Classification:            E3 activity/RING/U-box


※ E3 activity/RING/U-box family introduction

    The U-box is a protein domain with about 70 amino acids. Although the U-box domain is similar with the RING domain, the zinc-binding sites in the RING domain are replaced by conserved charged and polar residues to maintain structure and activity (1). Previously, the U-box protein was considered as a ubiquitin chain assembly factor to catalyze the formation of a ubiquitin chain on ubiquitinated substrates, while recent studies showed that it could mediate polyubiquitylation in the absence of a HECT type or RING-finger type E3. Although the understanding of the detailed mechanisms and functions of the U-box proteins are still limited, it is proposed that they are involved in various biological processes such as the cellular stress response to the intracellular accumulation of abnormal proteins (2).

1. http://www.ebi.ac.uk/interpro/entry/IPR003613

2. Hatakeyama, S. and K. I. Nakayama (2003) U-box proteins as a new family of ubiquitin ligases. Biochem. Biophys. Res. Commun., 302(4): 635-45. PMID: 12646216



  Aegilops tauschii (70)  Ailuropoda melanoleuca (35)  Amborella trichopoda (52)
  Anas platyrhynchos (27)  Anolis carolinensis (64)  Arabidopsis lyrata (96)
  Arabidopsis thaliana (85)  Ashbya gossypii (6)  Aspergillus clavatus (11)
  Aspergillus flavus (10)  Aspergillus fumigatus (11)  Aspergillus nidulans (9)
  Aspergillus niger (11)  Aspergillus oryzae (10)  Aspergillus terreus (11)
  Astyanax mexicanus (92)  Blumeria graminis (9)  Bos taurus (40)
  Botrytis cinerea (11)  Brachypodium distachyon (83)  Brassica napus (1)
  Brassica oleracea (124)  Brassica rapa (124)  Bruguiera gymnorhiza (1)
  Caenorhabditis elegans (10)  Callithrix jacchus (39)  Canis familiaris (32)
  Capsicum annuum (1)  Cavia porcellus (37)  Chlamydomonas reinhardtii (27)
  Chlorocebus sabaeus (44)  Choloepus hoffmanni (18)  Ciona intestinalis (15)
  Ciona savignyi (12)  Colletotrichum gloeosporioides (7)  Cryptococcus neoformans (4)
  Cyanidioschyzon merolae (7)  Danio rerio (153)  Dasypus novemcinctus (44)
  Dipodomys ordii (37)  Dothistroma septosporum (11)  Drosophila melanogaster (15)
  Echinops telfairi (29)  Equus caballus (34)  Erinaceus europaeus (29)
  Felis catus (36)  Ficedula albicollis (25)  Fusarium oxysporum (9)
  Fusarium solani (8)  Gadus morhua (66)  Gaeumannomyces graminis (8)
  Gallus gallus (34)  Gasterosteus aculeatus (111)  Glycine max (156)
  Gorilla gorilla (42)  Homo sapiens (55)  Hordeum vulgare (67)
  Ictidomys tridecemlineatus (38)  Komagataella pastoris (8)  Latimeria chalumnae (97)
  Leersia perrieri (88)  Lepisosteus oculatus (56)  Leptosphaeria maculans (9)
  Lotus japonicus (1)  Loxodonta africana (52)  Macaca mulatta (42)
  Macropus eugenii (25)  Magnaporthe oryzae (8)  Magnaporthe poae (9)
  Marchantia polymorpha (1)  Medicago truncatula (91)  Melampsora laricipopulina (7)
  Meleagris gallopavo (25)  Microbotryum violaceum (9)  Microcebus murinus (32)
  Monodelphis domestica (56)  Mus musculus (41)  Musa acuminata (112)
  Mustela putorius furo (38)  Myotis lucifugus (50)  Neosartorya fischeri (12)
  Neurospora crassa (9)  Nomascus leucogenys (37)  Ochotona princeps (42)
  Oreochromis niloticus (167)  Ornithorhynchus anatinus (25)  Oryctolagus cuniculus (39)
  Oryza barthii (82)  Oryza brachyantha (76)  Oryza glaberrima (86)
  Oryza glumaepatula (87)  Oryza indica (86)  Oryza longistaminata (71)
  Oryza meridionalis (74)  Oryza nivara (91)  Oryza punctata (95)
  Oryza rufipogon (90)  Oryza sativa (89)  Oryzias latipes (85)
  Ostreococcus lucimarinus (14)  Otolemur garnettii (40)  Ovis aries (36)
  Pan troglodytes (41)  Papio anubis (42)  Pelodiscus sinensis (76)
  Petromyzon marinus (16)  Phaeosphaeria nodorum (9)  Physcomitrella patens (62)
  Poecilia formosa (150)  Pongo abelii (41)  Populus trichocarpa (116)
  Procavia capensis (33)  Prunus persica (70)  Pteropus vampyrus (37)
  Puccinia graminis (7)  Puccinia triticina (6)  Pyrenophora teres (11)
  Pyrenophora triticirepentis (10)  Rattus norvegicus (38)  Saccharomyces cerevisiae (5)
  Sarcophilus harrisii (37)  Schizosaccharomyces japonicus (9)  Schizosaccharomyces pombe (8)
  Sclerotinia sclerotiorum (7)  Selaginella moellendorffii (89)  Setaria italica (86)
  Solanum lycopersicum (88)  Solanum tuberosum (88)  Sorex araneus (27)
  Sorghum bicolor (82)  Sporisorium reilianum (9)  Sus scrofa (42)
  Taeniopygia guttata (24)  Takifugu rubripes (51)  Tarsius syrichta (18)
  Tetraodon nigroviridis (47)  Theobroma cacao (70)  Trichoderma reesei (7)
  Trichoderma virens (7)  Triticum aestivum (222)  Triticum urartu (67)
  Tuber melanosporum (6)  Tupaia belangeri (26)  Tursiops truncatus (36)
  Ustilago maydis (7)  Verticillium dahliae (7)  Vicugna pacos (25)
  Vitis vinifera (69)  Xenopus tropicalis (84)  Xiphophorus maculatus (53)
  Yarrowia lipolytica (11)  Zea mays (103)  Zymoseptoria tritici (11)