PTM - CPLM Gene Name UniProt ID Type Position Code UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 Ubiquitination 864 K UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 Ubiquitination 353 K UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 Ubiquitination 420 K UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 Ubiquitination 101 K UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 Ubiquitination 257 K UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 Ubiquitination 290 K UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 Ubiquitination 109 K

PTM - dbPAF Gene Name UniProt ID Position Type Species UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 1077 S Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 1079 Y Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 1081 S Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 1082 Y Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 116 S Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 130 Y Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 131 S Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 184 S Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 204 Y Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 214 Y Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 225 T Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 239 T Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 241 T Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 246 T Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 265 S Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 266 S Homo sapiens(Human) UBAP2L; KIAA0144; NICE4 Q14157 291 T Homo sapiens(Human) UBAP2L; 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PTM - PhosSNP Gene Name dbSNP ID Gene Mutation AA Mutation Mutation Position Code Peptide Score Modification Type UBAP2L; KIAA0144; NICE4 rs17849745 CAG->CAC Q->H 475 S PGSSDNQSSSPQPAQ 475 Phosphorylation TypeIII- UBAP2L; KIAA0144; NICE4 rs17849745 CAG->CAC Q->H 477 S SSDNQSSSPQPAQQK 477 Phosphorylation TypeIII-

PTM - PhosphositePlus UniProt ID MOD_RSD Type SITE_+/-7_AA Q14157 K612-ac Acetylation sIsssPQkDLtQAKN Q14157 R11-m1 Methylation SVGtNRArGNWEQPQ Q14157 R151-m1 Methylation ASRGREFrGQENGLD Q14157 R168-m1 Methylation KSGGPSGrGTErGrR Q14157 R172-m1 Methylation PSGrGTErGrRGRGR Q14157 R174-m1 Methylation GrGTErGrRGRGRGR Q14157 R187-m2 Methylation GRGGsGRrGGrFSAQ Q14157 R190-m2 Methylation GsGRrGGrFSAQGMG Q14157 K420-m1 Methylation AVHsPFtkRQAFtPs Q14157 R829-m1 Methylation DLQMLQTrFPLDyys Q14157 S445-gl O-GlcNAc KsPAVATstAAPPPP Q14157 T782-gl O-GlcNAc STRSSVAttSGKAPP Q14157 T783-gl O-GlcNAc TRSSVAttSGKAPPN Q14157 T7-p Phosphorylation _MMTSVGtNRArGNW Q14157 S43-p Phosphorylation IRLAQMIsDHNDADF Q14157 S95-p Phosphorylation EGNPDTHsWEMVGkK Q14157 S116-p Phosphorylation kDGGQTEsNEEGkEN Q14157 Y130-p Phosphorylation NRDRDRDysRRRGGP Q14157 S131-p Phosphorylation RDRDRDysRRRGGPP Q14157 S184-p Phosphorylation RGRGRGGsGRrGGrF Q14157 Y204-p Phosphorylation GTFNPADyAEPANTD Q14157 Y214-p Phosphorylation PANTDDNyGNSSGNT Q14157 T225-p Phosphorylation SGNTWNNtGHFEPDD Q14157 T239-p Phosphorylation DGTSAWRtAtEEWGt Q14157 T241-p Phosphorylation TSAWRtAtEEWGtED Q14157 T246-p Phosphorylation tAtEEWGtEDWNEDL Q14157 S254-p Phosphorylation EDWNEDLsETKIFTA Q14157 S262-p Phosphorylation ETKIFTAsNVSsVPL Q14157 S266-p Phosphorylation FTAsNVSsVPLPAEN Q14157 S334-p Phosphorylation PASGNTFsHHSMVSM Q14157 S356-p Phosphorylation VGEAkGGsTTGsQFL Q14157 S360-p Phosphorylation kGGsTTGsQFLEQFK Q14157 S380-p Phosphorylation AQLAAQHsQsGSTTT Q14157 S382-p Phosphorylation LAAQHsQsGSTTTSs Q14157 S389-p Phosphorylation sGSTTTSsWDMGSTT Q14157 S398-p Phosphorylation DMGSTTQsPsLVQyD Q14157 S400-p Phosphorylation GSTTQsPsLVQyDLK Q14157 Y404-p Phosphorylation QsPsLVQyDLKNPsD Q14157 S410-p Phosphorylation QyDLKNPsDsAVHsP Q14157 S412-p Phosphorylation DLKNPsDsAVHsPFt Q14157 S416-p Phosphorylation PsDsAVHsPFtkRQA Q14157 T419-p Phosphorylation sAVHsPFtkRQAFtP Q14157 T425-p Phosphorylation FtkRQAFtPsstMME Q14157 S427-p Phosphorylation kRQAFtPsstMMEVF Q14157 S428-p Phosphorylation RQAFtPsstMMEVFL Q14157 T429-p Phosphorylation QAFtPsstMMEVFLQ Q14157 S439-p Phosphorylation EVFLQEKsPAVATst Q14157 T446-p Phosphorylation sPAVATstAAPPPPs Q14157 S453-p Phosphorylation tAAPPPPssPLPsKs Q14157 S454-p Phosphorylation AAPPPPssPLPsKst Q14157 S458-p Phosphorylation PPssPLPsKstsAPQ Q14157 S460-p Phosphorylation ssPLPsKstsAPQMs Q14157 T461-p Phosphorylation sPLPsKstsAPQMsP Q14157 S462-p Phosphorylation PLPsKstsAPQMsPG Q14157 S467-p Phosphorylation stsAPQMsPGssDNQ Q14157 S470-p Phosphorylation APQMsPGssDNQsss Q14157 S471-p Phosphorylation PQMsPGssDNQsssP Q14157 S475-p Phosphorylation PGssDNQsssPQPAQ Q14157 S476-p Phosphorylation GssDNQsssPQPAQQ Q14157 S477-p Phosphorylation ssDNQsssPQPAQQK Q14157 S493-p Phosphorylation KQQKKKAsLtsKIPA Q14157 T495-p Phosphorylation QKKKAsLtsKIPALA Q14157 S496-p Phosphorylation KKKAsLtsKIPALAV Q14157 Y571-p Phosphorylation NQSQESGyQsGPIQS Q14157 S573-p Phosphorylation SQESGyQsGPIQSTT Q14157 Y581-p Phosphorylation GPIQSTTyTSQNNAQ Q14157 Y592-p Phosphorylation NNAQGPLyEQRSTQT Q14157 Y602-p Phosphorylation RSTQTRRyPssIsss Q14157 S604-p Phosphorylation TQTRRyPssIsssPQ Q14157 S605-p Phosphorylation QTRRyPssIsssPQk Q14157 S607-p Phosphorylation RRyPssIsssPQkDL Q14157 S608-p Phosphorylation RyPssIsssPQkDLt Q14157 S609-p Phosphorylation yPssIsssPQkDLtQ Q14157 T615-p Phosphorylation ssPQkDLtQAKNGFS Q14157 S634-p Phosphorylation TQLQTTQsVEGATGS Q14157 T713-p Phosphorylation SSTSSGRtsTSTLLH Q14157 S714-p Phosphorylation STSSGRtsTSTLLHT Q14157 S732-p Phosphorylation SEANLHSsSSTFSTT Q14157 S740-p Phosphorylation SSTFSTTsSTVSAPP Q14157 Y803-p Phosphorylation PPLLPNPyIMAPGLL Q14157 Y813-p Phosphorylation APGLLHAyPPQVYGy Q14157 Y820-p Phosphorylation yPPQVYGyDDLQMLQ Q14157 Y834-p Phosphorylation QTrFPLDyysIPFPt Q14157 Y835-p Phosphorylation TrFPLDyysIPFPtP Q14157 S836-p Phosphorylation rFPLDyysIPFPtPt Q14157 T841-p Phosphorylation yysIPFPtPttPLtG Q14157 T843-p Phosphorylation sIPFPtPttPLtGRd Q14157 T844-p Phosphorylation IPFPtPttPLtGRdG Q14157 T847-p Phosphorylation PtPttPLtGRdGsLA Q14157 S852-p Phosphorylation PLtGRdGsLAsNPys Q14157 S855-p Phosphorylation GRdGsLAsNPysGDL Q14157 Y858-p Phosphorylation GsLAsNPysGDLtkF Q14157 S859-p Phosphorylation sLAsNPysGDLtkFG Q14157 T863-p Phosphorylation NPysGDLtkFGRGDA Q14157 S992-p Phosphorylation VYSKTQQsFEKQGFH Q14157 S1077-p Phosphorylation QkPQTNKsAyNsySW Q14157 Y1079-p Phosphorylation PQTNKsAyNsySWGA Q14157 S1081-p Phosphorylation TNKsAyNsySWGAN_ Q14157 Y1082-p Phosphorylation NKsAyNsySWGAN__ Q14157 K101-ub Ubiquitination HsWEMVGkKKGVSGQ Q14157 K109-ub Ubiquitination KKGVSGQkDGGQTEs Q14157 K121-ub Ubiquitination TEsNEEGkENRDRDR Q14157 K353-ub Ubiquitination FGDVGEAkGGsTTGs Q14157 K420-ub Ubiquitination AVHsPFtkRQAFtPs Q14157 K864-ub Ubiquitination PysGDLtkFGRGDAS Q14157 K1071-ub Ubiquitination QTSSIPQkPQTNKsA

PTM - dbPTM UniProt ID Position Code Type Resources References Q14157 1 M Acetylation Swiss-Prot 1010711 19413330 Q14157 360 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 17525332 Q14157 416 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 17287340;17924679;18669648;18691976;19007248 Q14157 419 T Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 17081983;17287340 Q14157 439 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 18669648;19413330 Q14157 453 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 16964243;19369195;19413330 Q14157 454 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 15302935;16964243;18669648;18691976;19369195;19413330;19690332 Q14157 458 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 19413330 Q14157 460 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 19413330 Q14157 461 T Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 19413330 Q14157 462 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 19413330 Q14157 467 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 15302935;18669648;18691976;19369195;19413330 Q14157 470 S Phosphorylation Swiss-Prot 1010711 18669648;19369195;19413330;19690332 Q14157 471 S 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PTM - Phospho.ELM UniProt Position Code PMIDs Kinase Source Type Q14157 416 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 416 S 17287340 HTP Phosphorylation Q14157 852 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 439 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 605 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 605 S 16083285 HTP Phosphorylation Q14157 604 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 419 T 17287340 HTP Phosphorylation Q14157 419 T 17081983 HTP Phosphorylation Q14157 835 Y 15592455 HTP Phosphorylation Q14157 467 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 834 Y 16094384 HTP Phosphorylation Q14157 475 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 844 T 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 844 T 18220336 HTP Phosphorylation Q14157 453 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 453 S 16964243 HTP Phosphorylation Q14157 843 T 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 454 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 454 S 16964243 HTP Phosphorylation Q14157 471 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 608 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 470 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 607 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 607 S 16083285 HTP Phosphorylation Q14157 607 S 15144186 HTP Phosphorylation Q14157 859 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 477 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 476 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 360 S 17525332 HTP Phosphorylation Q14157 609 S 18669648 HTP Phosphorylation Q14157 609 S 17081983 HTP Phosphorylation Q14157 609 S 16083285 HTP Phosphorylation Q14157 609 S 15144186 HTP Phosphorylation

PTM - UniProt UniProt ID Position Type PMIDs Q14157 1 N-acetylmethionine 19413330;22814378 Q14157 187 Asymmetric dimethylarginine 24129315 Q14157 190 Asymmetric dimethylarginine 24129315 Q14157 356 Phosphoserine 23186163 Q14157 360 Phosphoserine 23186163 Q14157 410 Phosphoserine 23186163 Q14157 416 Phosphoserine 15144186;17924679;18669648;18691976;20068231;21406692;23186163 Q14157 425 Phosphothreonine 20068231 Q14157 439 Phosphoserine 18669648;18691976;20068231 Q14157 454 Phosphoserine 16964243;18669648;19690332;20068231;23186163 Q14157 467 Phosphoserine 18669648;18691976;19369195;21406692 Q14157 470 Phosphoserine 19690332 Q14157 471 Phosphoserine 18669648 Q14157 477 Phosphoserine 18669648;19690332;21406692;23186163 Q14157 604 Phosphoserine 23186163 Q14157 605 Phosphoserine 18669648;23186163 Q14157 608 Phosphoserine 18669648;23186163 Q14157 609 Phosphoserine 18669648;20068231;21406692;23186163;24275569 Q14157 852 Phosphoserine 18669648;23186163 Q14157 859 Phosphoserine 18669648;19690332;23186163

PTM - PHOSIDA Symbol Accession Code Position Surrounding Sequence Type UBAP2L IPI00029019 K 978 KYPPPYaKHFWTAE acetylation UBAP2L IPI00029019 S 321 PLVFSNpSKQTAIS phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 362 GGSTTGpSQFLEQF phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 414 LKNPSDpSAVHSPF phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 418 SDSAVHpSPFTKRQ phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 429 RQAFTPpSSTMMEV phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 441 VFLQEKpSPAVATS phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 455 AAPPPPpSSPLPSK phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 456 APPPPSpSPLPSKS phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 469 TSAPQMpSPGSSDN phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 472 PQMSPGpSSDNQSS phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 478 SSDNQSpSSPQPAQ phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 479 SDNQSSpSPQPAQQ phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 495 QQKKKApSLTSKIP phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 498 KKASLTpSKIPALA phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 606 QTRRYPpSSISSSP phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 607 TRRYPSpSISSSPQ phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 609 RYPSSIpSSSPQKD phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 610 YPSSISpSSPQKDL phosphorylation UBAP2L IPI00029019 S 611 PSSISSpSPQKDLT phosphorylation UBAP2L IPI00029019 T 421 AVHSPFpTKRQAFT phosphorylation UBAP2L IPI00029019 T 427 TKRQAFpTPSSTMM phosphorylation

PTM - BioGRID Entrez Gene BioGRID ID Position Code Type PMIDs 9898 115227 - K Ubiquitination 21987572 9898 115227 - K Ubiquitination 21139048 9898 115227 - K Ubiquitination 21890473 9898 115227 - K Ubiquitination 21906983 9898 115227 - K Ubiquitination 22505724 9898 115227 - K Ubiquitination 21963094 9898 115227 - K Ubiquitination 22053931 9898 115227 - K Ubiquitination 23000965 9898 115227 - K Ubiquitination 24816145 9898 115227 - K Ubiquitination 25015289 9898 115227 - K Ubiquitination 25147182

PTM - mUbiSiDa Gene Name Species Ubiquitination Site Ubiquitination Sequence Evidence PMID UBAP2L Homo sapiens (Human) 105 "105,YSGDLTKFGRGDA" 105:21890473 UBAP2L Homo sapiens (Human) 864 "864,YSGDLTKFGRGDA" 864:21906983 UBAP2L Homo sapiens (Human) 864 "864,YSGDLTKFGRGDA" 864:21890473 UBAP2L Homo sapiens (Human) 864; 976 "864,YSGDLTKFGRGDA; 976,KYPPPYKHFWTAE" 864:21890473; 976:21890473 UBAP2L Homo sapiens (Human) 431; 364; 875 "431,VHSPFTKRQAFTP; 364,GDVGEAKGGSTTG; 875,YSGDLTKFGRGDA" 431:21906983; 364:21906983; 875:21906983 UBAP2L Homo sapiens (Human) 864 "864,YSGDLTKFGRGDA" 864:21890473 UBAP2L Homo sapiens (Human) 105 "105,YSGDLTKFGRGDA" 105:21890473 UBAP2L Homo sapiens (Human) 864; 976 "864,YSGDLTKFGRGDA; 976,KYPPPYKHFWTAE" 864:21890473; 976:21890473 UBAP2L Homo sapiens (Human) 969; 857 "969,KYPPPYKHFWTAE; 857,YSGDLTKFGRGDA" 969:21890473; 857:21890473 UBAP2L Homo sapiens (Human) 864; 353; 420 "864,YSGDLTKFGRGDA; 353,GDVGEAKGGSTTG; 420,VHSPFTKRQAFTP" "864:21890473,21906983; 353:21906983; 420:21906983" UBAP2L Homo sapiens (Human) 864; 353; 420 "864,YSGDLTKFGRGDA; 353,GDVGEAKGGSTTG; 420,VHSPFTKRQAFTP" "864:21890473,21906983; 353:21906983; 420:21906983"