia sclerotiorum (2)  Selaginella moellendorffii (4)
  Setaria italica (5)  Solanum lycopersicum (3)  Solanum tuberosum (2)
  Sorex araneus (3)  Sorghum bicolor (5)  Sporisorium reilianum (1)
  Sus scrofa (5)  Taeniopygia guttata (4)  Takifugu rubripes (4)
  Tarsius syrichta (4)  Tetraodon nigroviridis (3)  Theobroma cacao (2)
  Trichoderma reesei (2)  Trichoderma virens (2)  Triticum aestivum (7)
  Triticum urartu (2)  Tuber melanosporum (2)  Tupaia belangeri (3)
  Tursiops truncatus (3)  Ustilago maydis (1)  Verticillium dahliae (3)
  Vicugna pacos (3)  Vitis vinifera (2)  Xenopus tropicalis (4)
  Xiphophorus maculatus (4)  Yarrowia lipolytica (2)  Zea mays (4)
  Zymoseptoria tritici (2)