Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
iUUCD ID | IUUC-Ath-006934 | ||||||||||||||||||||||||
UUCD1 version | UUC-ArT-01434 | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein ID | AT1G66050.1 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Accession | Q680I0; Q6NQ90; Q9C8E0; ORTH5_ARATH | ||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | AAG51305.1; AEE34456.1; AAQ65191.1; BAD43457.1; BAD43650.1; BAD43775.1 | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | E3 ubiquitin-protein ligase ORTHRUS 5; Protein VARIANT IN METHYLATION 2; RING-type E3 ubiquitin transferase ORTHRUS 5 | ||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | AC026480; CP002684; BT010568; AK175694; AK175887; AK176012 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ORTH5; VIM2; At1g66050; F15E12.5 | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Information |
|
||||||||||||||||||||||||
Annotation |
|
||||||||||||||||||||||||
Status | Reviewed | ||||||||||||||||||||||||
Details |
|
||||||||||||||||||||||||
Classification |
| ||||||||||||||||||||||||
Active Site |
| ||||||||||||||||||||||||
Domain Profile | S: 6 flCpIslelMrdPvvlpsGitydrssIekwlasggk.tcPvtrqplt 51 S: 1 CaiCledfkdgplvlpCgHvfhadClqkwpglknssskefrCPlCr 46 | ||||||||||||||||||||||||
Organism | Arabidopsis thaliana | ||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View) |
E3 ubiquitin-protein ligase. Participates in CpG methylation-dependent transcriptional regulation and epigenetic transcriptional silencing. Mediates ubiquitination with the E2 ubiquitin-conjugating enzyme UBC11. | ||||||||||||||||||||||||
Protein Sequence (Fasta) |
|||||||||||||||||||||||||
Nucleotide Sequence (Fasta) |
TCTTATCTCT TTGTGAGATT TTTTTCTTTT TTTGAAGGAT TTTTACAAAT CATTTTGAAT 60
TCGTCTTCCC AAAATTTCAA AACCCGCCTC TTCACTTTTC GCCTTCCTCT ACTTATTTAG 120 It may take some time, please wait.
|
||||||||||||||||||||||||
Sequence Source | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||
Keyword | KW-0156--Chromatin regulator |
||||||||||||||||||||||||
Interpro | IPR015947--PUA-like_domain |
||||||||||||||||||||||||
PROSITE | PS51015--YDG |
||||||||||||||||||||||||
Pfam | |||||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | GO:0005720--C:nuclear heterochromatin |
||||||||||||||||||||||||
KEGG | ath:AT1G66050 | ||||||||||||||||||||||||
Orthology |
|
||||||||||||||||||||||||
Created Date | 25-Jun-2017 |