Classification:            E3 activity/RBR


※ E3 activity/RBR family introduction

    The RBR family of E3 ligases has a distinctive organisation of RING fingers called 'RING-betweenRING-RING' (RBR), characterised by two RING fingers with a cysteine-rich region called the 'in-between-RING' domain that separates them (1, 2, 3). The domains in the RBR E3 ligases have been further named as RING1-BRcat-Rcat according to their structure and function: the C-terminal Rcat (required-for-catalysis) domain is essential for catalytic activity, whereas the central BRcat (benign-catalytic) domain adopts the same fold as the Rcat, but lacks a catalytic cysteine residue and ubiquitination activity (4). These ligases have a unique mechanism of elongating ubiquitin chains that distinguishes them from other E3 ligases.

1. http://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/IPR031127

2. Marín et al., 2004. Parkin and relatives: the RBR family of ubiquitin ligases. Physiol Genomics., 17(3):253-63. PMID: 15152079

3. Marín, 2009. RBR ubiquitin ligases: Diversification and streamlining in animal lineages. J Mol Evol., 69(1):54-64. PMID: 19526189

4. Spratt et al., 2014. RBR E3 ubiquitin ligases: new structures, new insights, new questions. Biochem J., 458(3):421-37. PMID: 24576094



  Aegilops tauschii (2)  Ailuropoda melanoleuca (6)  Amborella trichopoda (3)
  Anas platyrhynchos (8)  Anolis carolinensis (6)  Arabidopsis lyrata (4)
  Arabidopsis thaliana (5)  Ashbya gossypii (1)  Aspergillus clavatus (3)
  Aspergillus flavus (3)  Aspergillus fumigatus (2)  Aspergillus nidulans (3)
  Aspergillus niger (3)  Aspergillus oryzae (3)  Aspergillus terreus (2)
  Astyanax mexicanus (6)  Blumeria graminis (2)  Bos taurus (7)
  Botrytis cinerea (3)  Brachypodium distachyon (5)  Brassica oleracea (2)
  Brassica rapa (5)  Caenorhabditis elegans (5)  Callithrix jacchus (7)
  Canis familiaris (5)  Cavia porcellus (6)  Chlamydomonas reinhardtii (2)
  Chlorocebus sabaeus (6)  Choloepus hoffmanni (6)  Ciona intestinalis (7)
  Ciona savignyi (4)  Colletotrichum gloeosporioides (3)  Cryptococcus neoformans (3)
  Danio rerio (7)  Dasypus novemcinctus (5)  Dipodomys ordii (6)
  Dothistroma septosporum (3)  Drosophila melanogaster (3)  Echinops telfairi (5)
  Equus caballus (7)  Erinaceus europaeus (5)  Felis catus (7)
  Ficedula albicollis (6)  Fusarium oxysporum (2)  Fusarium solani (3)
  Gadus morhua (7)  Gaeumannomyces graminis (3)  Gallus gallus (8)
  Gasterosteus aculeatus (7)  Glycine max (3)  Gorilla gorilla (6)
  Homo sapiens (13)  Hordeum vulgare (3)  Ictidomys tridecemlineatus (6)
  Komagataella pastoris (1)  Latimeria chalumnae (6)  Leersia perrieri (5)
  Lepisosteus oculatus (6)  Leptosphaeria maculans (2)  Loxodonta africana (6)
  Macaca mulatta (7)  Macropus eugenii (7)  Magnaporthe oryzae (3)
  Magnaporthe poae (2)  Medicago truncatula (3)  Melampsora laricipopulina (2)
  Meleagris gallopavo (7)  Microbotryum violaceum (3)  Microcebus murinus (6)
  Monodelphis domestica (6)  Mus musculus (7)  Musa acuminata (5)
  Mustela putorius furo (6)  Myotis lucifugus (6)  Neosartorya fischeri (2)
  Neurospora crassa (3)  Nomascus leucogenys (5)  Ochotona princeps (6)
  Oreochromis niloticus (6)  Ornithorhynchus anatinus (8)  Oryctolagus cuniculus (6)
  Oryza barthii (3)  Oryza brachyantha (4)  Oryza glaberrima (3)
  Oryza glumaepatula (4)  Oryza indica (3)  Oryza longistaminata (2)
  Oryza meridionalis (3)  Oryza nivara (2)  Oryza punctata (4)
  Oryza rufipogon (3)  Oryza sativa (3)  Oryzias latipes (7)
  Ostreococcus lucimarinus (2)  Otolemur garnettii (6)  Ovis aries (6)
  Pan troglodytes (5)  Papio anubis (5)  Pelodiscus sinensis (6)
  Petromyzon marinus (4)  Phaeosphaeria nodorum (3)  Physcomitrella patens (4)
  Poecilia formosa (6)  Pongo abelii (5)  Populus trichocarpa (4)
  Procavia capensis (7)  Prunus persica (4)  Pteropus vampyrus (6)
  Puccinia graminis (2)  Puccinia triticina (2)  Pyrenophora teres (4)
  Pyrenophora triticirepentis (3)  Rattus norvegicus (5)  Saccharomyces cerevisiae (2)
  Sarcophilus harrisii (7)  Schizosaccharomyces japonicus (1)  Schizosaccharomyces pombe (2)
  Sclerotinia sclerotiorum (1)  Selaginella moellendorffii (4)  Setaria italica (3)
  Solanum lycopersicum (4)  Solanum tuberosum (5)  Sorex araneus (5)
  Sorghum bicolor (3)  Sporisorium reilianum (2)  Sus scrofa (9)
  Taeniopygia guttata (6)  Takifugu rubripes (6)  Tarsius syrichta (6)
  Tetraodon nigroviridis (5)  Theobroma cacao (4)  Trichoderma reesei (3)
  Trichoderma virens (3)  Triticum aestivum (5)  Triticum urartu (2)
  Tuber melanosporum (2)  Tupaia belangeri (7)  Tursiops truncatus (7)
  Ustilago maydis (2)  Verticillium dahliae (2)  Vicugna pacos (6)
  Vitis vinifera (3)  Xenopus tropicalis (6)  Xiphophorus maculatus (5)
  Yarrowia lipolytica (2)  Zea mays (3)  Zymoseptoria tritici (2)