Tag | Content | ||||||||||||||||||||||||
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iUUCD ID | IUUC-Ath-006680 | ||||||||||||||||||||||||
UUCD1 version | UUC-ArT-01512 | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein ID | AT1G57800.2 | ||||||||||||||||||||||||
UniProt Accession | Q9FVS2; ORTH3_ARATH | ||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | AAG29230.1; AEE33468.1 | ||||||||||||||||||||||||
Protein Name | E3 ubiquitin-protein ligase ORTHRUS 3; Protein VARIANT IN METHYLATION 5; RING-type E3 ubiquitin transferase ORTHRUS 3 | ||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | AC079732; CP002684 | ||||||||||||||||||||||||
Gene Name | ORTH3; VIM5; At1g57800; F12K22.15 | ||||||||||||||||||||||||
Ensembl Information |
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Annotation |
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Status | Reviewed | ||||||||||||||||||||||||
Details |
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Classification |
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Active Site |
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Domain Profile | S: 1 CaiCledfkdgplv.................lpCgHvfhadClqkwpglknssskefrCPlCr 46 | ||||||||||||||||||||||||
Organism | Arabidopsis thaliana | ||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View) |
E3 ubiquitin-protein ligase. May participate in CpG methylation-dependent transcriptional regulation (By similarity). | ||||||||||||||||||||||||
Protein Sequence (Fasta) |
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Nucleotide Sequence (Fasta) |
ATGACGCCTG CCACCCAGTA CCCATGCGAC CCCGAAGGTG TATGCATGCG ATGCAAATCG 60
ATGCCTCCAC CGGAGGAATC TCTCACTTGC GGCACGTGCG TCACGCCTTG GCACGTGTCC 120 It may take some time, please wait.
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Sequence Source | Ensembl | ||||||||||||||||||||||||
Keyword | KW-0156--Chromatin regulator |
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Interpro | IPR015947--PUA-like_domain |
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PROSITE | PS51015--YDG |
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Pfam | |||||||||||||||||||||||||
SMART | |||||||||||||||||||||||||
Gene Ontology | GO:0005720--C:nuclear heterochromatin |
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KEGG | ath:AT1G57800 | ||||||||||||||||||||||||
Orthology |
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Created Date | 25-Jun-2017 |