Classification:            E3 adaptor/Cullin RING/DCX/DDB1


※ E3 adaptor/Cullin RING/DCX/DDB1 family introduction

    DDB1 represents "DNA damage-binding protein 1", a subunit of DCX (DDB1-CUL4-X-box) E3 ligase complex. Members of DDB1 family can recruit substrate-specific recognizing and binding adaptors to the DCX complex. The substrate-specific adaptors contain two main classes, DCAF (DDB1- and CUL4-associated factor) and WDR (WD40-repeat) proteins (1,2). As conserved in eukaryote, the DDB1-containting DCX complex is a Cullin-RING ubiquitin ligase that can regulate DNA replication and transcription, DNA repair, and can also be hijacked by pathogenic viruses to make for viral infection (3).

1. Lee, J. and Zhou, P. (2007). DCAFs, the missing link of the CUL4-DDB1 ubiquitin ligase. Mol. Cell, 26, 775-780. PMID: 17588513

2. Higa, L.A., Wu, M., Ye, T., Kobayashi, R., Sun, H. and Zhang, H. (2006). CUL4-DDB1 ubiquitin ligase interacts with multiple WD40-repeat proteins and regulates histone methylation. Nat Cell. Biol., 8, 1277-1283.PMID: 17041588

3. Angers, S., Li, T., Yi, X., MacCoss, M.J., Moon, R.T. and Zheng, N. (2006). Molecular architecture and assembly of the DDB1-CUL4A ubiquitin ligase machinery. Nature, 443, 590-593. PMID: 16964240



  Aegilops tauschii (1)  Ailuropoda melanoleuca (2)  Amborella trichopoda (1)
  Anas platyrhynchos (2)  Anolis carolinensis (1)  Arabidopsis lyrata (3)
  Arabidopsis thaliana (3)  Ashbya gossypii (1)  Aspergillus clavatus (1)
  Aspergillus flavus (1)  Aspergillus fumigatus (2)  Aspergillus nidulans (2)
  Aspergillus niger (1)  Aspergillus oryzae (1)  Aspergillus terreus (1)
  Astyanax mexicanus (1)  Blumeria graminis (1)  Bos taurus (2)
  Botrytis cinerea (2)  Brachypodium distachyon (1)  Brassica oleracea (2)
  Brassica rapa (2)  Caenorhabditis elegans (1)  Callithrix jacchus (2)
  Canis familiaris (2)  Cavia porcellus (2)  Chlamydomonas reinhardtii (1)
  Chlorocebus sabaeus (2)  Choloepus hoffmanni (2)  Ciona intestinalis (2)
  Ciona savignyi (1)  Colletotrichum gloeosporioides (2)  Cyanidioschyzon merolae (1)
  Danio rerio (1)  Dasypus novemcinctus (2)  Dipodomys ordii (2)
  Dothistroma septosporum (1)  Drosophila melanogaster (2)  Echinops telfairi (1)
  Equus caballus (2)  Erinaceus europaeus (2)  Felis catus (1)
  Ficedula albicollis (2)  Fusarium oxysporum (1)  Fusarium solani (1)
  Gadus morhua (2)  Gaeumannomyces graminis (1)  Gallus gallus (2)
  Gasterosteus aculeatus (1)  Glycine max (2)  Gorilla gorilla (1)
  Homo sapiens (1)  Hordeum vulgare (1)  Ictidomys tridecemlineatus (1)
  Latimeria chalumnae (1)  Leersia perrieri (1)  Lepisosteus oculatus (1)
  Leptosphaeria maculans (2)  Loxodonta africana (1)  Macaca mulatta (1)
  Macropus eugenii (1)  Magnaporthe oryzae (1)  Magnaporthe poae (1)
  Medicago truncatula (1)  Melampsora laricipopulina (2)  Meleagris gallopavo (2)
  Microbotryum violaceum (1)  Microcebus murinus (1)  Monodelphis domestica (1)
  Mus musculus (1)  Musa acuminata (1)  Mustela putorius furo (2)
  Myotis lucifugus (2)  Neosartorya fischeri (2)  Neurospora crassa (1)
  Nomascus leucogenys (1)  Ochotona princeps (1)  Oreochromis niloticus (2)
  Ornithorhynchus anatinus (1)  Oryctolagus cuniculus (1)  Oryza barthii (2)
  Oryza brachyantha (2)  Oryza glumaepatula (1)  Oryza indica (1)
  Oryza longistaminata (1)  Oryza meridionalis (1)  Oryza nivara (1)
  Oryza punctata (1)  Oryza rufipogon (1)  Oryza sativa (1)
  Oryzias latipes (1)  Ostreococcus lucimarinus (1)  Otolemur garnettii (2)
  Ovis aries (2)  Pan troglodytes (2)  Papio anubis (2)
  Pelodiscus sinensis (1)  Petromyzon marinus (2)  Phaeosphaeria nodorum (2)
  Physcomitrella patens (1)  Poecilia formosa (2)  Pongo abelii (2)
  Populus trichocarpa (1)  Procavia capensis (2)  Prunus persica (2)
  Pteropus vampyrus (2)  Puccinia graminis (1)  Puccinia triticina (1)
  Pyrenophora teres (1)  Pyrenophora triticirepentis (2)  Rattus norvegicus (2)
  Saccharomyces cerevisiae (1)  Sarcophilus harrisii (2)  Schizosaccharomyces japonicus (1)
  Schizosaccharomyces pombe (1)  Sclerotinia sclerotiorum (1)  Selaginella moellendorffii (3)
  Setaria italica (1)  Solanum lycopersicum (1)  Solanum tuberosum (1)
  Sorex araneus (1)  Sorghum bicolor (1)  Sporisorium reilianum (1)
  Sus scrofa (2)  Taeniopygia guttata (2)  Takifugu rubripes (2)
  Tarsius syrichta (2)  Tetraodon nigroviridis (2)  Theobroma cacao (1)
  Trichoderma reesei (1)  Trichoderma virens (2)  Triticum aestivum (3)
  Triticum urartu (1)  Tuber melanosporum (1)  Tursiops truncatus (2)
  Ustilago maydis (1)  Verticillium dahliae (1)  Vicugna pacos (2)
  Vitis vinifera (1)  Xenopus tropicalis (1)  Xiphophorus maculatus (2)
  Zea mays (1)  Zymoseptoria tritici (1)