PTM - CPLM Gene Name UniProt ID Type Position Code TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Acetylation 266 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Acetylation 304 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Acetylation 340 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Acetylation 377 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Acetylation 770 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Acetylation 774 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Acetylation 31 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Sumoylation 750 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Sumoylation 779 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Sumoylation 554 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Sumoylation 575 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Sumoylation 676 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Sumoylation 804 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 127 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 254 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 261 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 272 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 304 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 319 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 337 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 340 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 365 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 366 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 377 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 400 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 407 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 434 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 469 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 750 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 770 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 774 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 779 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 31 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 238 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 213 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 266 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 296 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 275 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 289 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 390 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 507 K TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 Ubiquitination 575 K

PTM - dbPAF Gene Name UniProt ID Position Type Species TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 102 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 103 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 133 Y Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 138 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 14 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 140 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 17 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 19 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 242 Y Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 258 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 26 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 34 T Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 355 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 369 Y Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 37 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 4 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 41 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 415 T Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 417 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 418 T Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 43 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 437 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 439 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 440 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 449 Y Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 45 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 453 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 458 Y Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 459 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 460 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 466 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 471 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 473 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 479 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 489 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 49 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 498 T Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 50 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 501 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 514 T Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 517 Y Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 531 T Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 536 T Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 541 T Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 594 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 596 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 598 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 599 T Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 600 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 601 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 611 T Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 612 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 620 T Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 624 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 626 T Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 681 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 683 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 689 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 690 T Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 697 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 752 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 755 Y Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 756 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 757 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 784 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 803 T Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 816 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 823 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 824 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 828 S Homo sapiens(Human) TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B Q13263 9 S Homo sapiens(Human)

PTM - PhosSNP Gene Name dbSNP ID Gene Mutation AA Mutation Mutation Position Code Peptide Score Modification Type TRIM28; KAP1; RNF96; TIF1B rs11546267 AGC->AAC S->N 594 S AEGPRLASPSGSTSS 594 Phosphorylation TypeIII-

PTM - PhosphositePlus UniProt ID MOD_RSD Type SITE_+/-7_AA Q13263 K31-ac Acetylation EGsAGGEkRStAPsA Q13263 K188-ac Acetylation HQRVKYTkDHTVRST Q13263 K266-ac Acetylation LVkRLGDkHATLQkS Q13263 K289-ac Acetylation rQVsDVQkRVQVDVk Q13263 K304-ac Acetylation MAILQIMkELNkRGR Q13263 K340-ac Acetylation WTMTkIQkHQEHILR Q13263 K377-ac Acetylation FQLHRALkMIVDPVE Q13263 K469-ac Acetylation EPHVsGVkRsRsGEG Q13263 K575-ac Acetylation ATEGPETkPVLMALA Q13263 K770-ac Acetylation QDVGRMFkQFNkLTE Q13263 K774-ac Acetylation RMFkQFNkLTEDkAD Q13263 K779-ac Acetylation FNkLTEDkADVQsII Q13263 R282-m1 Methylation kEVRSsIrQVsDVQk Q13263 R427-m1 Methylation PAPMAPPrAPGPLsk Q13263 R790-m1 Methylation QsIIGLQrFFETRMN Q13263 S4-p Phosphorylation ____MAAsAAAAsAA Q13263 S9-p Phosphorylation AAsAAAAsAAAAsAA Q13263 S14-p Phosphorylation AAsAAAAsAAsGsPG Q13263 S17-p Phosphorylation AAAAsAAsGsPGPGE Q13263 S19-p Phosphorylation AAsAAsGsPGPGEGs Q13263 S26-p Phosphorylation sPGPGEGsAGGEkRS Q13263 T34-p Phosphorylation AGGEkRStAPsAAAS Q13263 S37-p Phosphorylation EkRStAPsAAASASA Q13263 S45-p Phosphorylation AAASASAsAAAssPA Q13263 S49-p Phosphorylation ASAsAAAssPAGGGA Q13263 S50-p Phosphorylation SAsAAAssPAGGGAE Q13263 Y133-p Phosphorylation SkDIVENyFMRDsGS Q13263 S138-p Phosphorylation ENyFMRDsGSKAATD Q13263 Y242-p Phosphorylation NAHkDHQyQFLEDAV Q13263 S258-p Phosphorylation NQRkLLAsLVkRLGD Q13263 S280-p Phosphorylation STkEVRSsIrQVsDV Q13263 S285-p Phosphorylation RSsIrQVsDVQkRVQ Q13263 S355-p Phosphorylation FASWALEsDNNTALL Q13263 Y369-p Phosphorylation LLSkkLIyFQLHRAL Q13263 S401-p Phosphorylation DLNAWTksAEAFGkI Q13263 S417-p Phosphorylation AERPGTNsTGPAPMA Q13263 S433-p Phosphorylation PrAPGPLskQGsGss Q13263 S437-p Phosphorylation GPLskQGsGssQPME Q13263 S439-p Phosphorylation LskQGsGssQPMEVQ Q13263 S440-p Phosphorylation skQGsGssQPMEVQE Q13263 Y449-p Phosphorylation PMEVQEGyGFGsGDD Q13263 S453-p Phosphorylation QEGyGFGsGDDPyss Q13263 Y458-p Phosphorylation FGsGDDPyssAEPHV Q13263 S459-p Phosphorylation GsGDDPyssAEPHVs Q13263 S460-p Phosphorylation sGDDPyssAEPHVsG Q13263 S466-p Phosphorylation ssAEPHVsGVkRsRs Q13263 S471-p Phosphorylation HVsGVkRsRsGEGEV Q13263 S473-p Phosphorylation sGVkRsRsGEGEVsG Q13263 S479-p Phosphorylation RsGEGEVsGLMRKVP Q13263 S489-p Phosphorylation MRKVPRVsLERLDLD Q13263 T498-p Phosphorylation ERLDLDLtADsQPPV Q13263 S501-p Phosphorylation DLDLtADsQPPVFkV Q13263 S512-p Phosphorylation VFkVFPGsTtEDyNL Q13263 T514-p Phosphorylation kVFPGsTtEDyNLIV Q13263 Y517-p Phosphorylation PGsTtEDyNLIVIER Q13263 T531-p Phosphorylation RGAAAAAtGQPGtAP Q13263 T536-p Phosphorylation AAtGQPGtAPAGtPG Q13263 T541-p Phosphorylation PGtAPAGtPGAPPLA Q13263 S594-p Phosphorylation AEGPRLAsPsGstss Q13263 S596-p Phosphorylation GPRLAsPsGstssGL Q13263 S598-p Phosphorylation RLAsPsGstssGLEV Q13263 T599-p Phosphorylation LAsPsGstssGLEVV Q13263 S600-p Phosphorylation AsPsGstssGLEVVA Q13263 S601-p Phosphorylation sPsGstssGLEVVAP Q13263 T611-p Phosphorylation EVVAPEGtsAPGGGP Q13263 S612-p Phosphorylation VVAPEGtsAPGGGPG Q13263 T620-p Phosphorylation APGGGPGtLDDsATI Q13263 S624-p Phosphorylation GPGtLDDsATICRVC Q13263 S681-p Phosphorylation DLKEEDGsLsLdGAD Q13263 S683-p Phosphorylation KEEDGsLsLdGADsT Q13263 S689-p Phosphorylation LsLdGADsTGVVAKL Q13263 S697-p Phosphorylation TGVVAKLsPANQRKC Q13263 S752-p Phosphorylation ARLQEkLsPPyssPQ Q13263 Y755-p Phosphorylation QEkLsPPyssPQEFA Q13263 S756-p Phosphorylation EkLsPPyssPQEFAQ Q13263 S757-p Phosphorylation kLsPPyssPQEFAQD Q13263 S784-p Phosphorylation EDkADVQsIIGLQrF Q13263 S816-p Phosphorylation LVEPPPMsLPGAGLs Q13263 S823-p Phosphorylation sLPGAGLssQELsGG Q13263 S824-p Phosphorylation LPGAGLssQELsGGP Q13263 S828-p Phosphorylation GLssQELsGGPGDGP Q13263 K31-sm Sumoylation EGsAGGEkRStAPsA Q13263 K188-sm Sumoylation HQRVKYTkDHTVRST Q13263 K199-sm Sumoylation VRSTGPAkSRDGERT Q13263 K254-sm Sumoylation DAVRNQRkLLAsLVk Q13263 K261-sm Sumoylation kLLAsLVkRLGDkHA Q13263 K319-sm Sumoylation VLVNDAQkVTEGQQE Q13263 K337-sm Sumoylation RQHWTMTkIQkHQEH Q13263 K366-sm Sumoylation TALLLSkkLIyFQLH Q13263 K377-sm Sumoylation FQLHRALkMIVDPVE Q13263 K434-sm Sumoylation rAPGPLskQGsGssQ Q13263 K469-sm Sumoylation EPHVsGVkRsRsGEG Q13263 K554-sm Sumoylation LAGMAIVkEEETEAA Q13263 K575-sm Sumoylation ATEGPETkPVLMALA Q13263 K750-sm Sumoylation IRARLQEkLsPPyss Q13263 K770-sm Sumoylation QDVGRMFkQFNkLTE Q13263 K774-sm Sumoylation RMFkQFNkLTEDkAD Q13263 K779-sm Sumoylation FNkLTEDkADVQsII Q13263 K804-sm Sumoylation NEAFGDTkFSAVLVE Q13263 K31-ub Ubiquitination EGsAGGEkRStAPsA Q13263 K127-ub Ubiquitination CKQQCFSkDIVENyF Q13263 K213-ub Ubiquitination TVYCNVHkHEPLVLF Q13263 K238-ub Ubiquitination DCQLNAHkDHQyQFL Q13263 K254-ub Ubiquitination DAVRNQRkLLAsLVk Q13263 K261-ub Ubiquitination kLLAsLVkRLGDkHA Q13263 K266-ub Ubiquitination LVkRLGDkHATLQkS Q13263 K272-ub Ubiquitination DkHATLQkSTkEVRS Q13263 K275-ub Ubiquitination ATLQkSTkEVRSsIr Q13263 K289-ub Ubiquitination rQVsDVQkRVQVDVk Q13263 K296-ub Ubiquitination kRVQVDVkMAILQIM Q13263 K304-ub Ubiquitination MAILQIMkELNkRGR Q13263 K308-ub Ubiquitination QIMkELNkRGRVLVN Q13263 K319-ub Ubiquitination VLVNDAQkVTEGQQE Q13263 K337-ub Ubiquitination RQHWTMTkIQkHQEH Q13263 K340-ub Ubiquitination WTMTkIQkHQEHILR Q13263 K365-ub Ubiquitination NTALLLSkkLIyFQL Q13263 K366-ub Ubiquitination TALLLSkkLIyFQLH Q13263 K377-ub Ubiquitination FQLHRALkMIVDPVE Q13263 K390-ub Ubiquitination VEPHGEMkFQWDLNA Q13263 K400-ub Ubiquitination WDLNAWTksAEAFGk Q13263 K407-ub Ubiquitination ksAEAFGkIVAERPG Q13263 K434-ub Ubiquitination rAPGPLskQGsGssQ Q13263 K469-ub Ubiquitination EPHVsGVkRsRsGEG Q13263 K507-ub Ubiquitination DsQPPVFkVFPGsTt Q13263 K575-ub Ubiquitination ATEGPETkPVLMALA Q13263 K750-ub Ubiquitination IRARLQEkLsPPyss Q13263 K770-ub Ubiquitination QDVGRMFkQFNkLTE Q13263 K774-ub Ubiquitination RMFkQFNkLTEDkAD Q13263 K779-ub Ubiquitination FNkLTEDkADVQsII Q13263 K804-ub Ubiquitination NEAFGDTkFSAVLVE

PTM - dbPTM UniProt ID Position Code Type Resources References Q13263 2 A Acetylation Swiss-Prot 1010711 19413330 Q13263 14 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 19413330 Q13263 17 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 19413330 Q13263 19 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 17081983;19007248;19413330 Q13263 26 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 19413330 Q13263 45 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 18220336 Q13263 49 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 18220336 Q13263 50 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 17081983;17924679;18220336;18669648 Q13263 258 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 18669648 Q13263 266 K Acetylation Swiss-Prot 1010711 19608861 Q13263 304 K Acetylation Swiss-Prot 1010711 19608861 Q13263 340 K Acetylation Swiss-Prot 1010711 19608861 Q13263 377 K Acetylation Swiss-Prot 1010711 19608861 Q13263 440 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 17525332 Q13263 466 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 17287340 Q13263 471 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 17287340;18669648 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PTM - Phospho.ELM UniProt Position Code PMIDs Kinase Source Type Q13263 752 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 471 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 471 S 17287340 HTP Phosphorylation Q13263 755 Y 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 19 S 17081983 HTP Phosphorylation Q13263 756 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 473 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 473 S 18220336 HTP Phosphorylation Q13263 473 S 17287340 HTP Phosphorylation Q13263 473 S 16964243 HTP Phosphorylation Q13263 473 S 17081983 HTP Phosphorylation Q13263 473 S 16083285 HTP Phosphorylation Q13263 473 S 15302935 HTP Phosphorylation Q13263 258 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 541 T 17287340 HTP Phosphorylation Q13263 541 T 16964243 HTP Phosphorylation Q13263 757 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 757 S 16964243 HTP Phosphorylation Q13263 624 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 45 S 18220336 HTP Phosphorylation Q13263 49 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 49 S 18220336 HTP Phosphorylation Q13263 50 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 50 S 18220336 HTP Phosphorylation Q13263 50 S 17081983 HTP Phosphorylation Q13263 437 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 439 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 824 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 824 S 17525332 HTP Phosphorylation Q13263 828 S 17081983 HTP Phosphorylation Q13263 823 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 440 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 440 S 17525332 HTP Phosphorylation Q13263 466 S 17287340 HTP Phosphorylation Q13263 596 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 598 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 599 T 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 600 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 601 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 611 T 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 489 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 594 S 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 594 S 17287340 HTP Phosphorylation Q13263 626 T 18669648 HTP Phosphorylation Q13263 501 S 17287340 HTP Phosphorylation Q13263 501 S 17525332 HTP Phosphorylation

PTM - UniProt UniProt ID Position Type PMIDs Q13263 2 N-acetylalanine 19413330;20068231;21406692;22223895;22814378 Q13263 19 Phosphoserine 20068231;21406692;23186163;24275569 Q13263 26 Phosphoserine 23186163 Q13263 50 Phosphoserine 18669648 Q13263 138 Phosphoserine 23186163 Q13263 304 N6-acetyllysine; alternate 19608861 Q13263 340 N6-acetyllysine 19608861 Q13263 377 N6-acetyllysine; alternate 19608861 Q13263 417 Phosphoserine 23186163 Q13263 439 Phosphoserine 18669648 Q13263 453 Phosphoserine 23186163 Q13263 471 Phosphoserine 18669648 Q13263 473 Phosphoserine 16964243;17081983;18669648;19690332;20068231;21406692;23186163 Q13263 479 Phosphoserine 21406692;23186163 Q13263 489 Phosphoserine 18669648;20068231;23186163 Q13263 498 Phosphothreonine 23186163 Q13263 501 Phosphoserine 17525332;19690332;23186163;24275569 Q13263 541 Phosphothreonine 16964243;20068231;23186163;24275569 Q13263 594 Phosphoserine 19690332;24275569 Q13263 683 Phosphoserine 21406692;24275569 Q13263 689 Phosphoserine 24275569 Q13263 697 Phosphoserine 20068231 Q13263 752 Phosphoserine 18669648;20068231;23186163 Q13263 757 Phosphoserine 16964243;18669648;20068231;23186163 Q13263 770 N6-acetyllysine; alternate 19608861 Q13263 774 N6-acetyllysine; alternate 19608861 Q13263 784 Phosphoserine 23186163

PTM - PHOSIDA Symbol Accession Code Position Surrounding Sequence Type TRIM28 IPI00438229 K 266 VKRLGDaKHATLQK acetylation TRIM28 IPI00438229 K 304 AILQIMaKELNKRG acetylation TRIM28 IPI00438229 K 340 TMTKIQaKHQEHIL acetylation TRIM28 IPI00438229 K 377 QLHRALaKMIVDPV acetylation TRIM28 IPI00438229 K 770 DVGRMFaKQFNKLT acetylation TRIM28 IPI00438229 K 774 MFKQFNaKLTEDKA acetylation TRIM28 IPI00438229 S 138 NYFMRDpSGSKAAT phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 19 ASAASGpSPGPGEG phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 258 QRKLLApSLVKRLG phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 471 VSGVKRpSRSGEGE phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 473 GVKRSRpSGEGEVS phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 489 RKVPRVpSLERLDL phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 50 ASAAASpSPAGGGA phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 594 EGPRLApSPSGSTS phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 601 PSGSTSpSGLEVVA phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 681 LKEEDGpSLSLDGA phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 683 EEDGSLpSLDGADS phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 697 GVVAKLpSPANQRK phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 756 KLSPPYpSSPQEFA phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 757 LSPPYSpSPQEFAQ phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 823 LPGAGLpSSQELSG phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 824 PGAGLSpSQELSGG phosphorylation TRIM28 IPI00438229 S 828 LSSQELpSGGPGDG phosphorylation TRIM28 IPI00438229 T 541 GTAPAGpTPGAPPL phosphorylation TRIM28 IPI00438229 T 803 NEAFGDpTKFSAVL phosphorylation

PTM - BioGRID Entrez Gene BioGRID ID Position Code Type PMIDs 10155 115457 - K Ubiquitination 22178446 10155 115457 - K Ubiquitination 22118674 10155 115457 - K Ubiquitination 17623298 10155 115457 - K Ubiquitination 18781797 10155 115457 - K Ubiquitination 21987572 10155 115457 - K Sumoylation 21693764 10155 115457 - K Ubiquitination 21963094 10155 115457 - K Ubiquitination 21139048 10155 115457 - K Ubiquitination 21890473 10155 115457 - K Ubiquitination 21906983 10155 115457 - K Sumoylation 19471022 10155 115457 - K Sumoylation 21252943 10155 115457 - K Sumoylation 18082607 10155 115457 - K Ubiquitination 20053985 10155 115457 - K Sumoylation 15576338 10155 115457 - K Ubiquitination 21853274 10155 115457 - K Ubiquitination 22505724 10155 115457 - K Ubiquitination 23000965 10155 115457 - K FAT10ylation 23862649 10155 115457 - K Neddylation 24654937 10155 115457 - K Sumoylation 24654937 10155 115457 - K Ubiquitination 24816145 10155 115457 - K Sumoylation 24278015 10155 115457 - K Sumoylation 24018422 10155 115457 - K Sumoylation 25027693 10155 115457 - K Ubiquitination 24907272 10155 115457 - K Sumoylation 24907272 10155 115457 - K Ubiquitination 25015289 10155 115457 - K Ubiquitination 25147182 10155 115457 - K Sumoylation 25391492 10155 115457 - K Sumoylation 21098080 10155 115457 - K Neddylation 18247557

PTM - mUbiSiDa Gene Name Species Ubiquitination Site Ubiquitination Sequence Evidence PMID TRIM28 Homo sapiens (Human) 275; 340; 272; 750; 337; 400; 469; 407; 261; 575; 266; 213; 390; 304; 238; 507; 434; 377; 319; 774; 289; 770; 296; 127; 365; 366; 779 "275,TLQKSTKEVRSSI; 340,TMTKIQKHQEHIL; 272,KHATLQKSTKEVR; 750,RARLQEKLSPPYS; 337,QHWTMTKIQKHQE; 400,DLNAWTKSAEAFG; 469,PHVSGVKRSRSGE; 407,SAEAFGKIVAERP; 261,LLASLVKRLGDKH; 575,TEGPETKPVLMAL; 266,VKRLGDKHATLQK; 213,VYCNVHKHEPLVL; 390,EPHGEMKFQWDLN; 304,AILQIMKELNKRG; 238,CQLNAHKDHQYQF; 507,SQPPVFKVFPGST; 434,APGPLSKQGSGSS; 377,QLHRALKMIVDPV; 319,LVNDAQKVTEGQQ; 774,MFKQFNKLTEDKA; 289,QVSDVQKRVQVDV; 770,DVGRMFKQFNKLT; 296,RVQVDVKMAILQI; 127,KQQCFSKDIVENY; 365,TALLLSKKLIYFQ; 366,ALLLSKKLIYFQL; 779,NKLTEDKADVQSI" "275:21906983; 340:21890473,21906983; 272:21890473,21906983; 750:21890473,21906983; 337:21890473; 400:21890473,21906983; 469:21890473,21906983; 407:21890473,21906983; 261:21906983; 575:21906983; 266:21906983; 213:21906983; 390:21906983; 304:21890473,21906983; 238:21906983; 507:21906983; 434:21890473,21906983; 377:21890473,21906983; 319:21890473,21906983; 774:21906983; 289:21906983; 770:21906983; 296:21906983; 127:21890473; 365:21906983; 366:21890473; 779:21906983" TRIM28 Homo sapiens (Human) 207; 283; 131; 193; 284; 258; 222; 325; 156; 697; 387; 692; 214; 688; 237; 308; 318; 425; 493; 668; 255; 184; 190; 352; 295; 179 "207,QVSDVQKRVQVDV; 283,TALLLSKKLIYFQ; 131,VYCNVHKHEPLVL; 193,TLQKSTKEVRSSI; 284,ALLLSKKLIYFQL; 258,TMTKIQKHQEHIL; 222,AILQIMKELNKRG; 325,SAEAFGKIVAERP; 156,CQLNAHKDHQYQF; 697,NKLTEDKADVQSI; 387,PHVSGVKRSRSGE; 692,MFKQFNKLTEDKA; 214,RVQVDVKMAILQI; 688,DVGRMFKQFNKLT; 237,LVNDAQKVTEGQQ; 308,EPHGEMKFQWDLN; 318,DLNAWTKSAEAFG; 425,SQPPVFKVFPGST; 493,TEGPETKPVLMAL; 668,RARLQEKLSPPYS; 255,QHWTMTKIQKHQE; 184,VKRLGDKHATLQK; 190,KHATLQKSTKEVR; 352,APGPLSKQGSGSS; 295,QLHRALKMIVDPV; 179,LLASLVKRLGDKH" "207:21906983; 283:21890473,21906983; 131:21906983; 193:21906983; 284:21890473; 258:21890473,21906983; 222:21890473,21906983; 325:21890473,21906983; 156:21906983; 697:21906983; 387:21890473,21906983; 692:21906983; 214:21906983; 688:21906983; 237:21890473,21906983; 308:21906983; 318:21890473,21906983; 425:21906983; 493:21906983; 668:21890473,21906983; 255:21890473; 184:21906983; 190:21890473,21906983; 352:21890473,21906983; 295:21890473,21906983; 179:21906983" TRIM28 Homo sapiens (Human) 304; 272; 340; 750; 337; 127; 366; 400; 434; 469; 377; 407; 319 "304,AILQIMKELNKRG; 272,KHATLQKSTKEVR; 340,TMTKIQKHQEHIL; 750,RARLQEKLSPPYS; 337,QHWTMTKIQKHQE; 127,KQQCFSKDIVENY; 366,ALLLSKKLIYFQL; 400,DLNAWTKSAEAFG; 434,APGPLSKQGSGSS; 469,PHVSGVKRSRSGE; 377,QLHRALKMIVDPV; 407,SAEAFGKIVAERP; 319,LVNDAQKVTEGQQ" 304:21890473; 272:21890473; 340:21890473; 750:21890473; 337:21890473; 127:21890473; 366:21890473; 400:21890473; 434:21890473; 469:21890473; 377:21890473; 407:21890473; 319:21890473