Classification:            E3 adaptor/Cullin RING/ECS/SOCS_VHL_BC-box


※ E3 adaptor/Cullin RING/ECS/SOCS_VHL_BC-box family introduction

    SOCS/VHL/BC-box represents a family that comprises SOCS proteins, VHL proteins and only BC-box containing proteins. The BC-box is a sub-domain that exists in both the SOCS and VHL domains and facilitates binding to the Elongin-B/C complex. SOCS is an ~80-residue domain named "Supressors Of Cytokine Signaling", which is located in the C-terminus and specifically recognize and bind a substrate. VHL is named "Von-Hippel Lindau", which forms the core of a large BCR E3 ubiquitin ligase complex. Compared to the SOCS domain, VHL lacks a C-terminal sequence (downstream of the BC-box) of the SOCS. VHL protein specifically interacts with endogenous Cul2-Rbx1 in mammalian cells. VHL or SOCS can serve as a substrate recognition subunit and form a BCR ubiquitin ligase complex, which targets the substrates for proteasome degradation (1).

1. Kamura, T., Maenaka, K., Kotoshiba, S., Matsumoto, M., Kohda, D., Conaway, R.C., Conaway, J.W. and Nakayama, K.I. (2004). VHL-box and SOCS-box domains determine binding specificity for Cul2-Rbx1 and Cul5-Rbx2 modules of ubiquitin ligases. Genes Dev., 18, 3055-3065. PMID: 15601820



  Aegilops tauschii (3)  Ailuropoda melanoleuca (33)  Amborella trichopoda (4)
  Anas platyrhynchos (31)  Anolis carolinensis (32)  Arabidopsis lyrata (2)
  Arabidopsis thaliana (4)  Ashbya gossypii (1)  Aspergillus clavatus (3)
  Aspergillus flavus (1)  Aspergillus fumigatus (2)  Aspergillus nidulans (3)
  Aspergillus niger (3)  Aspergillus oryzae (1)  Aspergillus terreus (2)
  Astyanax mexicanus (35)  Blumeria graminis (2)  Bos taurus (35)
  Botrytis cinerea (2)  Brachypodium distachyon (2)  Brassica oleracea (4)
  Brassica rapa (4)  Caenorhabditis elegans (9)  Callithrix jacchus (35)
  Canis familiaris (35)  Cavia porcellus (34)  Chlamydomonas reinhardtii (3)
  Chlorocebus sabaeus (36)  Choloepus hoffmanni (21)  Ciona intestinalis (11)
  Ciona savignyi (9)  Colletotrichum gloeosporioides (2)  Cryptococcus neoformans (2)
  Cyanidioschyzon merolae (2)  Danio rerio (37)  Dasypus novemcinctus (32)
  Dipodomys ordii (26)  Dothistroma septosporum (3)  Drosophila melanogaster (11)
  Echinops telfairi (26)  Equus caballus (33)  Erinaceus europaeus (23)
  Felis catus (35)  Ficedula albicollis (31)  Fusarium oxysporum (4)
  Fusarium solani (3)  Gadus morhua (29)  Gaeumannomyces graminis (2)
  Gallus gallus (33)  Gasterosteus aculeatus (30)  Glycine max (3)
  Gorilla gorilla (37)  Homo sapiens (38)  Hordeum vulgare (3)
  Ictidomys tridecemlineatus (35)  Komagataella pastoris (2)  Latimeria chalumnae (35)
  Leersia perrieri (4)  Lepisosteus oculatus (32)  Leptosphaeria maculans (4)
  Loxodonta africana (35)  Macaca mulatta (34)  Macropus eugenii (30)
  Magnaporthe oryzae (2)  Magnaporthe poae (2)  Medicago truncatula (4)
  Melampsora laricipopulina (2)  Meleagris gallopavo (29)  Microbotryum violaceum (1)
  Microcebus murinus (31)  Monodelphis domestica (33)  Mus musculus (37)
  Musa acuminata (3)  Mustela putorius furo (36)  Myotis lucifugus (31)
  Neosartorya fischeri (3)  Neurospora crassa (1)  Nomascus leucogenys (34)
  Ochotona princeps (29)  Oreochromis niloticus (34)  Ornithorhynchus anatinus (24)
  Oryctolagus cuniculus (32)  Oryza barthii (3)  Oryza brachyantha (2)
  Oryza glaberrima (5)  Oryza glumaepatula (3)  Oryza indica (4)
  Oryza longistaminata (4)  Oryza meridionalis (2)  Oryza nivara (4)
  Oryza punctata (2)  Oryza rufipogon (4)  Oryza sativa (4)
  Oryzias latipes (29)  Ostreococcus lucimarinus (1)  Otolemur garnettii (36)
  Ovis aries (33)  Pan troglodytes (36)  Papio anubis (34)
  Pelodiscus sinensis (34)  Petromyzon marinus (18)  Phaeosphaeria nodorum (3)
  Physcomitrella patens (2)  Poecilia formosa (37)  Pongo abelii (35)
  Populus trichocarpa (5)  Procavia capensis (28)  Prunus persica (2)
  Pteropus vampyrus (30)  Puccinia graminis (2)  Pyrenophora teres (2)
  Pyrenophora triticirepentis (3)  Rattus norvegicus (35)  Saccharomyces cerevisiae (1)
  Sarcophilus harrisii (34)  Schizosaccharomyces japonicus (3)  Schizosaccharomyces pombe (3)
  Sclerotinia sclerotiorum (1)  Selaginella moellendorffii (3)  Setaria italica (4)
  Solanum lycopersicum (3)  Solanum tuberosum (1)  Sorex araneus (17)
  Sorghum bicolor (2)  Sporisorium reilianum (2)  Sus scrofa (33)
  Taeniopygia guttata (33)  Takifugu rubripes (29)  Tarsius syrichta (23)
  Tetraodon nigroviridis (33)  Theobroma cacao (7)  Trichoderma reesei (2)
  Trichoderma virens (2)  Triticum aestivum (5)  Triticum urartu (2)
  Tuber melanosporum (2)  Tupaia belangeri (23)  Tursiops truncatus (32)
  Ustilago maydis (1)  Verticillium dahliae (1)  Vicugna pacos (23)
  Vitis vinifera (5)  Xenopus laevis (1)  Xenopus tropicalis (33)
  Xiphophorus maculatus (37)  Yarrowia lipolytica (2)  Zea mays (2)
  Zymoseptoria tritici (3)