Classification:            E3 adaptor/Cullin RING/BCR/BTB_3-box


※ E3 adaptor/Cullin RING/BCR/BTB_3-box family introduction

    BTB (also known as POZ) was first identified as a conserved motif presented in the Drosophila melanogaster Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad complex transcription regulators (1). BTB, Cul3 and RBX1 form a Cul3-based ligase (BCR), which targets substrates for ubiquitin-dependent degradation by the 26S proteasome. As a substrate recognition subunit of Cul3-based ligase, the member of BTB family can bridge the Cul3 to the substrate in a single polypeptide (2,3). Recently, it was observed that a 3-box is responsible for the Cul3-interacting in a variety of BTB proteins including almost all of BTB-Kelch and MATH-BTB proteins (4). Here we defined the BTB_3-box family as the proteins contain both BTB domain and 3-box domain. BTB-containing proteins are highly conserved and participate in diverse biological processes, including transcriptional regulation, ion channel assembly and gating, cytoskeleton dynamics, and targeting proteins for ubiquitination (1).

1. Stogios, P.J., Downs, G.S., Jauhal, J.J., Nandra, S.K. and Prive, G.G. (2005). Sequence and structural analysis of BTB domain proteins. Genome Biol., 6, R82. PMID: 16207353

2. Xu, L., Wei, Y., Reboul, J., Vaglio, P., Shin, T.H., Vidal, M., Elledge, S.J. and Harper, J.W. (2003). BTB proteins are substrate-specific adaptors in an SCF-like modular ubiquitin ligase containing CUL-3. Nature, 425, 316-321. PMID: 13679922

3. Pintard, L., Willems, A. and Peter, M. (2004). Cullin-based ubiquitin ligases: Cul3-BTB complexes join the family. EMBO J., 23, 1681-1687. PMID: 15071497

4. Zhuang, M., Calabrese, M.F., Liu, J., Waddell, M.B., Nourse, A., Hammel, M., Miller, D.J., Walden, H., Duda, D.M., Seyedin, S.N., Hoggard, T., Harper, J. W., White, K. P. and Schulman, B. A.. (2009). Structures of SPOP-substrate complexes: insights into molecular architectures of BTB-Cul3 ubiquitin ligases. Mol. Cell, 36(1): 39-50. PMID: 19818708



  Aegilops tauschii (64)  Ailuropoda melanoleuca (34)  Amborella trichopoda (5)
  Anas platyrhynchos (38)  Anolis carolinensis (35)  Arabidopsis lyrata (14)
  Arabidopsis thaliana (16)  Aspergillus clavatus (1)  Aspergillus fumigatus (1)
  Aspergillus nidulans (1)  Aspergillus niger (3)  Aspergillus oryzae (1)
  Aspergillus terreus (2)  Astyanax mexicanus (39)  Blumeria graminis (1)
  Bos taurus (35)  Botrytis cinerea (3)  Brachypodium distachyon (17)
  Brassica oleracea (13)  Brassica rapa (12)  Caenorhabditis elegans (9)
  Callithrix jacchus (35)  Canis familiaris (34)  Cavia porcellus (51)
  Chlamydomonas reinhardtii (3)  Chlorocebus sabaeus (33)  Choloepus hoffmanni (18)
  Ciona intestinalis (12)  Ciona savignyi (8)  Colletotrichum gloeosporioides (2)
  Danio rerio (48)  Dasypus novemcinctus (33)  Dipodomys ordii (27)
  Drosophila melanogaster (10)  Echinops telfairi (28)  Ectromelia virus (1)
  Equus caballus (35)  Erinaceus europaeus (22)  Felis catus (34)
  Ficedula albicollis (35)  Fusarium oxysporum (2)  Fusarium solani (1)
  Gadus morhua (29)  Gaeumannomyces graminis (1)  Gallus gallus (37)
  Gasterosteus aculeatus (35)  Glycine max (5)  Gorilla gorilla (35)
  Homo sapiens (38)  Hordeum vulgare (12)  Ictidomys tridecemlineatus (34)
  Latimeria chalumnae (34)  Leersia perrieri (20)  Lepisosteus oculatus (36)
  Leptosphaeria maculans (3)  Loxodonta africana (35)  Macaca mulatta (35)
  Macropus eugenii (29)  Magnaporthe oryzae (1)  Magnaporthe poae (1)
  Medicago truncatula (6)  Melampsora laricipopulina (1)  Meleagris gallopavo (31)
  Microbotryum violaceum (1)  Microcebus murinus (31)  Monodelphis domestica (37)
  Mus musculus (39)  Musa acuminata (10)  Mustela putorius furo (36)
  Myotis lucifugus (39)  Neosartorya fischeri (4)  Nomascus leucogenys (35)
  Ochotona princeps (29)  Oreochromis niloticus (41)  Ornithorhynchus anatinus (28)
  Oryctolagus cuniculus (35)  Oryza barthii (27)  Oryza brachyantha (17)
  Oryza glaberrima (25)  Oryza glumaepatula (25)  Oryza indica (32)
  Oryza longistaminata (34)  Oryza meridionalis (17)  Oryza nivara (30)
  Oryza punctata (28)  Oryza rufipogon (29)  Oryza sativa (18)
  Oryzias latipes (37)  Ostreococcus lucimarinus (1)  Otolemur garnettii (36)
  Ovis aries (35)  Pan troglodytes (34)  Papio anubis (34)
  Pelodiscus sinensis (37)  Petromyzon marinus (14)  Phaeosphaeria nodorum (2)
  Physcomitrella patens (3)  Poecilia formosa (38)  Pongo abelii (35)
  Populus trichocarpa (11)  Procavia capensis (22)  Prunus persica (7)
  Pteropus vampyrus (30)  Puccinia graminis (2)  Pyrenophora teres (2)
  Pyrenophora triticirepentis (4)  Rattus norvegicus (43)  Sarcophilus harrisii (32)
  Selaginella moellendorffii (4)  Setaria italica (31)  Solanum lycopersicum (8)
  Solanum tuberosum (9)  Sorex araneus (24)  Sorghum bicolor (33)
  Sus scrofa (32)  Taeniopygia guttata (35)  Takifugu rubripes (37)
  Tarsius syrichta (26)  Tetraodon nigroviridis (36)  Theobroma cacao (9)
  Triticum aestivum (144)  Triticum urartu (41)  Tupaia belangeri (19)
  Tursiops truncatus (32)  Verticillium dahliae (2)  Vicugna pacos (23)
  Vitis vinifera (6)  Xenopus laevis (1)  Xenopus tropicalis (33)
  Xiphophorus maculatus (37)  Zea mays (11)  Zymoseptoria tritici (2)