PTM - CPLM Gene Name UniProt ID Type Position Code DDB1; XAP1 Q16531 Acetylation 153 K DDB1; XAP1 Q16531 Acetylation 1067 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 1121 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 1131 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 70 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 141 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 153 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 191 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 204 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 298 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 484 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 570 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 579 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 857 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 917 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 936 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 1067 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 92 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 383 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 491 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 823 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 200 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 628 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 74 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 723 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 1081 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 60 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 864 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 867 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 897 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 150 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 254 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 915 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 1104 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 287 K DDB1; XAP1 Q16531 Ubiquitination 844 K

PTM - dbPAF Gene Name UniProt ID Position Type Species DDB1; XAP1 Q16531 1101 S Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 1125 T Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 1137 T Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 116 S Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 118 T Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 193 Y Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 196 S Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 294 T Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 296 T Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 3 Y Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 42 Y Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 633 T Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 636 T Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 640 T Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 643 S Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 645 S Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 646 T Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 660 Y Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 669 S Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 718 Y Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 720 S Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 755 S Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 757 S Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 763 S Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 764 S Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 781 S Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 8 T Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 84 Y Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 854 S Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 860 T Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 871 Y Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 887 T Homo sapiens(Human) DDB1; XAP1 Q16531 91 Y Homo sapiens(Human)

PTM - PhosphositePlus UniProt ID MOD_RSD Type SITE_+/-7_AA Q16531 K74-ac Acetylation FRPkGESkDLLFILt Q16531 K153-ac Acetylation DrDNkELkAFNIRLE Q16531 K383-ac Acetylation VTCSGAFkEGSLRII Q16531 K864-ac Acetylation kLQtVAEkEVKGAVy Q16531 K1067-ac Acetylation KVIKSVGkIEHSFWR Q16531 K1121-ac Acetylation YDDGSGMkREAtADD Q16531 R147-m1 Methylation FkVIPLDrDNkELkA Q16531 Y42-p Phosphorylation KNTRLEIyVVTAEGL Q16531 T81-p Phosphorylation kDLLFILtAKYNACI Q16531 S116-p Phosphorylation QDRIGRPsETGIIGI Q16531 Y182-p Phosphorylation APTICFVyQDPQGRH Q16531 Y193-p Phosphorylation QGRHVkTyEVsLREK Q16531 S196-p Phosphorylation HVkTyEVsLREKEFN Q16531 T294-p Phosphorylation kEEQMDGtVtLkDLR Q16531 T296-p Phosphorylation EQMDGtVtLkDLRVE Q16531 Y316-p Phosphorylation SIAECLTyLDNGVVF Q16531 T636-p Phosphorylation VTLGTQPtVLRtFRS Q16531 T640-p Phosphorylation TQPtVLRtFRSLstT Q16531 S645-p Phosphorylation LRtFRSLstTNVFAC Q16531 T646-p Phosphorylation RtFRSLstTNVFACS Q16531 Y660-p Phosphorylation SDRPTVIySSNHKLV Q16531 S669-p Phosphorylation SNHKLVFsNVNLKEV Q16531 T714-p Phosphorylation IQKLHIRtVPLyEsP Q16531 Y718-p Phosphorylation HIRtVPLyEsPRkIC Q16531 S720-p Phosphorylation RtVPLyEsPRkICYQ Q16531 S755-p Phosphorylation GTTALRPsASTQALS Q16531 S766-p Phosphorylation QALSSSVsSSKLFSS Q16531 S781-p Phosphorylation STAPHETsFGEEVEV Q16531 Y828-p Phosphorylation LGkDPNTyFIVGTAM Q16531 S854-p Phosphorylation RIVVFQYsDGkLQtV Q16531 T860-p Phosphorylation YsDGkLQtVAEkEVK Q16531 Y871-p Phosphorylation kEVKGAVySMVEFNG Q16531 S1101-p Phosphorylation IESFLDIsRPKMQEV Q16531 T1125-p Phosphorylation SGMkREAtADDLIkV Q16531 T1137-p Phosphorylation IkVVEELtRIH____ Q16531 K70-ub Ubiquitination VMELFRPkGESkDLL Q16531 K92-ub Ubiquitination NACILEYkQSGESID Q16531 K141-ub Ubiquitination RLYDGLFkVIPLDrD Q16531 K150-ub Ubiquitination IPLDrDNkELkAFNI Q16531 K153-ub Ubiquitination DrDNkELkAFNIRLE Q16531 K191-ub Ubiquitination DPQGRHVkTyEVsLR Q16531 K204-ub Ubiquitination LREKEFNkGPWKQEN Q16531 K254-ub Ubiquitination AIAPPIIkQSTIVCH Q16531 K287-ub Ubiquitination LFMLLLEkEEQMDGt Q16531 K298-ub Ubiquitination MDGtVtLkDLRVELL Q16531 K383-ub Ubiquitination VTCSGAFkEGSLRII Q16531 K484-ub Ubiquitination RLVSQEPkALVSEWk Q16531 K491-ub Ubiquitination kALVSEWkEPQAKNI Q16531 K570-ub Ubiquitination DISARILkLPSFELL Q16531 K579-ub Ubiquitination PSFELLHkEMLGGEI Q16531 K628-ub Ubiquitination GLLSDRKkVTLGTQP Q16531 K723-ub Ubiquitination PLyEsPRkICYQEVS Q16531 K823-ub Ubiquitination LVSCKLGkDPNTyFI Q16531 K857-ub Ubiquitination VFQYsDGkLQtVAEk Q16531 K864-ub Ubiquitination kLQtVAEkEVKGAVy Q16531 K897-ub Ubiquitination LYEWTTEkELRTECN Q16531 K917-ub Ubiquitination MALYLKTkGDFILVG Q16531 K936-ub Ubiquitination SVLLLAYkPMEGNFE Q16531 K1067-ub Ubiquitination KVIKSVGkIEHSFWR Q16531 K1081-ub Ubiquitination RSFHTERkTEPATGF Q16531 K1121-ub Ubiquitination YDDGSGMkREAtADD Q16531 K1131-ub Ubiquitination AtADDLIkVVEELtR

PTM - dbPTM UniProt ID Position Code Type Resources References Q16531 153 K Acetylation Swiss-Prot 1010711 19608861 Q16531 1067 K Acetylation Swiss-Prot 1010711 19608861 Q16531 1067 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21890473 Q16531 1081 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21906983 Q16531 1121 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 20639865;20972266;21890473;21906983 Q16531 1131 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 20639865;21890473 Q16531 141 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21890473;21906983 Q16531 153 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21890473;21906983 Q16531 191 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21890473;21906983 Q16531 204 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21890473 Q16531 287 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21906983 Q16531 298 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21890473;21906983 Q16531 484 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21890473 Q16531 491 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21906983 Q16531 570 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21890473 Q16531 579 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21890473;21906983 Q16531 70 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21906983 Q16531 823 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21906983 Q16531 857 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21890473;21906983 Q16531 864 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21906983 Q16531 897 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21906983 Q16531 917 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21890473;21906983 Q16531 92 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21906983 Q16531 936 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21890473;21906983 Q16531 1067 K Acetylation Phosphositeplus.1010730 19608861 Q16531 153 K Acetylation Phosphositeplus.1010730 19608861 Q16531 116 S Phosphorylation Phosphositeplus.1010730 21406692 Q16531 645 S Phosphorylation Phosphositeplus.1010730 19276368 Q16531 720 S Phosphorylation Phosphositeplus.1010730 22067460 Q16531 294 T Phosphorylation Phosphositeplus.1010730 21406692 Q16531 296 T Phosphorylation Phosphositeplus.1010730 21406692 Q16531 636 T Phosphorylation Phosphositeplus.1010730 20068231 Q16531 660 Y Phosphorylation Phosphositeplus.1010730 18083107 Q16531 84 Y Phosphorylation Phosphositeplus.1010730 18083107 Q16531 91 Y Phosphorylation Phosphositeplus.1010730 18083107 Q16531 153 K Acetylation HPRD 9.0 19608861 Q16531 1067 K Acetylation HPRD 9.0 19608861 Q16531 2 S Acetylation HPRD 9.0 19413330 Q16531 757 S Phosphorylation HPRD 9.0 20068231 Q16531 763 S Phosphorylation HPRD 9.0 20068231 Q16531 764 S Phosphorylation HPRD 9.0 20068231 Q16531 8 T Phosphorylation HPRD 9.0 20068231 Q16531 633 T Phosphorylation HPRD 9.0 20068231 Q16531 636 T Phosphorylation HPRD 9.0 20068231

PTM - HPRD Symbol Position Code Type References DDB1 1067 K Acetylation 19608861 DDB1 153 K Acetylation 19608861 DDB1 2 S Acetylation 19413330 DDB1 633 T Phosphorylation 20068231 DDB1 636 T Phosphorylation 20068231 DDB1 757 S Phosphorylation 20068231 DDB1 763 S Phosphorylation 20068231 DDB1 764 S Phosphorylation 20068231 DDB1 8 T Phosphorylation 20068231

PTM - UniProt UniProt ID Position Type PMIDs Q16531 2 N-acetylserine 19413330 Q16531 1067 N6-acetyllysine 19608861

PTM - PHOSIDA Symbol Accession Code Position Surrounding Sequence Type DDB1 IPI00293464 K 1067 VIKSVGaKIEHSFW acetylation DDB1 IPI00293464 K 153 RDNKELaKAFNIRL acetylation

PTM - BioGRID Entrez Gene BioGRID ID Position Code Type PMIDs 1642 108009 - K Neddylation 18274552 1642 108009 - K Ubiquitination 20639865 1642 108009 - K Ubiquitination 22118674 1642 108009 - K Ubiquitination 18781797 1642 108009 - K Ubiquitination 21987572 1642 108009 - K Ubiquitination 21963094 1642 108009 - K Ubiquitination 21139048 1642 108009 - K Ubiquitination 21890473 1642 108009 - K Ubiquitination 21906983 1642 108009 - K Ubiquitination 22505724 1642 108009 - K Neddylation 18247557 1642 108009 - K Ubiquitination 20972266 1642 108009 - K Ubiquitination 22053931 1642 108009 - K Ubiquitination 23000965 1642 108009 - K Ubiquitination 24816145 1642 108009 - K Sumoylation 25027693 1642 108009 - K Ubiquitination 25015289 1642 108009 - K Ubiquitination 25147182

PTM - mUbiSiDa Gene Name Species Ubiquitination Site Ubiquitination Sequence Evidence PMID DDB1 Homo sapiens (Human) 442; 168; 432; 247; 228; 378 "442,TADDLIKVVEELT; 168,FQYSDGKLQTVAE; 432,DDGSGMKREATAD; 247,VLLLAYKPMEGNF; 228,ALYLKTKGDFILV; 378,VIKSVGKIEHSFW" 442:21890473; 168:21890473; 432:21890473; 247:21890473; 228:21890473; 378:21890473 DDB1 Homo sapiens (Human) 23 "23,DGTVTLKDLRVEL" 23:21890473 DDB1 Homo sapiens (Human) 298; 287 "298,DGTVTLKDLRVEL; 287,FMLLLEKEEQMDG" 298:21906983; 287:21906983 DDB1 Homo sapiens (Human) 1067; 70; 823; 579; 141; 1131; 857; 917; 287; 1121; 864; 153; 1081; 191; 936; 491; 484; 92; 298; 570; 897 "1067,VIKSVGKIEHSFW; 70,MELFRPKGESKDL; 823,VSCKLGKDPNTYF; 579,SFELLHKEMLGGE; 141,LYDGLFKVIPLDR; 1131,TADDLIKVVEELT; 857,FQYSDGKLQTVAE; 917,ALYLKTKGDFILV; 287,FMLLLEKEEQMDG; 1121,DDGSGMKREATAD; 864,LQTVAEKEVKGAV; 153,RDNKELKAFNIRL; 1081,SFHTERKTEPATG; 191,PQGRHVKTYEVSL; 936,VLLLAYKPMEGNF; 491,ALVSEWKEPQAKN; 484,LVSQEPKALVSEW; 92,ACILEYKQSGESI; 298,DGTVTLKDLRVEL; 570,ISARILKLPSFEL; 897,YEWTTEKELRTEC" "1067:21890473; 70:21890473,21906983; 823:21906983; 579:21890473,21906983; 141:21890473,21906983; 1131:21890473; 857:21890473,21906983; 917:21890473,21906983; 287:21906983; 1121:21890473,21906983,21139048; 864:21906983; 153:21906983; 1081:21906983; 191:21890473,21906983; 936:21890473,21906983; 491:21906983; 484:21890473; 92:21906983; 298:21890473,21906983; 570:21890473; 897:21906983"