DNA & RNA Element - AREsite Gene Name Motif CDS Area ARE Area Evidence Nedd1; Nedd-1 ATTTA 107-2089 2217-2221;2550-2554;2554-2558;2700-2704;2914-2918;3182-3186;3494-3498 Coordinated posttranscriptional mRNA population dynamics during#Mol Syst Biol 2009; 5: 288.! Nedd1; Nedd-1 TTATTTATT 107-2089 2548-2556 Coordinated posttranscriptional mRNA population dynamics during#Mol Syst Biol 2009; 5: 288.! Nedd1; Nedd-1 WTATTTATW 107-2089 2548-2556;2912-2920 Coordinated posttranscriptional mRNA population dynamics during#Mol Syst Biol 2009; 5: 288.! Nedd1; Nedd-1 WWATTTAWW 107-2089 2548-2556;2912-2920 Coordinated posttranscriptional mRNA population dynamics during#Mol Syst Biol 2009; 5: 288.! Nedd1; Nedd-1 WWTATTTATWW 107-2089 2911-2921 Coordinated posttranscriptional mRNA population dynamics during#Mol Syst Biol 2009; 5: 288.! Nedd1; Nedd-1 WWWATTTAWWW 107-2089 2911-2921 Coordinated posttranscriptional mRNA population dynamics during#Mol Syst Biol 2009; 5: 288.! Nedd1; Nedd-1 WWWTATTTATWWW 107-2089 2910-2922 Coordinated posttranscriptional mRNA population dynamics during#Mol Syst Biol 2009; 5: 288.! Nedd1; Nedd-1 WWWWATTTAWWWW 107-2089 2910-2922 Coordinated posttranscriptional mRNA population dynamics during#Mol Syst Biol 2009; 5: 288.!

DNA & RNA Element - microRNA Mirbase Acc miRNA Name Gene ID Gene Symbol miRNA Alignment Alignment Gene Alignment miRNA Start miRNA End Gene Start Gene End Genome Coordinates Conservation Align Score Seed Cat Energy mirSVR Score MIMAT0004519 mmu-let-7g* 17997 Nedd1 cguuccgucACCGGACAUGUCa || :||||||| uugaaacuuUGCAUUGUACAGa 2 14 489 510 [mm9:10:92148426-92148447:-] 0.5753 145 7 -12.04 -1.1633 MIMAT0000129 mmu-miR-30a* 17997 Nedd1 cgaCGUUUGUAG-GCUGACUUuc | | || || : |||||| aaaGAAUACUUCAUAACUGAAuu 3 20 166 188 [mm9:10:92154361-92154383:-] 0.4917 130 0 -8.10 -0.1023 MIMAT0004526 mmu-miR-101a* 17997 Nedd1 cguagUCGUGACACUAUUGACu | :||| | ||||||| aaaagAAUACU-UCAUAACUGa 2 18 165 185 [mm9:10:92154364-92154384:-] 0.4917 151 7 -12.01 -1.0488 MIMAT0004526 mmu-miR-101a* 17997 Nedd1 cgUAGUCGUG-ACACUAUUGAcu | :||::: | | |||||| aaAAUAGUGUAUAUUAUAACU-- 3 21 268 288 [mm9:10:92154261-92154281:-] 0.4694 131 0 -5.39 -0.2789 MIMAT0004529 mmu-miR-125b* 17997 Nedd1 uccaggguucuuggACUGAACa ||||||| cuauggccgcauuaUGACUUGu 2 9 1211 1232 [mm9:10:92147704-92147725:-] 0.5863 140 7 -15.62 -0.3819 MIMAT0004529 mmu-miR-125b* 17997 Nedd1 ucCAGGGUUCUUGGACUGAAca ||:::: || |||||| auGUUUUGUAAA--UGACUUuu 3 21 269 288 [mm9:10:92148648-92148667:-] 0.5719 125 0 -8.03 -0.1358 MIMAT0004533 mmu-miR-141* 17997 Nedd1 agguugugacguGACCUUCUAc :|||||||| uuuuuuaaggguUUGGAAGAUu 2 11 557 578 [mm9:10:92148358-92148379:-] 0.5152 146 7 -12.55 -0.7263 MIMAT0000154 mmu-miR-142-5p 17997 Nedd1 ucaucacGAAAGAUGAAAUAc || | |||||||| aucucaaCUGUGUACUUUAUa 2 15 964 984 [mm9:10:92147952-92147972:-] 0.5732 154 7 -8.34 -0.9212 MIMAT0004534 mmu-miR-145* 17997 Nedd1 guucuugucauaaagGUCCUUa |||||| cuuguacuuacuaggCAGGAAa 2 8 49 70 [mm9:10:92154479-92154500:-] 0.5136 120 6 -8.27 -0.1134 MIMAT0004539 mmu-miR-183* 17997 Nedd1 aaUACCGGGAAGCCAUUAA-GUg || |:||| ||||| || ucAUUAACUUUCUCUAAUUACAg 2 21 760 782 [mm9:10:92148154-92148176:-] 0.5599 120 0 -7.70 -0.4501 MIMAT0000234 mmu-miR-201 17997 Nedd1 uucuuguuacggaaUGACUCAu ||||||| ucauggauuuaagcACUGAGUa 2 9 1399 1420 [mm9:10:92147516-92147537:-] 0.5863 140 7 -13.05 -0.9461 MIMAT0000240 mmu-miR-207 17997 Nedd1 cucccuccucucggUCCUCUUcg ||||||| acugaauuuuuuugAGGAGAAau 3 10 181 203 [mm9:10:92154346-92154368:-] 0.4917 125 0 -11.29 -0.1004 MIMAT0000240 mmu-miR-207 17997 Nedd1 cucccUCCUCUCGGUCCUC-UUCg || :|| |||||| ||| ccaaaAGUGGA-ACAGGAGUAAGa 2 19 1126 1148 [mm9:10:92147788-92147810:-] 0.5799 120 0 -16.84 -0.6643 MIMAT0000249 mmu-miR-30e* 17997 Nedd1 cgaCAUUUGUAG-GCUGACUUuc | | || || : |||||| aaaGAAUACUUCAUAACUGAAuu 3 20 166 188 [mm9:10:92154361-92154383:-] 0.4917 130 0 -7.75 -0.1023 MIMAT0000367 mmu-miR-291a-5p 17997 Nedd1 ucucucccGGAGGUGAAACUAc ||| ||||||||| ugcuggaaCCUACACUUUGAUa 2 15 888 909 [mm9:10:92148027-92148048:-] 0.5599 162 7 -16.84 -0.4841 MIMAT0004573 mmu-miR-293* 17997 Nedd1 guuuuacagugugucAAACUCa |||||| ucauaacugaauuuuUUUGAGg 2 8 176 197 [mm9:10:92154352-92154373:-] 0.4917 120 6 -6.27 -0.1039 MIMAT0004574 mmu-miR-294* 17997 Nedd1 ucuaucccggagguAAAACUCa ||||||| ucauaacugaauuuUUUUGAGg 2 9 176 197 [mm9:10:92154352-92154373:-] 0.4917 140 7 -6.67 -1.0267 MIMAT0004575 mmu-miR-295* 17997 Nedd1 cuucacacgggguguAAACUCa |||||| ucauaacugaauuuuUUUGAGg 2 8 176 197 [mm9:10:92154352-92154373:-] 0.4917 120 6 -6.94 -0.1039 MIMAT0000377 mmu-miR-299* 17997 Nedd1 uacauacacccugccAUUUGGu |||||| uguauuuaauaaauaUAAACCu 2 8 1090 1111 [mm9:10:92147825-92147846:-] 0.5668 120 6 -6.74 -0.1115 MIMAT0004620 mmu-let-7a* 17997 Nedd1 ccuuucugucaucuaACAUAUc |||||| guuaaauuaaaauagUGUAUAu 2 8 260 281 [mm9:10:92154268-92154289:-] 0.4694 120 6 -3.77 -0.4878 MIMAT0004621 mmu-let-7b* 17997 Nedd1 cccuuccgucauccaACAUAUc |||||| guuaaauuaaaauagUGUAUAu 2 8 260 281 [mm9:10:92154268-92154289:-] 0.4694 120 6 -3.69 -0.4946 MIMAT0004622 mmu-let-7c-1* 17997 Nedd1 ccUUUCGAUCUUCCAACAUGUc ||| :| | | ||||||| ugAAACUUUGCA--UUGUACAg 2 21 490 509 [mm9:10:92148427-92148446:-] 0.5753 149 7 -13.21 -0.6918 MIMAT0005439 mmu-let-7c-2* 17997 Nedd1 ccuuucugucaucuaACAUAUc |||||| guuaaauuaaaauagUGUAUAu 2 8 260 281 [mm9:10:92154268-92154289:-] 0.4694 120 6 -3.77 -0.4878 MIMAT0004623 mmu-let-7f* 17997 Nedd1 cccUUCCGUUAUCUAACAUAUc || :|| | | |||||| guuAAAUUAAAAUAGUGUAUAu 2 20 260 281 [mm9:10:92154268-92154289:-] 0.4694 127 6 -6.20 -0.4878 MIMAT0004624 mmu-miR-15a* 17997 Nedd1 acuccGUCGUGUCA----UACCGGAc |||:|: || ||||||| ggaauCAGUAUUGUUUGCAUGGCCUu 2 18 59 84 [mm9:10:92148852-92148877:-] 0.5631 148 7 -18.90 -0.4149 MIMAT0004627 mmu-miR-20a* 17997 Nedd1 gaaauucacgagcaUUACGUCa ||||||| ucaaacaacguuaaAAUGCAGa 2 9 1255 1276 [mm9:10:92147660-92147681:-] 0.5863 140 7 -11.81 -1.0223 MIMAT0004629 mmu-miR-22* 17997 Nedd1 auuUCGAA---CGGUGACUUCUUGa ||:|| :||||||||||| gccAGUUUUUAAUCACUGAAGAACa 2 20 89 113 [mm9:10:92154436-92154460:-] 0.5059 162 7 -21.05 -1.0472 MIMAT0000544 mmu-miR-129-3p 17997 Nedd1 uacgaaAAACC--CCA--UUCCCGAa ||||| | | ||||||| uaagggUUUGGAAGAUUCAAGGGCUa 2 17 562 587 [mm9:10:92148349-92148374:-] 0.5152 146 7 -14.92 -0.8998 MIMAT0000549 mmu-miR-322* 17997 Nedd1 cacaacgucgcGAAGUACAAa ||||||||| gaaagacucaaCUUCAUGUUu 2 11 229 249 [mm9:10:92154300-92154320:-] 0.4891 150 7 -13.23 -0.8904 MIMAT0000551 mmu-miR-323-3p 17997 Nedd1 ucUCCAGCUGGC-A-CAU-UACAc :|| :||||| | ||| |||| aaGGGGUGACCGCUGGUAUAUGUg 2 20 13 36 [mm9:10:92154513-92154536:-] 0.5212 125 0 -27.43 -0.8801 MIMAT0004640 mmu-miR-325 17997 Nedd1 aacuauccuccacgaGUUAUUu |||||| uuuaagcacugaguaCAAUAAa 2 8 1406 1427 [mm9:10:92147509-92147530:-] 0.5863 120 6 -5.89 -0.1216 MIMAT0004643 mmu-miR-331-5p 17997 Nedd1 ccUAGGGACCCUGGUAUG-GAUc || ||| | |:|||| ||| gaAUGCCUUAG-CUAUACACUAa 2 21 203 224 [mm9:10:92148712-92148733:-] 0.5631 122 0 -12.99 -0.5242 MIMAT0004647 mmu-miR-338-5p 17997 Nedd1 gugAGUCGUGGUCCUAUA-ACAa | | |:|::| |||| ||| gggUGACCGCUGGUAUAUGUGUc 2 20 16 38 [mm9:10:92154511-92154533:-] 0.5212 123 0 -9.83 -0.7541 MIMAT0004647 mmu-miR-338-5p 17997 Nedd1 guGAGUCGUGGUCCUAUAACAa || | :|::|| ||||||| aaCUAAAUAUUAGAAUAUUGUu 2 21 684 705 [mm9:10:92148231-92148252:-] 0.5152 164 7 -15.58 -0.6560 MIMAT0004647 mmu-miR-338-5p 17997 Nedd1 gugagucgugguccUAUAACAa ||||||| uucuauagguguauAUAUUGUg 2 9 1332 1353 [mm9:10:92147583-92147604:-] 0.5863 140 7 -8.61 -0.9050 MIMAT0000650 mmu-miR-17* 17997 Nedd1 gauguucacgggagUGACGUca |||||| auuuuuauauuaaaACUGCAca 3 9 134 155 [mm9:10:92148781-92148802:-] 0.5631 120 0 -10.41 -0.1652 MIMAT0004663 mmu-miR-200c* 17997 Nedd1 ggUUUGUGACGACC-CAUUCUGc ||::: | || ||||||| aaAAGUGGAACAGGAGUAAGACu 2 21 1128 1150 [mm9:10:92147786-92147808:-] 0.5799 147 7 -12.11 -0.3862 MIMAT0004668 mmu-miR-138* 17997 Nedd1 gggaccACAACACUUCAUCGGc | || | |:|||||| uccaaaUUUUUUUAGGUAGCCa 2 17 323 344 [mm9:10:92148592-92148613:-] 0.5807 140 6 -12.25 -0.2590 MIMAT0004670 mmu-miR-7a* 17997 Nedd1 auaCCGUCUGACACUAAACAAc |||| || ||||||||| cugGGCA-CCU-UGAUUUGUUa 2 20 6 25 [mm9:10:92148911-92148930:-] 0.5631 159 7 -15.52 -0.8813 MIMAT0004670 mmu-miR-7a* 17997 Nedd1 auaccgucugacacuAAACAAc |||||| caguuuaguaauuauUUUGUUa 2 8 415 436 [mm9:10:92148500-92148521:-] 0.5780 120 6 -3.90 -0.1869 MIMAT0000745 mmu-miR-380-3p 17997 Nedd1 uucuACACCUGGUAUGAUGUAu ||| | :||||||||| cuuuUGUCUA-UAUACUACAUu 2 19 1280 1300 [mm9:10:92147636-92147656:-] 0.5863 156 7 -13.25 -1.1290 MIMAT0001419 mmu-miR-433* 17997 Nedd1 cuuAUUACUGUCCGAGUGGCAu ||: |:| |||||||| gacUAGGGGC-UACUCACCGUu 2 20 916 936 [mm9:10:92148000-92148020:-] 0.5732 149 7 -19.95 -0.3429 MIMAT0002104 mmu-miR-463* 17997 Nedd1 uaCUACCUGUUGUUUA-AUCCAu ||| || |:: || ||||| cuGAUAGAGCAUGUAUAUAGGUa 2 21 1367 1389 [mm9:10:92147547-92147569:-] 0.5863 124 0 -10.94 -1.0896 MIMAT0002106 mmu-miR-465a-5p 17997 Nedd1 aguguagucacgguaaGAUUUAu |||||| aauuuucuuauacuaaCUAAAUa 2 8 670 692 [mm9:10:92148244-92148266:-] 0.5152 120 6 -8.77 -0.1498 MIMAT0004759 mmu-miR-466a-5p 17997 Nedd1 auacAUGUACAUGUGUGUGUAu |||| || ||||||| guauUACAGAUAACCACACAUc 2 19 140 161 [mm9:10:92154388-92154409:-] 0.5533 158 7 -13.09 -0.4307 MIMAT0002108 mmu-miR-467a-1* 17997 Nedd1 cacauccacacacaUACAUAUa :|||||| guuaaauuaaaauaGUGUAUAu 2 9 260 281 [mm9:10:92154268-92154289:-] 0.4694 124 6 -6.55 -0.4981 MIMAT0002108 mmu-miR-467a-1* 17997 Nedd1 cacauccacaCACAUACAUAUa | | ||||||| gggucugauaGAGCAUGUAUAu 2 13 1363 1384 [mm9:10:92147552-92147573:-] 0.5863 144 7 -9.62 -0.4769 MIMAT0003127 mmu-miR-484 17997 Nedd1 uagcccuccccuGA-CUCGGACu || ||||||| ugaagaacacuuCUGGAGCCUGu 2 11 105 127 [mm9:10:92154422-92154444:-] 0.5059 141 7 -16.79 -0.6264 MIMAT0003186 mmu-miR-369-3p 17997 Nedd1 uuUCU--AGUUGGUACAU--AAUAa ||| |||||::|||| |||| aaAGAUCUCAACUGUGUACUUUAUa 2 20 960 984 [mm9:10:92147952-92147976:-] 0.5732 122 0 -13.37 -0.7996 MIMAT0004788 mmu-miR-20b* 17997 Nedd1 gaucuucACGAGUGUGACGUca | :| | |||||| auuuuuaUAUUAAAACUGCAca 3 16 134 155 [mm9:10:92148781-92148802:-] 0.5631 127 0 -7.21 -0.1652 MIMAT0003189 mmu-miR-291b-5p 17997 Nedd1 ccucucccGGAGGUGAAACUAg ||| ||||||||| ugcuggaaCCUACACUUUGAUa 2 15 888 909 [mm9:10:92148027-92148048:-] 0.5599 162 7 -17.84 -0.4841 MIMAT0003373 mmu-miR-302b* 17997 Nedd1 ucuuucguaagggUACAAUUUca | |||||| uguuuaaacagaaAAGUUAAAuu 3 11 245 267 [mm9:10:92154282-92154304:-] 0.4792 122 0 -2.72 -0.1651 MIMAT0003375 mmu-miR-302c* 17997 Nedd1 cguccauuggggUACAAUUUcg | |||||| guuuaaacagaaAAGUUAAAuu 3 11 246 267 [mm9:10:92154282-92154303:-] 0.4792 122 0 -3.94 -0.1604 MIMAT0003376 mmu-miR-302c 17997 Nedd1 ggugACUUUGUACCUUCGUGAa | | : || ||||||| cuugUCAUGGAUUUAAGCACUg 2 19 1395 1416 [mm9:10:92147520-92147541:-] 0.5863 146 7 -17.04 -1.0455 MIMAT0003734 mmu-miR-667 17997 Nedd1 gaacccgacccaccGUCCACAgu :|||||| uuuccuuuuuucuaUAGGUGUau 3 10 1323 1345 [mm9:10:92147591-92147613:-] 0.5863 121 0 -9.95 -0.1090 MIMAT0003739 mmu-miR-673-5p 17997 Nedd1 gaGGUUCCUGGU-CUCGACACUc |:|| || : | ||||||| cuCUAAUUACAGUGUGCUGUGAa 2 21 771 793 [mm9:10:92148143-92148165:-] 0.5599 151 7 -19.85 -0.8221 MIMAT0003451 mmu-miR-677 17997 Nedd1 agucuUCGAUUAGUAGUGACUu ||:| | |||||||| augccAGUUUUUAAUCACUGAa 2 18 87 108 [mm9:10:92154441-92154462:-] 0.5059 157 7 -16.06 -1.0963 MIMAT0003451 mmu-miR-677 17997 Nedd1 agucuucgauuaguaGUGACUu |||||| ugucauggauuuaagCACUGAg 2 8 1397 1418 [mm9:10:92147518-92147539:-] 0.5863 120 6 -16.02 -0.1338 MIMAT0003464 mmu-miR-686 17997 Nedd1 agAAGUGGCAGACCCUUC-GUUa ||| : || |||||| ||| ucUUCCUAGU-GGGGAAGUCAAc 2 21 165 186 [mm9:10:92148750-92148771:-] 0.5631 122 0 -18.67 -0.4039 MIMAT0003469 mmu-miR-690 17997 Nedd1 aaaccAACACUCGGAUCGGAAa || | |:||||||| gcacuUUCUAUCCUUAGCCUUa 2 18 796 817 [mm9:10:92148119-92148140:-] 0.5599 149 7 -12.13 -1.0989 MIMAT0003470 mmu-miR-691 17997 Nedd1 aaAAGACGGA-GAGAAGUCCUUa || | |:| || |||||| ccUUGUACUUACUAGGCAGGAAa 2 21 48 70 [mm9:10:92154479-92154501:-] 0.5136 123 6 -13.02 -0.1134 MIMAT0003471 mmu-miR-692 17997 Nedd1 cucACUCCGCGA--GUUUCUCUa | | |:|:| :||||||| acuUUAAGUGUUUCUAAAGAGAu 2 19 1053 1075 [mm9:10:92147861-92147883:-] 0.5536 149 7 -14.52 -0.8046 MIMAT0004189 mmu-miR-693-3p 17997 Nedd1 aaugUCGGUGUAGACUUUC-GACg ||: || || ||||| ||| uccaAGUGAC-UCAGAAAGUCUGu 2 20 1153 1175 [mm9:10:92147761-92147783:-] 0.5799 125 0 -14.80 -0.3553 MIMAT0003474 mmu-miR-694 17997 Nedd1 gaaguccGUUGUAAAAGUc :|| ||||||| auuacuaUAAGAUUUUCAu 2 13 630 648 [mm9:10:92148288-92148306:-] 0.5152 148 7 -6.57 -0.4700 MIMAT0003474 mmu-miR-694 17997 Nedd1 gaaguccGUUG--UAAAAGUc |||: ||||||| cugaguaCAAUAAAUUUUCAc 2 13 1414 1434 [mm9:10:92147502-92147522:-] 0.5863 143 7 -6.25 -1.2123 MIMAT0003474 mmu-miR-694 17997 Nedd1 gaaguccGUUGUAAAAGuc :||:|||||| aaccuauUAAUAUUUUCcu 3 13 1303 1321 [mm9:10:92147615-92147633:-] 0.5863 132 0 -6.67 -0.1907 MIMAT0003478 mmu-miR-467b* 17997 Nedd1 cacaaccacacacaUACAUAUa :|||||| guuaaauuaaaauaGUGUAUAu 2 9 260 281 [mm9:10:92154268-92154289:-] 0.4694 124 6 -6.55 -0.4981 MIMAT0003478 mmu-miR-467b* 17997 Nedd1 caCA-ACCACACACAUACAUAUa || || | | | ||||||| ggGUCUGAU-AGAGCAUGUAUAu 2 21 1363 1384 [mm9:10:92147552-92147573:-] 0.5863 145 7 -10.04 -0.4769 MIMAT0003479 mmu-miR-669c 17997 Nedd1 ugUGUGUAGGUGUGUG-UUGAUa | |: |:| :|:|| ||||| ugAAAUUUUCUUAUACUAACUAa 2 21 667 689 [mm9:10:92148247-92148269:-] 0.5152 124 0 -8.71 -1.2261 MIMAT0003487 mmu-miR-697 17997 Nedd1 agagguGUCCU-GGUCCUACAa :| || ::||||||| auuuguUAUGAGUUAGGAUGUu 2 16 18 39 [mm9:10:92148897-92148918:-] 0.5631 146 7 -15.50 -0.6063 MIMAT0003493 mmu-miR-703 17997 Nedd1 aagaaaggaagacuUCCAAAa |||||| auguucauaagaauAGGUUUa 2 8 249 269 [mm9:10:92148667-92148687:-] 0.5631 120 6 -6.44 -0.1433 MIMAT0003494 mmu-miR-704 17997 Nedd1 gauccucgucucGUGUACAGa :||||||| aacaaguccccuUACAUGUCa 2 10 1233 1253 [mm9:10:92147683-92147703:-] 0.5863 141 7 -10.08 -0.8085 MIMAT0003496 mmu-miR-706 17997 Nedd1 aaaaaacucugucccAAAGAGa |||||| uuguguaucauuaacUUUCUCu 2 8 753 774 [mm9:10:92148162-92148183:-] 0.5599 120 6 -7.20 -0.1078 MIMAT0003497 mmu-miR-707 17997 Nedd1 gcauccguucgccgUACUGAc |||||| uuuauguuuuguaaAUGACUu 2 8 266 286 [mm9:10:92148650-92148670:-] 0.5719 120 6 -7.49 -0.1681 MIMAT0003506 mmu-miR-715 17997 Nedd1 gugcgcccccacacGUGCCUc |||||| uggcaacuauaauaCACGGAa 2 8 42 62 [mm9:10:92148874-92148894:-] 0.5631 120 6 -12.32 -0.1135 MIMAT0003510 mmu-miR-717 17997 Nedd1 ucucuuccaUAGAGACAGACuc |||| |||||| gccugucaaAUCU-UGUCUGua 3 14 122 142 [mm9:10:92154407-92154427:-] 0.5296 131 0 -12.02 -0.1012 MIMAT0003511 mmu-miR-450b-5p 17997 Nedd1 auaaguccuUGUAUGACGUUUu |||| ||||||| gauaaccacACAU-CUGCAAAa 2 14 148 168 [mm9:10:92154381-92154401:-] 0.5225 151 7 -13.10 -1.2296 MIMAT0003511 mmu-miR-450b-5p 17997 Nedd1 auAAGUCCUUGUAUGAC-GUUUu ||| |||:| ||| |||| acUUCUGGAGC---CUGUCAAAu 2 21 113 132 [mm9:10:92154417-92154436:-] 0.5059 120 0 -12.35 -0.3113 MIMAT0003511 mmu-miR-450b-5p 17997 Nedd1 auaaguccuuguaugACGUUUu |||||| aaugaauuuacuaugUGCAAAa 2 8 606 627 [mm9:10:92148309-92148330:-] 0.5152 120 6 -9.01 -0.1569 MIMAT0004238 mmu-miR-743a 17997 Nedd1 agauGAGUCGAACCACA-GAAAg |||| || |||| |||| agauCUCAACU--GUGUACUUUa 2 19 962 982 [mm9:10:92147954-92147974:-] 0.5732 123 0 -12.07 -0.9978 MIMAT0004841 mmu-miR-871 17997 Nedd1 guacugaccgugauuaGACUUAu |||||| aaagaauacuucauaaCUGAAUu 2 8 166 188 [mm9:10:92154361-92154383:-] 0.4917 120 6 -8.48 -0.1275 MIMAT0004841 mmu-miR-871 17997 Nedd1 guaCUGACCGUGAUUAGACUUAu ||: :|:| ||||||| cagGAUCUUUAUU-UUCUGAAUg 2 21 186 207 [mm9:10:92148729-92148750:-] 0.5631 142 7 -12.37 -0.5324 MIMAT0004843 mmu-miR-879* 17997 Nedd1 ggcuuUCGAACUUCGGUAUUcg ||| | | |||||| uccuuAGCCUUA--CCAUAAua 3 18 806 825 [mm9:10:92148111-92148130:-] 0.5599 126 0 -8.24 -0.1117 MIMAT0004843 mmu-miR-879* 17997 Nedd1 ggcUUUCGAACUU--C-GGUAUUCg |||| || | :|||||| cuaAAAGAAGAAAAUGUUCAUAAGa 2 20 236 260 [mm9:10:92148676-92148700:-] 0.5631 125 6 -10.40 -0.1215 MIMAT0004846 mmu-miR-881 17997 Nedd1 agauaagucuuuucuGUGUCAa |||||| gcaauuggauuuuuuCACAGUu 2 8 398 419 [mm9:10:92148517-92148538:-] 0.5807 120 6 -10.74 -0.1032 MIMAT0004856 mmu-miR-105 17997 Nedd1 ugguguUCGUAGACUCGU-GAACc || ||||:||| |||| ------AGACUCUGGGCACCUUGa 2 18 1 18 [mm9:10:92148918-92148935:-] 0.6925 129 0 -16.75 -1.1831 MIMAT0004871 mmu-miR-465b-5p 17997 Nedd1 gucuagucgugguaaGAUUUAu |||||| auuuucuuauacuaaCUAAAUa 2 8 671 692 [mm9:10:92148244-92148265:-] 0.5152 120 6 -8.64 -0.1498 MIMAT0004873 mmu-miR-465c-5p 17997 Nedd1 gucuagucgcgguaaGAUUUAu |||||| auuuucuuauacuaaCUAAAUa 2 8 671 692 [mm9:10:92148244-92148265:-] 0.5152 120 6 -6.34 -0.1512 MIMAT0004875 mmu-miR-466b-5p 17997 Nedd1 guacAUGUACAUGUGUGUGUAg |||| || ||||||| guauUACAGAUAACCACACAUc 2 19 140 161 [mm9:10:92154388-92154409:-] 0.5533 158 7 -17.31 -0.4307 MIMAT0004877 mmu-miR-466c-5p 17997 Nedd1 auacAUGUACGUGUGUGUGUAg |||| :| ||||||| guauUACAGAUAACCACACAUc 2 19 140 161 [mm9:10:92154388-92154409:-] 0.5533 154 7 -18.10 -0.4339 MIMAT0004879 mmu-miR-466e-5p 17997 Nedd1 auacAUGUACAUGUGUGUGUAg |||| || ||||||| guauUACAGAUAACCACACAUc 2 19 140 161 [mm9:10:92154388-92154409:-] 0.5533 158 7 -17.00 -0.4307 MIMAT0004882 mmu-miR-466f-3p 17997 Nedd1 cacacauacacacaCACAUAc |||||| guuaaauuaaaauaGUGUAUa 2 8 260 280 [mm9:10:92154269-92154289:-] 0.4694 120 6 -5.36 -0.2839 MIMAT0004882 mmu-miR-466f-3p 17997 Nedd1 caCACAUACACACACACAUAc |||||| | | ||||||| agGUGUAUAUAU-UGUGUAUu 2 20 1338 1357 [mm9:10:92147579-92147598:-] 0.5863 165 7 -13.61 -1.1088 MIMAT0004882 mmu-miR-466f-3p 17997 Nedd1 cacacAUACACACACACAUAc | ||||| ||||||| uuucuUCUGUGU-UGUGUAUc 2 17 742 761 [mm9:10:92148175-92148194:-] 0.5126 158 7 -12.48 -0.6306 MIMAT0004882 mmu-miR-466f-3p 17997 Nedd1 cacacauacacacaCACAUAc |||||| gccuuauuuauuuaGUGUAUa 2 8 456 476 [mm9:10:92148460-92148480:-] 0.5753 120 6 -5.36 -0.1842 MIMAT0004883 mmu-miR-466g 17997 Nedd1 acacacacguacACAGACAUa |||||||| ccugucaaaucuUGUCUGUAu 2 10 123 143 [mm9:10:92154406-92154426:-] 0.5296 145 7 -12.24 -1.0768 MIMAT0004885 mmu-miR-467c 17997 Nedd1 gugUAUAUG-UACGUG-CGUGAAu :|:|:| :|| || |||||| acaGUGUGCUGUGAACAGCACUUu 2 20 779 802 [mm9:10:92148134-92148157:-] 0.5599 126 6 -18.46 -0.2650 MIMAT0004887 mmu-miR-467d* 17997 Nedd1 cacauccacacacaUACAUAUa :|||||| guuaaauuaaaauaGUGUAUAu 2 9 260 281 [mm9:10:92154268-92154289:-] 0.4694 124 6 -6.55 -0.4981 MIMAT0004887 mmu-miR-467d* 17997 Nedd1 cacauccacaCACAUACAUAUa | | ||||||| gggucugauaGAGCAUGUAUAu 2 13 1363 1384 [mm9:10:92147552-92147573:-] 0.5863 144 7 -9.62 -0.4769 MIMAT0004893 mmu-miR-574-5p 17997 Nedd1 ugUGUGA-GUGUGUGUGUGUG-AGu ::|:| || |:| ||||| || cuGUAUUACAGAUAACCACACAUCu 2 22 138 162 [mm9:10:92154387-92154411:-] 0.5225 120 0 -13.85 -0.3531 MIMAT0004897 mmu-miR-654-5p 17997 Nedd1 uguguacaagacgucGAAUGGu |||||| cuuucuauccuuagcCUUACCa 2 8 799 820 [mm9:10:92148116-92148137:-] 0.5599 120 6 -12.68 -0.1386 MIMAT0004898 mmu-miR-654-3p 17997 Nedd1 uuccacuaccAGUC-GUCUGUAu || | ||||||| cuauuccaucUCUGUCAGACAUu 2 13 108 130 [mm9:10:92148806-92148828:-] 0.5631 143 7 -9.99 -1.0464 MIMAT0004933 mmu-miR-878-3p 17997 Nedd1 agaugggucacaccACAGUACg ||||||| auagguaaaacacuUGUCAUGg 2 9 1383 1404 [mm9:10:92147532-92147553:-] 0.5863 140 7 -9.94 -0.8420 MIMAT0004934 mmu-miR-872 17997 Nedd1 ggacuugauuguucAUUGGAa |||||| uauauacuacauuuUAACCUa 2 8 1288 1308 [mm9:10:92147628-92147648:-] 0.5863 120 6 -9.50 -0.3686 MIMAT0004938 mmu-miR-875-3p 17997 Nedd1 guAUCG-GAGUC-AUAAAAGUcc |:|| |::| | |||||| agUGGCAAUUGGAUUUUUUCAca 3 20 394 416 [mm9:10:92148520-92148542:-] 0.5807 129 0 -7.35 -0.1113 MIMAT0004938 mmu-miR-875-3p 17997 Nedd1 guaucggagucaUAAAAGUcc ||||||| ugaguacaauaaAUUUUCAca 3 10 1415 1435 [mm9:10:92147501-92147521:-] 0.5863 125 0 -4.66 -0.3509 MIMAT0004938 mmu-miR-875-3p 17997 Nedd1 guAUCGGAG---UCA--UAAAA-GUCc |:||||: ||| ||||| ||| caUGGCCUUGAAAGUGGAUUUUGCAGc 2 20 76 102 [mm9:10:92148834-92148860:-] 0.5631 121 0 -16.78 -0.3320 MIMAT0005291 mmu-miR-582-5p 17997 Nedd1 ucauugaccaacuuGUUGACAu ||||||| uugcccaaagaucuCAACUGUg 2 9 954 975 [mm9:10:92147961-92147982:-] 0.5732 140 7 -11.65 -0.6739 MIMAT0005292 mmu-miR-582-3p 17997 Nedd1 aacccaagucaacaAGUUGUCc ||||||| uccuaguggggaagUCAACAGg 2 9 168 189 [mm9:10:92148747-92148768:-] 0.5631 140 7 -20.74 -0.1472 MIMAT0005294 mmu-miR-467e* 17997 Nedd1 uauauccacacacaUACAUAUa :|||||| guuaaauuaaaauaGUGUAUAu 2 9 260 281 [mm9:10:92154268-92154289:-] 0.4694 124 6 -6.55 -0.4981 MIMAT0005294 mmu-miR-467e* 17997 Nedd1 uaUAUCCACAC-A---CAUACAUAUa | :||| || | | ||||||| aaAAGGGUCUGAUAGAGCAUGUAUAu 2 21 1359 1384 [mm9:10:92147552-92147577:-] 0.5863 146 7 -10.45 -0.4769 MIMAT0005830 mmu-miR-466l 17997 Nedd1 uuaUACACACGUACAUAAAUAu | || ||| | ||||||| aucAGGUAUGCCU-UAUUUAUu 2 20 447 467 [mm9:10:92148469-92148489:-] 0.5753 157 7 -7.61 -0.5844 MIMAT0005830 mmu-miR-466l 17997 Nedd1 uuauacacacGUA-CAUAAAUAu ||| ||||||| uuagccuuacCAUAAUAUUUAUa 2 13 809 831 [mm9:10:92148105-92148127:-] 0.5599 143 7 -5.37 -1.1312 MIMAT0005830 mmu-miR-466l 17997 Nedd1 uuaUACACAC-GUACAUAAAUAu || | || || |||||| uccAUCUCUGUCAGACAUUUAUa 2 20 112 134 [mm9:10:92148802-92148824:-] 0.5631 122 6 -6.14 -0.1061 MIMAT0005836 mmu-miR-1186 17997 Nedd1 guACGGAAAUUAAGGUCGUGAg |||: | || ||||||| ugUGCUGUGAA---CAGCACUu 2 21 783 801 [mm9:10:92148135-92148153:-] 0.5599 148 7 -15.98 -0.2176 MIMAT0005836 mmu-miR-1186 17997 Nedd1 guACGGAAAUUAAGGUCGUGAg ||:| | :|||: |||||| cuUGUCAUGGAUUUAAGCACUg 2 21 1395 1416 [mm9:10:92147520-92147541:-] 0.5863 140 6 -13.30 -0.1097 MIMAT0005837 mmu-miR-1187 17997 Nedd1 aauGUGUGUAUGUGUGUGUGUAu :||| ||| || ||||||| uauUACAGAUA-AC-CACACAUc 2 21 141 161 [mm9:10:92154388-92154408:-] 0.5533 160 7 -16.59 -0.4031 MIMAT0005839 mmu-miR-669f 17997 Nedd1 uaugcacacacacaUACAUAUAc :||||||| guuaaauuaaaauaGUGUAUAUu 2 10 260 282 [mm9:10:92154267-92154289:-] 0.4694 141 7 -5.95 -1.1854 MIMAT0005839 mmu-miR-669f 17997 Nedd1 uaugCACAC-A-CACAUACAUAUAc || || | | | |||||||| aaggGUCUGAUAGAGCAUGUAUAUa 2 20 1361 1385 [mm9:10:92147551-92147575:-] 0.5863 153 7 -6.70 -0.9092 MIMAT0005839 mmu-miR-669f 17997 Nedd1 uauGCACACACACAU-ACAUAUAc | | | | | || ||||||| ugcCUUAUUUAUUUAGUGUAUAUg 2 21 455 478 [mm9:10:92148458-92148481:-] 0.5753 151 7 -10.37 -0.6005 MIMAT0005839 mmu-miR-669f 17997 Nedd1 uauGCACACACACAU--ACAUAUAc | | | | | || ||||||| uucCUUUUUUCUAUAGGUGUAUAUa 2 21 1324 1348 [mm9:10:92147588-92147612:-] 0.5863 147 7 -6.01 -0.9422 MIMAT0005846 mmu-miR-467f 17997 Nedd1 acauccacacacaCACAUAUa ||||||| uuaaauuaaaauaGUGUAUAu 2 9 261 281 [mm9:10:92154268-92154288:-] 0.4694 140 7 -8.77 -1.3201 MIMAT0005846 mmu-miR-467f 17997 Nedd1 acauccACACACACACAUAUa | | | ||||||| cuuuuuUCUAUAGGUGUAUAu 2 16 1327 1347 [mm9:10:92147589-92147609:-] 0.5863 143 7 -8.94 -0.9167 MIMAT0005846 mmu-miR-467f 17997 Nedd1 acauccACACACA-CACAUAUa | | | | ||||||| gccuuaUUUAUUUAGUGUAUAu 2 16 456 477 [mm9:10:92148459-92148480:-] 0.5753 142 7 -8.77 -0.9961 MIMAT0005849 mmu-miR-1191 17997 Nedd1 auCCCGAUGU-AUCAUUCUGAc | | ||| ||||||||| aaGUGGAACAGGAGUAAGACUu 2 20 1130 1151 [mm9:10:92147785-92147806:-] 0.5799 154 7 -19.30 -0.2723 MIMAT0005860 mmu-miR-1199 17997 Nedd1 ggcgcgcuggCCCUGAGUCu | ||||||| acuuuuccaaGUGACUCAGa 2 11 1148 1167 [mm9:10:92147769-92147788:-] 0.5799 142 7 -16.49 -1.0223 MIMAT0007864 mmu-miR-1897-5p 17997 Nedd1 gggggagaaagagguAGGUUUc |||||| auggacaaauuguauUCCAAAu 2 8 308 329 [mm9:10:92148607-92148628:-] 0.5807 120 6 -5.88 -0.1256 MIMAT0007873 mmu-miR-1896 17997 Nedd1 gaggagUGGGUGGUA-GUCUCUc :::||:||| |||||| auaaagGUUCAUCAUGCAGAGAa 2 17 829 851 [mm9:10:92148085-92148107:-] 0.5599 128 6 -18.12 -0.7837 MIMAT0007876 mmu-miR-1907 17997 Nedd1 uggaGGU-CUAGGAGAC-GACGAg ||: | || |||| ||||| cuggCCGUGUUCAUCUGCCUGCUg 2 19 869 892 [mm9:10:92148044-92148067:-] 0.5599 125 0 -20.16 -0.1572 MIMAT0009391 mmu-miR-1928 17997 Nedd1 cucgaccgUUACAUCGa |||||||| uuuacuaaAAUGUAGCu 2 10 1026 1042 [mm9:10:92147894-92147910:-] 0.5634 145 7 -13.26 -1.0694 MIMAT0009399 mmu-miR-1935 17997 Nedd1 ucUCUAGG--CGGUCGGAG-ACGGa | ||:| |:| ||||| |||| uuAUAUUCUUGUC-GCCUCUUGCCc 2 21 936 959 [mm9:10:92147977-92148000:-] 0.5732 121 0 -20.98 -0.5760 MIMAT0009405 mmu-miR-1941-5p 17997 Nedd1 uucGGAGACAUGGUCGUAGAGGga ||| || |: | :|||||| aaaCCUAUGAAUAAUUAUCUCCaa 3 22 1106 1129 [mm9:10:92147807-92147830:-] 0.5799 145 0 -16.75 -0.1533 MIMAT0009407 mmu-miR-1942 17997 Nedd1 guugGUCUACU--UCUGUAGACu ||||| | | ||||||| auuaCAGAUAACCACACAUCUGc 2 18 142 164 [mm9:10:92154385-92154407:-] 0.5225 156 7 -16.14 -0.5549 MIMAT0009407 mmu-miR-1942 17997 Nedd1 guUGGUCUACUUCUGUAGACu ||: || : ||||||| guACUUUAUAUGUACAUCUGu 2 20 975 995 [mm9:10:92147941-92147961:-] 0.5732 147 7 -12.80 -0.6686 MIMAT0009409 mmu-miR-1944 17997 Nedd1 uuAGUCUUGAACUGUAA----GUCGUGUCUc |:| | :|| |:||| | ||||||| auUUAUAUUUUUAUAUUAAAACUGCACAGAa 2 26 128 158 [mm9:10:92148778-92148808:-] 0.5631 160 7 -12.55 -1.1118 MIMAT0009411 mmu-miR-1306 17997 Nedd1 guagugguggucUCGGUUGca ||||||| auuuuuuuagguAGCCAACuu 3 10 328 348 [mm9:10:92148588-92148608:-] 0.5807 125 0 -10.11 -0.1055 MIMAT0009416 mmu-miR-1949 17997 Nedd1 uugauaCGACUGUAGGACCAUAUc | |||| |||||||| ucaaggGGUGAC-CGCUGGUAUAu 2 19 11 33 [mm9:10:92154516-92154538:-] 0.5212 152 7 -16.58 -0.8796 MIMAT0009419 mmu-miR-669m 17997 Nedd1 uauacaaacacaccUACAUAUa :|||||| guuaaauuaaaauaGUGUAUAu 2 9 260 281 [mm9:10:92154268-92154289:-] 0.4694 124 6 -6.23 -0.4912 MIMAT0009419 mmu-miR-669m 17997 Nedd1 uauaCAAAC-A-CACCUACAUAUa || || | | | ||||||| aaggGUCUGAUAGAGCAUGUAUAu 2 19 1361 1384 [mm9:10:92147552-92147575:-] 0.5863 148 7 -7.89 -0.4701 MIMAT0009425 mmu-miR-1954 17997 Nedd1 uugucccaGAGUG-AGACGUca | ||| |||||| cagauaacCACACAUCUGCAaa 3 14 146 167 [mm9:10:92154382-92154403:-] 0.5225 128 0 -11.80 -0.1172 MIMAT0009431 mmu-miR-1958 17997 Nedd1 ugAAU--GACGAAGGUGAAAGGAu ||| || :| :|:|||||| uuUUAACCUAUUAAUAUUUUCCUa 2 21 1299 1322 [mm9:10:92147614-92147637:-] 0.5863 139 6 -13.68 -0.3761 MIMAT0009433 mmu-miR-1960 17997 Nedd1 ucgggagaAGAUUGUCGUGACc |:|| ||||||| gucauggaUUUA--AGCACUGa 2 15 1398 1417 [mm9:10:92147519-92147538:-] 0.5863 143 7 -11.85 -1.2267 MIMAT0009442 mmu-miR-1969 17997 Nedd1 uggguacaauuucaGAGGUAGAa :||||||| ugcagcacgcacuaUUCCAUCUc 2 10 97 119 [mm9:10:92148817-92148839:-] 0.5631 141 7 -11.54 -0.4761 MIMAT0009461 mmu-miR-1982.2 17997 Nedd1 gacacccucuuguaUCCCACu |||||| agauagaaucuguaAGGGUGu 2 8 1072 1092 [mm9:10:92147844-92147864:-] 0.5536 120 6 -12.93 -0.1261 MIMAT0011216 mmu-miR-2140 17997 Nedd1 ugGUGGUUCUAGACGUGga :|::|| | |||||| uaUAUUAA-AACUGCACag 3 18 139 156 [mm9:10:92148780-92148797:-] 0.5631 131 0 -12.54 -0.1269 MIMAT0011222 mmu-miR-2146 17997 Nedd1 guGUACCU-UGGGAAGAGGUg :||| | | :: |||||| ccUAUGAAUAAUUAUCUCCAa 2 19 1109 1129 [mm9:10:92147807-92147827:-] 0.5799 121 6 -11.04 -0.1980 MIMAT0012774 mmu-miR-664 17997 Nedd1 auccGACCCCUCAU---UUACUUAu ||| || |: ||||||| auauCUGCUGAUUGUCUAAUGAAUu 2 19 589 613 [mm9:10:92148323-92148347:-] 0.5152 145 7 -10.58 -0.7753 MIMAT0012774 mmu-miR-664 17997 Nedd1 auccgaccccucauuUACUUAu |||||| aauaaauauaaaccuAUGAAUa 2 8 1097 1118 [mm9:10:92147818-92147839:-] 0.5799 120 6 -5.32 -0.1333 MIMAT0000123 mmu-miR-1 17997 Nedd1 uaUG-UAUGAAGAAAUGUAAGgu || ||| |:|| |||||| guACAAUAAAUUUUCACAUUCaa 3 21 1418 1440 [mm9:10:92147496-92147518:-] 0.5863 143 0 -11.17 -0.1444 MIMAT0000128 mmu-miR-30a 17997 Nedd1 gaAGGUC--AGCUCCUACAAAUGu ||||| || | ||||||||| uuUCCAGGAUC-AAGAUGUUUACu 2 21 1009 1031 [mm9:10:92147905-92147927:-] 0.5732 165 7 -20.73 -0.7725 MIMAT0000130 mmu-miR-30b 17997 Nedd1 ucgacucacaUCCUACAAAUGu | ||||||||| uuccaggaucAAGAUGUUUACu 2 13 1010 1031 [mm9:10:92147905-92147926:-] 0.5732 152 7 -10.81 -0.7725 MIMAT0000134 mmu-miR-124 17997 Nedd1 ccguaaguggcgcACGGAAu |||||| augacaucagguaUGCCUUa 2 8 442 461 [mm9:10:92148475-92148494:-] 0.5753 120 6 -13.87 -0.1621 MIMAT0000162 mmu-miR-152 17997 Nedd1 gguucaagacaguaCGUGACu |||||| ugucauggauuuaaGCACUGa 2 8 1397 1417 [mm9:10:92147519-92147539:-] 0.5863 120 6 -15.58 -0.1685 MIMAT0000164 mmu-miR-154 17997 Nedd1 gcuuccguugugccuAUUGGAu |||||| cuauauacuacauuuUAACCUa 2 8 1287 1308 [mm9:10:92147628-92147649:-] 0.5863 120 6 -11.27 -0.3715 MIMAT0000209 mmu-miR-129-5p 17997 Nedd1 cgUUCGGGUCU-GGCGUUUUUc || | || | |:||||||: auAACCACACAUCUGCAAAAGa 2 20 149 170 [mm9:10:92154379-92154400:-] 0.5225 142 0 -14.18 -0.1577 MIMAT0000223 mmu-miR-193 17997 Nedd1 ugacccUGAAACAUCCGGUCAa |: ||| | |||||| uuuuaaAUCUUG-AUGCCAGUu 2 17 75 95 [mm9:10:92154454-92154474:-] 0.5059 122 6 -11.44 -0.1352 MIMAT0000233 mmu-miR-200b 17997 Nedd1 aguaGUAAUGGUCC---GUCAUAAu :| ||| || ||||||| acuaUAAUACACGGAAUCAGUAUUg 2 19 47 71 [mm9:10:92148865-92148889:-] 0.5631 145 7 -13.30 -0.4661 MIMAT0000238 mmu-miR-205 17997 Nedd1 gucugaggccaccuUACUUCCu ||||||| uaauuuuuauucucAUGAAGGc 2 9 203 224 [mm9:10:92154325-92154346:-] 0.4904 140 7 -9.83 -0.4693 MIMAT0000239 mmu-miR-206 17997 Nedd1 ggUGUGUGAAGGAAUGUAAGgu |:| |:||:| |||||| caAUAAAUUUUC--ACAUUCaa 3 21 1421 1440 [mm9:10:92147496-92147515:-] 0.5863 137 0 -10.55 -0.1339 MIMAT0000248 mmu-miR-30e 17997 Nedd1 gaAGGUC--AGUUCCUACAAAUGu ||||| |||| ||||||||| uuUCCAGGAUCAA-GAUGUUUACu 2 21 1009 1031 [mm9:10:92147905-92147927:-] 0.5732 173 7 -23.65 -0.7651 MIMAT0000366 mmu-miR-290-5p 17997 Nedd1 uuucacggggguaucAAACUCa |||||| ucauaacugaauuuuUUUGAGg 2 8 176 197 [mm9:10:92154352-92154373:-] 0.4917 120 6 -6.46 -0.1061 MIMAT0000368 mmu-miR-291a-3p 17997 Nedd1 cguguguuuCACCU-UCGUGAAa ||| | ||||||| cagugugcuGUGAACAGCACUUu 2 14 780 802 [mm9:10:92148134-92148156:-] 0.5599 148 7 -16.50 -0.2349 MIMAT0000368 mmu-miR-291a-3p 17997 Nedd1 cguGUGUUUCACCUUCGUGAaa ||:::| | ||||||| uguCAUGGA-UUUAAGCACUga 3 20 1397 1417 [mm9:10:92147519-92147539:-] 0.5863 133 0 -10.71 -0.1458 MIMAT0000369 mmu-miR-292-5p 17997 Nedd1 guuuucucgggggucAAACUCa |||||| ucauaacugaauuuuUUUGAGg 2 8 176 197 [mm9:10:92154352-92154373:-] 0.4917 120 6 -7.18 -0.1050 MIMAT0000372 mmu-miR-294 17997 Nedd1 uguguguuuucccuUCGUGAAa ||||||| agugugcugugaacAGCACUUu 2 9 781 802 [mm9:10:92148134-92148155:-] 0.5599 140 7 -10.18 -0.2328 MIMAT0000372 mmu-miR-294 17997 Nedd1 uguguguuuucccUUCGUGAaa ||||||| uugucauggauuuAAGCACUga 3 10 1396 1417 [mm9:10:92147519-92147540:-] 0.5863 125 0 -10.47 -0.1486 MIMAT0000373 mmu-miR-295 17997 Nedd1 ucugaguuuucaucaUCGUGAAa ||||||| cagugugcugugaacAGCACUUu 2 9 780 802 [mm9:10:92148134-92148156:-] 0.5599 140 7 -13.43 -0.2349 MIMAT0000373 mmu-miR-295 17997 Nedd1 ucugAGUUUUCAUCAUCGUGAaa ||| :: | |||||| cuugUCAUGGAUUUAAGCACUga 3 20 1395 1417 [mm9:10:92147519-92147541:-] 0.5863 127 0 -9.83 -0.1472 MIMAT0000380 mmu-miR-302a 17997 Nedd1 agugguuuuGUACCU-UCGUGAAu ::|| | ||||||| acagugugcUGUGAACAGCACUUu 2 15 779 802 [mm9:10:92148134-92148157:-] 0.5599 145 7 -13.83 -0.2328 MIMAT0000380 mmu-miR-302a 17997 Nedd1 agUGGUUUUGUACCUUCGUGAau ::|| :: || ||||||| uuGUCAUGG-AUUUAAGCACUga 3 22 1396 1417 [mm9:10:92147519-92147540:-] 0.5863 131 0 -15.34 -0.1472 MIMAT0000385 mmu-miR-106a 17997 Nedd1 gauggACGUGACA---AUCGUGAAAc ||::|||| |||||||| uacagUGUGCUGUGAACAGCACUUUc 2 19 778 803 [mm9:10:92148133-92148158:-] 0.5599 157 7 -19.23 -0.5997 MIMAT0000386 mmu-miR-106b 17997 Nedd1 uagACGUGACA---GUCGUGAAAu ||::|||| ||||||||| cagUGUGCUGUGAACAGCACUUUc 2 19 780 803 [mm9:10:92148133-92148156:-] 0.5599 165 7 -19.87 -0.5997 MIMAT0000513 mmu-miR-19b 17997 Nedd1 agucaaAAC-GUACCUAAA--CGUGu ||| ||||||||| |||| aaacacUUGUCAUGGAUUUAAGCACu 2 18 1390 1415 [mm9:10:92147521-92147546:-] 0.5863 124 0 -17.94 -0.9383 MIMAT0000514 mmu-miR-30c 17997 Nedd1 cgacUCUCACAUCCUACAAAUGu ||: | | ||||||||| uuccAGGAU-CAAGAUGUUUACu 2 20 1010 1031 [mm9:10:92147905-92147926:-] 0.5732 153 7 -10.90 -0.7725 MIMAT0000515 mmu-miR-30d 17997 Nedd1 gaAGGUC--AGCCCCUACAAAUGu ||||| || ||||||||| uuUCCAGGAUC-AAGAUGUUUACu 2 21 1009 1031 [mm9:10:92147905-92147927:-] 0.5732 157 7 -20.73 -0.7761 MIMAT0000516 mmu-miR-148a 17997 Nedd1 uguuucaagacaucaCGUGACu |||||| uugucauggauuuaaGCACUGa 2 8 1396 1417 [mm9:10:92147519-92147540:-] 0.5863 120 6 -13.06 -0.1685 MIMAT0000527 mmu-miR-16 17997 Nedd1 gcgGUUAUAAAUGCAC-GACGAu | :|:|| |: || ||||| uggCCGUGUUCAUCUGCCUGCUg 2 20 870 892 [mm9:10:92148044-92148066:-] 0.5599 123 0 -17.14 -0.1557 MIMAT0000528 mmu-miR-18a 17997 Nedd1 gauagacgUGAUCUACGUGGAAu ||| : ||||||| ------agACUCUGGGCACCUUg 2 16 1 17 [mm9:10:92148919-92148935:-] 0.6925 147 7 -16.25 -0.9712 MIMAT0000529 mmu-miR-20a 17997 Nedd1 gauggACGUGAUAU---UCGUGAAAu ||::||:|: |||||||| uacagUGUGCUGUGAACAGCACUUUc 2 19 778 803 [mm9:10:92148133-92148158:-] 0.5599 157 7 -18.09 -0.6034 MIMAT0000531 mmu-miR-22 17997 Nedd1 ugucaaGAAGUUGACCGUCGAa |||: :|||||||| uguggcCUUUUCUUGGCAGCUa 2 17 1192 1213 [mm9:10:92147723-92147744:-] 0.5831 156 7 -18.63 -0.6424 MIMAT0000538 mmu-miR-31 17997 Nedd1 gucGAUACGGUCGUAGAACGGa || ||:| || ||||||| auuCU-UGUC-GCCUCUUGCCc 2 20 940 959 [mm9:10:92147977-92147996:-] 0.5732 155 7 -19.05 -0.3107 MIMAT0000539 mmu-miR-92a 17997 Nedd1 guccggcccuGUUCACGUUau :| |||||| augaauuuacUAUGUGCAAaa 3 12 607 627 [mm9:10:92148309-92148329:-] 0.5152 123 0 -6.61 -0.1182 MIMAT0000540 mmu-miR-93 17997 Nedd1 gauggACG-UGCUUGUCGUGAAAc ||| ::|||||||||||| cagugUGCUGUGAACAGCACUUUc 2 19 780 803 [mm9:10:92148133-92148156:-] 0.5599 173 7 -24.19 -0.6107 MIMAT0000541 mmu-miR-96 17997 Nedd1 ucGUUUUUACACGAU-CA-CGGUUu | ||| | | :|| || ||||| uuCCAAAUUUUUUUAGGUAGCCAAc 2 22 322 346 [mm9:10:92148590-92148614:-] 0.5807 124 0 -9.67 -0.9523 MIMAT0000580 mmu-miR-148b 17997 Nedd1 uguuucaagacacuaCGUGACu |||||| uugucauggauuuaaGCACUGa 2 8 1396 1417 [mm9:10:92147519-92147540:-] 0.5863 120 6 -13.44 -0.1685 MIMAT0004651 mmu-miR-340-5p 17997 Nedd1 uuAGUCAGAGUAACGAAAUAUu ||| || | ||||||| ucUCA-ACUGUGUACUUUAUAu 2 21 965 985 [mm9:10:92147951-92147971:-] 0.5732 146 7 -8.92 -0.6665 MIMAT0004651 mmu-miR-340-5p 17997 Nedd1 uuAGUCAG--AGUAACGAAAUAUu |||| | |:|| :|||||| ugUCAGACAUUUAUAUUUUUAUAu 2 21 120 143 [mm9:10:92148793-92148816:-] 0.5631 143 6 -10.07 -0.1055 MIMAT0004651 mmu-miR-340-5p 17997 Nedd1 uuAGUCAGA--GUA-ACGAAAUAUu ||:|| | | | | :|||||| ccUCGGUAUACCUUCUAUUUUAUAa 2 21 355 379 [mm9:10:92148557-92148581:-] 0.5807 134 6 -8.75 -0.1354 MIMAT0000649 mmu-miR-17 17997 Nedd1 gauggACGUGACAU---UCGUGAAAc ||::||||: |||||||| uacagUGUGCUGUGAACAGCACUUUc 2 19 778 803 [mm9:10:92148133-92148158:-] 0.5599 161 7 -19.96 -0.5997 MIMAT0000651 mmu-miR-19a 17997 Nedd1 agucaaaacgUAUCUAAACGUGu ||| |||| ||| acugaguacaAUAAAUUUUCACa 2 14 1413 1435 [mm9:10:92147501-92147523:-] 0.5863 125 0 -7.93 -0.1138 MIMAT0000651 mmu-miR-19a 17997 Nedd1 agucaaAAC-GUAUCUAAA--CGUGu ||| |||:||||| |||| aaacacUUGUCAUGGAUUUAAGCACu 2 18 1390 1415 [mm9:10:92147521-92147546:-] 0.5863 120 0 -15.23 -0.9383 MIMAT0000652 mmu-miR-25 17997 Nedd1 agucuggcucuGUUCACGUUac :| |||||| aaugaauuuacUAUGUGCAAaa 3 12 606 627 [mm9:10:92148309-92148330:-] 0.5152 123 0 -7.83 -0.1171 MIMAT0000654 mmu-miR-32 17997 Nedd1 acgUUGAAUCAUUACACGUUau ||:||| | |||||||| augAAUUUACU-AUGUGCAAaa 3 20 607 627 [mm9:10:92148309-92148329:-] 0.5152 149 0 -13.23 -0.1114 MIMAT0000654 mmu-miR-32 17997 Nedd1 acGUUGAAUCAUUACA-CGUUAu :||:| |||| || ||||| aaUAAUU--GUAAAGUGGCAAUu 2 21 383 403 [mm9:10:92148533-92148553:-] 0.5807 125 0 -10.79 -0.5977 MIMAT0000657 mmu-miR-200c 17997 Nedd1 agGUAGUAAUGGGCC---GUCAUAAu :|| | ||| ||| ||||||| acUAU-AAUACACGGAAUCAGUAUUg 2 22 47 71 [mm9:10:92148865-92148889:-] 0.5631 154 7 -18.95 -0.4661 MIMAT0000661 mmu-miR-214 17997 Nedd1 ugaCGG-ACAG--ACACGGACGACa ||| |||: | ||||||||| cugGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUGg 2 20 869 893 [mm9:10:92148043-92148067:-] 0.5599 161 7 -24.75 -0.1106 MIMAT0000665 mmu-miR-223 17997 Nedd1 accccAUAAACUGUUUGACUgu || || |: |||||| aagaaUACUUCAU-AACUGAau 3 18 167 187 [mm9:10:92154362-92154382:-] 0.4917 131 0 -6.67 -0.1259 MIMAT0000669 mmu-miR-221 17997 Nedd1 cuuugggucgucUGUUACAUCGa | |||||||| aagauguuuacuAAAAUGUAGCu 2 12 1020 1042 [mm9:10:92147894-92147916:-] 0.5634 147 7 -13.40 -1.0694 MIMAT0000670 mmu-miR-222 17997 Nedd1 ugggucAUCGGUCUACAUCGa || : | ||||||| gauguuUACUAAAAUGUAGCu 2 16 1022 1042 [mm9:10:92147894-92147914:-] 0.5634 147 7 -11.67 -1.0668 MIMAT0000671 mmu-miR-224 17997 Nedd1 uugccuuggugaucACUGAAu |||||| uuauguuuuguaaaUGACUUu 2 8 267 287 [mm9:10:92148649-92148669:-] 0.5719 120 6 -7.85 -0.1839 MIMAT0000679 mmu-miR-217 17997 Nedd1 aggucAGUCAAGGACUAC-GUCAu |:| ||:||||| |||| uaguuUUAAAUCUUGAUGCCAGUu 2 19 72 95 [mm9:10:92154454-92154477:-] 0.5059 130 0 -18.32 -1.1283 MIMAT0000704 mmu-miR-361 17997 Nedd1 cauggggaccUCUAAGACUAUu ||: ||||||| uguauuaaaaAGGGUCUGAUAg 2 13 1352 1373 [mm9:10:92147563-92147584:-] 0.5863 148 7 -15.11 -0.3007 MIMAT0000708 mmu-miR-363 17997 Nedd1 augucUACCU--AUG--GCACGUUaa ||| | ||| :|||||| gucuaAUGAAUUUACUAUGUGCAAaa 3 18 602 627 [mm9:10:92148309-92148334:-] 0.5152 127 0 -9.56 -0.1136 MIMAT0000766 mmu-miR-335-5p 17997 Nedd1 uguaAAAAGCAAUAAC-GAGAACu | ||| ||:| | |||||| uuuaUAUUC-UUGUCGCCUCUUGc 2 20 935 957 [mm9:10:92147979-92148001:-] 0.5732 125 6 -10.53 -0.2382 MIMAT0004745 mmu-miR-384-5p 17997 Nedd1 uguAACGGA---UCC----UUAACAAAUGu ||||:| ||| |: ||||||| cuuUUGCUUUCCAGGAUCAAGAUGUUUACu 2 21 1002 1031 [mm9:10:92147905-92147934:-] 0.5732 146 7 -14.19 -0.7688 MIMAT0001091 mmu-miR-410 17997 Nedd1 uguccGGUAGACACA-AUAUAa |:|| |||| ||||| uuuuuCUAUAGGUGUAUAUAUu 2 17 1329 1350 [mm9:10:92147586-92147607:-] 0.5863 124 0 -12.91 -0.5648 MIMAT0001091 mmu-miR-410 17997 Nedd1 uguccgguagacacAAUAUAa |||||| agacauuuauauuuUUAUAUu 2 8 124 144 [mm9:10:92148792-92148812:-] 0.5631 120 6 -5.58 -0.1001 MIMAT0001091 mmu-miR-410 17997 Nedd1 ugucCGGUAG-ACACA-AUAUAa | |:|| | ||| ||||| ugcaGACGUCUUUUGUCUAUAUa 2 18 1271 1293 [mm9:10:92147643-92147665:-] 0.5863 120 0 -12.46 -0.9780 MIMAT0001092 mmu-miR-376b 17997 Nedd1 uucaccuacaaggaGAUACUa |||||| uaauaaauauaaacCUAUGAa 2 8 1096 1116 [mm9:10:92147820-92147840:-] 0.5668 120 6 -6.88 -0.2280 MIMAT0001537 mmu-miR-429 17997 Nedd1 ugccGUAAUG-GUCU--GUCAUAAu :| ||| |:|| ||||||| acuaUAAUACACGGAAUCAGUAUUg 2 19 47 71 [mm9:10:92148865-92148889:-] 0.5631 152 7 -14.70 -0.4661 MIMAT0001546 mmu-miR-450a-5p 17997 Nedd1 uauaAUCCUUGUGUAG-CGUUUu || ||||||| ||||| cagaUAACCACACAUCUGCAAAa 2 19 146 168 [mm9:10:92154381-92154403:-] 0.5225 130 0 -16.41 -1.2024 MIMAT0003169 mmu-miR-539 17997 Nedd1 ugUGUGG-UUCCUAUUAA-AGAGg | ||| | | |||||| |||| auAAACCUAUGAAUAAUUAUCUCc 2 21 1104 1127 [mm9:10:92147809-92147832:-] 0.5799 131 0 -14.69 -1.0829 MIMAT0003169 mmu-miR-539 17997 Nedd1 ugugugguuccuauuAAAGAGg |||||| uuguguaucauuaacUUUCUCu 2 8 753 774 [mm9:10:92148162-92148183:-] 0.5599 120 6 -10.99 -0.1067 MIMAT0003181 mmu-miR-367 17997 Nedd1 agUGGUAACGAUUUCA-CGUUAa |: |||| |||||| ||||| aaAUAAUUG-UAAAGUGGCAAUu 2 21 382 403 [mm9:10:92148533-92148554:-] 0.5807 138 0 -14.03 -0.5904 MIMAT0003181 mmu-miR-367 17997 Nedd1 agugguAACGAUUUCACGUUaa || || | |||||| augaauUUACU-AUGUGCAAaa 3 17 607 627 [mm9:10:92148309-92148329:-] 0.5152 130 0 -9.05 -0.1114 MIMAT0003182 mmu-miR-494 17997 Nedd1 cucCAAAGGGCA--CAUACAAAGu ||| : || | ||||||| uuuGUUAUGAGUUAGGAUGUUUCu 2 20 19 42 [mm9:10:92148894-92148917:-] 0.5631 146 7 -8.06 -0.2023 MIMAT0003182 mmu-miR-494 17997 Nedd1 cuccaaagggCACAUACAAAGu || |||||||: auaagaauagGUUUAUGUUUUg 2 13 255 276 [mm9:10:92148660-92148681:-] 0.5719 136 0 -8.68 -0.1329 MIMAT0003187 mmu-miR-20b 17997 Nedd1 gauggACGUGAUAC---UCGUGAAAc ||::||:|| |||||||| uacagUGUGCUGUGAACAGCACUUUc 2 19 778 803 [mm9:10:92148133-92148158:-] 0.5599 161 7 -19.31 -0.6034 MIMAT0003374 mmu-miR-302b 17997 Nedd1 gaUGAUUUUGUACCU-UCGUGAAu | |: : ::|| | ||||||| acAGUGUGCUGUGAACAGCACUUu 2 22 779 802 [mm9:10:92148134-92148157:-] 0.5599 148 7 -12.97 -0.2328 MIMAT0003374 mmu-miR-302b 17997 Nedd1 gaugAUUUUGUACCUUCGUGAau | | : || ||||||| cuugUCAUGGAUUUAAGCACUga 3 20 1395 1417 [mm9:10:92147519-92147541:-] 0.5863 131 0 -15.34 -0.1472 MIMAT0003377 mmu-miR-302d 17997 Nedd1 ugugaguuuGUACCU-UCGUGAAu ::|| | ||||||| acagugugcUGUGAACAGCACUUu 2 15 779 802 [mm9:10:92148134-92148157:-] 0.5599 145 7 -11.67 -0.2328 MIMAT0003377 mmu-miR-302d 17997 Nedd1 ugugAGUUUGUACCUUCGUGAau ||| : || ||||||| cuugUCAUGGAUUUAAGCACUga 3 20 1395 1417 [mm9:10:92147519-92147541:-] 0.5863 139 0 -15.34 -0.1472 MIMAT0003727 mmu-miR-374 17997 Nedd1 gugaaUCGUCCAACAUAAUAUa | :|| | ||||||| auuaaAAUAGUGUAUAUUAUAa 2 18 265 286 [mm9:10:92154263-92154284:-] 0.4694 149 7 -5.56 -1.1243 MIMAT0003893 mmu-miR-761 17997 Nedd1 acACAGUCA-AAGUG---GGACGACg || | || ||||: ||||||| gcUGGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUGg 2 21 868 893 [mm9:10:92148043-92148068:-] 0.5599 154 7 -18.01 -0.1106 MIMAT0003456 mmu-miR-495 17997 Nedd1 uucuuCACGUGGUAC-AAACAAa | ||||| || |||||| acucuGGGCACCUUGAUUUGUUa 2 18 3 25 [mm9:10:92148911-92148933:-] 0.5631 133 6 -14.54 -0.6965 MIMAT0003456 mmu-miR-495 17997 Nedd1 uucuucacgugguacAAACAAa |||||| caguuuaguaauuauUUUGUUa 2 8 415 436 [mm9:10:92148500-92148521:-] 0.5780 120 6 -7.36 -0.1869 MIMAT0003486 mmu-miR-491 17997 Nedd1 ggaguaccuuccCAAGGGGUGa ||||||||| auauguacaucuGUUCCCCACu 2 11 982 1003 [mm9:10:92147933-92147954:-] 0.5732 150 7 -20.71 -0.6891 MIMAT0004858 mmu-miR-18b 17997 Nedd1 gauugUCGUGAUCUACGUGGAAu || ||| : ||||||| -----AG-ACUCUGGGCACCUUg 2 19 1 17 [mm9:10:92148919-92148935:-] 0.6925 148 7 -16.25 -0.9712 MIMAT0004859 mmu-miR-193b 17997 Nedd1 ucgcccugaaacaccCGGUCAa |||||| guuuuaaaucuugauGCCAGUu 2 8 74 95 [mm9:10:92154454-92154475:-] 0.5059 120 6 -11.44 -0.1352 MIMAT0004896 mmu-miR-590-3p 17997 Nedd1 ugaUCGAAUAUGUAUUUUAau || ||| |: |||||| aaaAG-UUAAAU-UAAAAUag 3 19 256 274 [mm9:10:92154275-92154293:-] 0.4694 130 0 -2.23 -0.1994 MIMAT0004896 mmu-miR-590-3p 17997 Nedd1 ugaucGAAUAUG--U-AUUU-UAAu ||||||| | |||| ||| auuuuCUUAUACUAACUAAAUAUUa 2 17 671 695 [mm9:10:92148241-92148265:-] 0.5152 122 0 -8.05 -1.0208 MIMAT0004899 mmu-miR-92b 17997 Nedd1 ccuccggcccUGCU-CACGUUau || | |||||| uaaugaauuuACUAUGUGCAAaa 3 13 605 627 [mm9:10:92148309-92148331:-] 0.5152 123 0 -6.14 -0.1182 MIMAT0005850 mmu-miR-1192 17997 Nedd1 uuAAACCAGACAAAC-AAACAAa | ||| | ||| |||||| acUCUGGGCACCUUGAUUUGUUa 2 21 3 25 [mm9:10:92148911-92148933:-] 0.5631 124 6 -7.97 -0.7077 MIMAT0005850 mmu-miR-1192 17997 Nedd1 uuAAACCAGACAAACAAACAAa ||| || || |||||| agUUUAGU-AAUUAUUUUGUUa 2 21 416 436 [mm9:10:92148500-92148520:-] 0.5780 122 6 -3.98 -0.1869

DNA & RNA Element - TRANSFAC Accession AS Description Species Entrez Pubmed Binding Info G038019 Nedd1 Mus musculus 17997

DNA & RNA Element - RepTar Gene Name miRNA Begin End Profile Nedd1 mmu-miR-692 beg:1057 end:1076 pic:3' CTCACTCCGCGAG--TTTCTCTA 5'& |.|.|. |||||||| &5' -------GTGTTTCTAAAGAGAT 3' Nedd1 mmu-miR-20astar beg:1261 end:1276 pic:3' GAAATTCACGAGCATTACGTCA 5'& |.| ||||||| &5' --------GTTAA-AATGCAG- 3' Nedd1 mmu-miR-704 beg:1242 end:1253 pic:3' GATCCTCGTCTCGTGTACAGA 5'& .||||||| &5' ------------TACATGTC- 3' Nedd1 mmu-miR-380-3p beg:1281 end:1300 pic:3' TTCTACACCTGGTATGATGTAT 5'& ||| .||||||||| &5' ----TGTCTA-TATACTACAT- 3' Nedd1 mmu-miR-697 beg:24 end:40 pic:3' AGAGGTGTCCTGGTCCTACAA 5'& | ..|||||||| &5' --------GAGTTAGGATGTT 3' Nedd1 mmu-miR-338-5p beg:688 end:706 pic:3' GTGAGTCGTGGTCCTATAACAA 5'& .|..|| |||||||| &5' -------TATTAGAATATTGTT 3' Nedd1 mmu-miR-1928 beg:1031 end:1043 pic:3' CTCGACCGTTACATCGA 5'& ||||||||| &5' --------AATGTAGCT 3' Nedd1 mmu-miR-7astar beg:6 end:25 pic:3' ATACCGTCTGACACTAAACAAC 5'& |||| || ||||||||| &5' ---GGCAC-CT-TGATTTGTT- 3' Nedd1 mmu-miR-582-5p beg:960 end:975 pic:3' TCATTGACCAACTT--GTTGACAT 5'& || |||||||. &5' -----------GATCTCAACTGTG 3' Nedd1 mmu-miR-761 beg:875 end:893 pic:3' ACACAGTCAAAGTG---GGACGACG 5'& ||||. ||||||| &5' ---------TTCATCTGCCTGCTG- 3' Nedd1 mmu-miR-291b-5p beg:893 end:909 pic:3' CCTCTCCCGGAGGTGAAACTAG 5'& ||| ||||||||| &5' --------CCTACACTTTGAT- 3' Nedd1 mmu-miR-18a beg:0 end:18 pic:3' GATAGAC-GTGATCTACGTGGAAT 5'& | | ||.| |||||||. &5' ------GACTCTGG--GCACCTTG 3' Nedd1 mmu-miR-18b beg:0 end:18 pic:3' GATTGTC-GTGATCTACGTGGAAT 5'& || | ||.| |||||||. &5' -----AGACTCTGG--GCACCTTG 3' Nedd1 mmu-miR-106a beg:784 end:803 pic:3' GATGGACGTGACAA---TCGTGAAAC 5'& .|||| |||||||| &5' --------GCTGTGAACAGCACTTT- 3' Nedd1 mmu-miR-20a beg:784 end:803 pic:3' GATGGACGTGATATTCGTGAAAT 5'& |||.. |||||||| &5' ----CTGTGAAC--AGCACTTT- 3' Nedd1 mmu-miR-93 beg:784 end:803 pic:3' GATGGACGTGCTTGTCGTGAAAC 5'& |||. |||||||||||| &5' ----CTGT--GAACAGCACTTT- 3' Nedd1 mmu-miR-141star beg:564 end:578 pic:3' AGGTTGTGACGTGACCTTCTAC 5'& |. .|||||||| &5' ---------GT-TTGGAAGAT- 3' Nedd1 mmu-miR-200cstar beg:1132 end:1150 pic:3' GGTTTGTGACGACC-CATTCTGC 5'& .|||| || ||||||| &5' --GAACA-----GGAGTAAGAC- 3' Nedd1 mcmv-miR-m108-1 beg:1154 end:1170 pic:3' GCTGTGCTCGGTGGCAGTCTTT 5'& ||. || ||||||| &5' -------AGTGAC--TCAGAAA 3' Nedd1 mcmv-miR-M44-1 beg:1057 end:1077 pic:3' TGGCGCCGAGACCTTTTTCTAT 5'& |.| .||| |||.||||| &5' ---GTGTTTCT--AAAGAGATA 3' Nedd1 mcmv-miR-m59-1 beg:579 end:600 pic:3' GACTGCCAGCTCCGT------GACGATT 5'& .||| |||||.| &5' ----------GGGCTATATATCTGCTGA 3' Nedd1 mghv-miR-M1-1 beg:703 end:715 pic:3' TTTCCTTCATGCCGGTAAAGAT 5'& |||||||.| &5' ------------GCCATTTTT- 3' Nedd1 mmu-let-7a beg:209 end:230 pic:3' TTGATATGTTGGATGATGGAGT 5'& |.|||||| ||. | |.|| &5' AGCTATAC-ACTAAGTGCC--- 3' Nedd1 mmu-let-7astar beg:1361 end:1384 pic:3' CCTTT-CTGTCATCTAACATATC 5'& ||. ||.|| || |||||| &5' GGGTCTGATAG-AGCATGTATA- 3' Nedd1 mmu-let-7c-1star beg:488 end:510 pic:3' CCTTTCGATCTTCCAACATGTC 5'& |||| || |||||||| &5' -GAAA-CTTTGCA-TTGTACAG 3' Nedd1 mmu-let-7c-1star beg:841 end:858 pic:3' CCTTTCGATCTTCCAACATGTC 5'& || |||. |||||| &5' -----GC-AGAGAA-TGTACA- 3' Nedd1 mmu-let-7c-2star beg:1366 end:1384 pic:3' CCTTTCTGTCATCTAACATATC 5'& ||.|| || |||||| &5' -----GATAG-AGCATGTATA- 3' Nedd1 mmu-let-7fstar beg:1335 end:1356 pic:3' CCCTTCCGT-TATCTAACATATC 5'& |||.. ||| |||||.|| &5' ----AGGTGTATATATTGTGTA- 3' Nedd1 mmu-miR-106a beg:961 end:982 pic:3' GATGGACGTGACAATCGTGAAAC 5'& |.|| ||||| |.||||| &5' --ATCTCAACTGT--GTACTTT- 3' Nedd1 mmu-miR-106b beg:780 end:803 pic:3' TAGACGTGACA---GTCGTGAAAT 5'& || |||| ||||||||| &5' ---TGTGCTGTGAACAGCACTTT- 3' Nedd1 mmu-miR-106b beg:961 end:983 pic:3' TAGACGTGACAGTCGTGAAAT 5'& |||| ||||| |.|||||| &5' ATCTCAACTGT--GTACTTTA 3' Nedd1 mmu-miR-1191 beg:905 end:927 pic:3' ATCCCGATGT-ATCATTCTGAC 5'& |||||||. | ||| .|.|| &5' TAGGGCTGGACTAG--GGGCT- 3' Nedd1 mmu-miR-1191 beg:1131 end:1151 pic:3' ATCCCGATGTA-TCATTCTGAC 5'& || ||| ||||||||| &5' ---GGA-ACAGGAGTAAGACT- 3' Nedd1 mmu-miR-1193 beg:1190 end:1200 pic:3' CTATCATTTTGCCCACTGGAT 5'& |||.||| &5' -------------GTGGCCT- 3' Nedd1 mmu-miR-1195 beg:902 end:927 pic:3' ACTCGTCCGACCGGAG-CTTGAGT 5'& ||| .|||||| || |..|| &5' TGATAGGGCTGGACTAGGGGCT-- 3' Nedd1 mmu-miR-125bstar beg:1212 end:1233 pic:3' TCCAGG-GTTCTTGGACTGAACA 5'& || || || |||||||| &5' -GG-CCGCATTA---TGACTTGT 3' Nedd1 mmu-miR-129-3p beg:566 end:587 pic:3' TACGAAAAACCCCA----TTCCCGAA 5'& ||||| ||||||| &5' ------TTTGGAAGATTCAAGGGCT- 3' Nedd1 mmu-miR-135b beg:200 end:219 pic:3' AGTGTATCCTTACTTT-TCGGTAT 5'& ||||| |||.||| &5' --------GAATGCCTTAGCTATA 3' Nedd1 mmu-miR-138star beg:333 end:344 pic:3' GGGACCACAACACTTCATCGGC 5'& |.|||||| &5' -------------AGGTAGCC- 3' Nedd1 mmu-miR-148a beg:1408 end:1418 pic:3' TGTTTCAAGACATCACGTGACT 5'& ||||||| &5' ---------------GCACTGA 3' Nedd1 mmu-miR-152 beg:1395 end:1418 pic:3' GGTTCAAGACAGTA--------CGTGACT 5'& .|||||| ||||||| &5' -------TTGTCATGGATTTAAGCACTGA 3' Nedd1 mmu-miR-154 beg:1034 end:1057 pic:3' GCTTCCGTTGTG-C---CTATTGGAT 5'& |.|.| | ||||||.| &5' -----GTAGCTTAGATTGATAACTT- 3' Nedd1 mmu-miR-17 beg:961 end:982 pic:3' GATGGACGTGACATTCGTGAAAC 5'& |.|| ||||| |.||||| &5' --ATCTCAACTGT--GTACTTT- 3' Nedd1 mmu-miR-17 beg:783 end:803 pic:3' GATGGACGTGACAT---TCGTGAAAC 5'& | ||||. |||||||| &5' ------GTGCTGTGAACAGCACTTT- 3' Nedd1 mmu-miR-1839-5p beg:868 end:889 pic:3' GTTCTGG-ACAAGATAGATGGAA 5'& |.|| ||||| ||||.||| &5' ---GGCCGTGTTC-ATCTGCCT- 3' Nedd1 mmu-miR-185 beg:701 end:718 pic:3' AGTCCTTGACGGAAAGAGAGGT 5'& .|||| ||.|.||| &5' -------TTGCCATTTTTTCC- 3' Nedd1 mmu-miR-1896 beg:832 end:851 pic:3' GAGGAGTGGGTGGTA-GTCTCTC 5'& . ||.||| |||||| &5' ------GTTCATCATGCAGAGA- 3' Nedd1 mmu-miR-1897-5p beg:1425 end:1442 pic:3' GGGGGAGAAAGAG-GTAGGTTTC 5'& ||.|| |||.|||| &5' --------TTTTCACATTCAAA- 3' Nedd1 mmu-miR-1898 beg:1 end:22 pic:3' CTAGGGGACACT-TGGAACTGGA 5'& |.||| |. |||||||..| &5' ----CTCTG-GGCACCTTGATTT 3' Nedd1 mmu-miR-190b beg:1237 end:1254 pic:3' TTGGGTTATAGTTTGTATAGT 5'& ||| | ||||.||| &5' --CCC-----CTTACATGTCA 3' Nedd1 mmu-miR-1933-5p beg:1208 end:1230 pic:3' TTTGATTCTGGCTTGTGGTACTGA 5'& |.||| |.||| ||..|||||| &5' -AGCTATGGCCG--CATTATGACT 3' Nedd1 mmu-miR-1941-3p beg:26 end:38 pic:3' TACCCTCTATGACGATTCTAC 5'& |.||.|||| &5' ------------GTTAGGATG 3' Nedd1 mmu-miR-1944 beg:492 end:511 pic:3' TTAGTCTTGAACTGTAAGTCGTGTCTC 5'& ||||| .|||| |.||||| &5' ------AACTTTGCATT--GTACAGA- 3' Nedd1 mmu-miR-1950 beg:1260 end:1277 pic:3' ACTGGTATAGGAATC-TACGTCT 5'& | ||| ||||||| &5' ---------CGTTAAAATGCAGA 3' Nedd1 mmu-miR-1950 beg:832 end:849 pic:3' ACTGGTATAGGAATCTACGTCT 5'& .|.| ||||||| &5' -------GTTCATC-ATGCAGA 3' Nedd1 mmu-miR-1953 beg:221 end:237 pic:3' GTCTTCGGACTCTTGAAAGGGT 5'& || ||| ||||.|| &5' -AGT-GCC------CTTTTCC- 3' Nedd1 mmu-miR-1953 beg:754 end:774 pic:3' GTCTTCGGACTC-TTGAAAGGGT 5'& |. |||||||.| &5' -----GTATCATTAACTTTCTC- 3' Nedd1 mmu-miR-1953 beg:1135 end:1157 pic:3' GTCTTCGGACTCTTGAAAGGGT 5'& |||.||. || |||||.||| &5' CAGGAGTA--AG-ACTTTTCCA 3' Nedd1 mmu-miR-1958 beg:1317 end:1337 pic:3' TGAATGACGAAGGTGAAAGGAT 5'& || .|||| .|||.||| &5' -----CTATTTCCTTTTTTCTA 3' Nedd1 mmu-miR-1960 beg:1395 end:1417 pic:3' TCGGGAGAAGATTGTCGTGACC 5'& |.| ||||||| &5' -GTCATGGATTTA-AGCACTG- 3' Nedd1 mmu-miR-1967 beg:793 end:818 pic:3' CGTAGAAG--AGGGGTCCTAGGAGT 5'& ||| .||| |||..|| |||.| &5' GCACTTTCTATCCTTAG---CCTTA 3' Nedd1 mmu-miR-200b beg:51 end:72 pic:3' AGTAGTAATG-GTCC--GTCATAAT 5'& ||| |.| |||||||. &5' -------TACACGGAATCAGTATTG 3' Nedd1 mmu-miR-200c beg:51 end:72 pic:3' AGGTAGTAATGGGCC---GTCATAAT 5'& ||| ||| |||||||. &5' --------TACACGGAATCAGTATTG 3' Nedd1 mmu-miR-201 beg:1400 end:1421 pic:3' TTCTTGTTA-CGGAATGACTCAT 5'& |.|. || |||||||| &5' --GGATTTAAGC---ACTGAGTA 3' Nedd1 mmu-miR-20a beg:961 end:983 pic:3' GATGGACGTGATATTCGTGAAAT 5'& |.|| |||.| |.|||||| &5' --ATCTCAACTGT--GTACTTTA 3' Nedd1 mmu-miR-20b beg:961 end:982 pic:3' GATGGACGTGATACTCGTGAAAC 5'& |.|| |||.| |.||||| &5' --ATCTCAACTGT--GTACTTT- 3' Nedd1 mmu-miR-20b beg:775 end:803 pic:3' GATGG-ACGTGATACT---CGTGAAAC 5'& ||| || ||.||| ||||||| &5' -TACAGTGTGCTGTGAACAGCACTTT- 3' Nedd1 mmu-miR-2135 beg:953 end:969 pic:3' CAAAGCCGGGGTTCTGGAGA 5'& |||| ||||.||| &5' ------GCCCAAAGATCTC- 3' Nedd1 mmu-miR-2141 beg:354 end:371 pic:3' TTGAAAAGAC-TGTGGAGGA 5'& || | |.||||.|| &5' ------TCGGTATACCTTCT 3' Nedd1 mmu-miR-214 beg:870 end:893 pic:3' TGACGG-ACAGAC--ACGGACGACA 5'& ||| |||. ||||||||| &5' ---GCCGTGTTCATCTGCCTGCTG- 3' Nedd1 mmu-miR-2146 beg:764 end:776 pic:3' GTGTACCTTGGGAAGAGGTG 5'& |.|||||.| &5' ----------CTTTCTCTA- 3' Nedd1 mmu-miR-2146 beg:1111 end:1129 pic:3' GTGTACCTTGGGA--AGAGGTG 5'& |||. |||||| &5' ------GAATAATTATCTCCA- 3' Nedd1 mmu-miR-214star beg:715 end:734 pic:3' CGTGTCGTTCACATCTGTCCGT 5'& | || ||||| ||||||| &5' -CTCA-CAAGTA---ACAGGCA 3' Nedd1 mmu-miR-214star beg:1368 end:1390 pic:3' CGTGTCGTTCACATCTGTCCGT 5'& .| |||| |||| |.|||.| &5' -TAGAGCA--TGTATATAGGTA 3' Nedd1 mmu-miR-221 beg:1022 end:1043 pic:3' CTTTGGGTCGTCTG---TTACATCGA 5'& |. || ||||||||| &5' --------GTTTACTAAAATGTAGCT 3' Nedd1 mmu-miR-22 beg:1192 end:1213 pic:3' TGTCAAGAAGTTGACCGTCGAA 5'& | |||. .|||||||| &5' ---GGCCTTTTCTTGGCAGCT- 3' Nedd1 mmu-miR-28star beg:453 end:473 pic:3' AGGTCGTCGAGTGT-TAGATCAC 5'& || ||.|. ||.||||| &5' ----GC--CTTATTTATTTAGTG 3' Nedd1 mmu-miR-291a-5p beg:889 end:909 pic:3' TCTCTCCC-GGAGGTGAAACTAC 5'& || ||| ||||||||| &5' -----GGAACCTACACTTTGAT- 3' Nedd1 mmu-miR-292-3p beg:342 end:364 pic:3' TGTGAGTTTTGGACCGCCGTGAAA 5'& || .|.||||||| |||.|. &5' ACTTTTAAAACCT--CGGTAT--- 3' Nedd1 mmu-miR-29astar beg:49 end:68 pic:3' GACTTGTGGTTTTCTTTAGTCA 5'& ||.|| |.||||||| &5' ---AATACAC---GGAATCAGT 3' Nedd1 mmu-miR-300 beg:485 end:503 pic:3' CTTCTCTCGAACG--GGAACGTAT 5'& .||| |.|||||| &5' --------TTTGAAACTTTGCAT- 3' Nedd1 mmu-miR-301a beg:484 end:505 pic:3' CGAAACTGTTATGATAACGTGAC 5'& .||||| ||| |||||.|| &5' -TTTTGAA---ACT-TTGCATTG 3' Nedd1 mmu-miR-3099star beg:906 end:927 pic:3' GTTCCCGACCT--TCCTTCGACC 5'& ||||||||| ||| .||| &5' --AGGGCTGGACTAGG-GGCT-- 3' Nedd1 mmu-miR-3099star beg:856 end:873 pic:3' GTTCCCGACCTTCCTTCGACC 5'& |.||| |.|||||| &5' -----GTTGGC--GGAGCTGG 3' Nedd1 mmu-miR-30a beg:60 end:78 pic:3' GAAGGTCAGCTCCTACAAATGT 5'& .|||| |||||.|| &5' ---TCAGTAT----TGTTTGCA 3' Nedd1 mmu-miR-30a beg:1007 end:1031 pic:3' GAAGGTCAGCTC-CTACAAATGT 5'& |||||| ||||||||| &5' -TTCCAGGATCAAGATGTTTAC- 3' Nedd1 mmu-miR-30b beg:1019 end:1031 pic:3' TCGACTCACATCCTACAAATGT 5'& ||||||||| &5' ------------GATGTTTAC- 3' Nedd1 mmu-miR-30c beg:1019 end:1031 pic:3' CGACTCTCACATCCTACAAATGT 5'& ||||||||| &5' -------------GATGTTTAC- 3' Nedd1 mmu-miR-30c-2star beg:219 end:239 pic:3' TCTCATTTGTCGGAAGAGGGTC 5'& ||| . ||||.|||.| &5' ----TAAGTGCCCTTTTCCTA- 3' Nedd1 mmu-miR-30d beg:1010 end:1031 pic:3' GAAGGTCAGCCC-CTACAAATGT 5'& ||||| ||||||||| &5' --TCCAGGATCAAGATGTTTAC- 3' Nedd1 mmu-miR-30d beg:60 end:78 pic:3' GAAGGTCAGCCCCTACAAATGT 5'& .|||| |||||.|| &5' ---TCAGTAT----TGTTTGCA 3' Nedd1 mmu-miR-30e beg:60 end:78 pic:3' GAAGGTCAGTTCCTACAAATGT 5'& .|||| |||||.|| &5' ---TCAGTAT----TGTTTGCA 3' Nedd1 mmu-miR-30e beg:1007 end:1031 pic:3' GAAGGTC--AGTTCCTACAAATGT 5'& |||||| |||| ||||||||| &5' -TTCCAGGATCAA-GATGTTTAC- 3' Nedd1 mmu-miR-30estar beg:877 end:896 pic:3' CGACATTTGTAGGC---TGACTTTC 5'& ||||.| .|||.|| &5' --------CATCTGCCTGCTGGAA- 3' Nedd1 mmu-miR-31 beg:942 end:959 pic:3' GTCGATACGGTCGTAGAACGGA 5'& ||.| || ||||||| &5' ------TGTC-GCCTCTTGCC- 3' Nedd1 mmu-miR-31 beg:1206 end:1231 pic:3' GTCGATACGGTCGTAGAAC-GGA 5'& |||||||| | ||||. || |.| &5' CAGCTATGGCCGCATTATGACTT 3' Nedd1 mmu-miR-31star beg:61 end:82 pic:3' CTACCGTTAT-ACAACCGTATCGT 5'& ||.|| |||| ||||.|| &5' -----CAGTATTGTTTGCATGGC- 3' Nedd1 mmu-miR-325 beg:655 end:671 pic:3' AACTATCCTCCACGAGTTATTT 5'& ||||| |||.|.|| &5' ----TAGGA-----TCAGTGAA 3' Nedd1 mmu-miR-327 beg:1239 end:1259 pic:3' TAGGA--GTACGGGGAGTTCA 5'& ||| ||||.| ||||| &5' --CCTTACATGTCACTCAA-- 3' Nedd1 mmu-miR-328 beg:568 end:588 pic:3' TGCCTTCCC-GTCTCTCCCGGTC 5'& ||||| || |||||.| &5' --GGAAGATTCA---AGGGCTA- 3' Nedd1 mmu-miR-328 beg:903 end:928 pic:3' TGCCTTCCCG-TCTC--TCCCGGTC 5'& | ||||| .|| .||||.| &5' --GATAGGGCTGGACTAGGGGCTA- 3' Nedd1 mmu-miR-330star beg:1185 end:1209 pic:3' AGAGACGTCCGGGACACGAAACG 5'& |.||||. ||||.| ||| || &5' TTTCTGT-GGCCTTTT-CTTGGC 3' Nedd1 mmu-miR-33 beg:1257 end:1274 pic:3' ACGTTACGTTGATG--TTACGTG 5'& |||| |||||| &5' -------CAACGTTAAAATGCA- 3' Nedd1 mmu-miR-331-3p beg:905 end:926 pic:3' AAGATCCTATCCGGGTCCCCG 5'& ||||. || |.|||||| &5' ---TAGGGCTGGACTAGGGGC 3' Nedd1 mmu-miR-331-5p beg:523 end:539 pic:3' CCTAGGGACCCTGGTATGGATC 5'& ..|||| |||||| &5' ----TTCTGGT----TACCTA- 3' Nedd1 mmu-miR-337-3p beg:853 end:872 pic:3' TCCGTAGTATAT---CCTCGACTT 5'& |||.| |||||||. &5' ------CATGTTGGCGGAGCTGG- 3' Nedd1 mmu-miR-338-3p beg:876 end:895 pic:3' GTTGTTTTAGT-GACT-ACGACCT 5'& ||| ||| ||||||| &5' --------TCATCTGCCTGCTGGA 3' Nedd1 mmu-miR-33 beg:1021 end:1040 pic:3' ACGTTACGT-TGATGTTACGTG 5'& .|||. |||| ||||.| &5' ---GATGTTTACTAAAATGTA- 3' Nedd1 mmu-miR-3471 beg:949 end:970 pic:3' TTACGGAATGTCAACCTAGAGT 5'& .|||.| ||||||| &5' ----TCTTGCCCAAAGATCTCA 3' Nedd1 mmu-miR-361 beg:1360 end:1374 pic:3' CATGGGGACCTCTAAGACTATT 5'& ||. |||||||. &5' --------GGG---TCTGATAG 3' Nedd1 mmu-miR-376c beg:734 end:755 pic:3' TGCACTT-TAAAGGAGATACAA 5'& || |||||.|||.|||| &5' ----GATTATTTCTTCTGTGTT 3' Nedd1 mmu-miR-378star beg:24 end:36 pic:3' TGTGTCCTGGACCTCAGTCCTC 5'& ||||.|||| &5' ------------GAGTTAGGA- 3' Nedd1 mmu-miR-384-5p beg:56 end:78 pic:3' TGTAACGGATCCT------TAACAAATGT 5'& ||| |||||||.|| &5' ----------GGAATCAGTATTGTTTGCA 3' Nedd1 mmu-miR-429 beg:51 end:72 pic:3' TGCCGTAATG-GTCT--GTCATAAT 5'& ||| |.|| |||||||. &5' -------TACACGGAATCAGTATTG 3' Nedd1 mmu-miR-432 beg:989 end:1018 pic:3' GAC---GGGTGACTAGATG--AGGTTCT 5'& ||| |||||| |.|.| ||||.|| &5' CTGTTCCCCACT--TTTGCTTTCCAGGA 3' Nedd1 mmu-miR-432 beg:1144 end:1159 pic:3' GACGGGTGACTAGATGAGGTTCT 5'& || || .|||||| &5' ---------GA-CTTTTCCAAG- 3' Nedd1 mmu-miR-448 beg:609 end:626 pic:3' TACCCTGTAGGATG-TATACGTT 5'& ..||| ||.||||| &5' ---------TTTACTATGTGCAA 3' Nedd1 mmu-miR-450a-3p beg:1109 end:1130 pic:3' TACTTACGTTTCGTAGGGGTTA 5'& |||||| || .|||.|||| &5' ATGAAT---AATTATCTCCAA- 3' Nedd1 mmu-miR-450a-3p beg:221 end:240 pic:3' TACTTACGTTTCGTAGGGGTTA 5'& |.||| |.||.|| &5' ---AGTGCCCTT--TTCCTAA- 3' Nedd1 mmu-miR-450b-3p beg:1140 end:1158 pic:3' TACGTACGTTTTACAAGGGTTA 5'& |.||.| ||.|||| &5' ------GTAAGACTTTTCCAA- 3' Nedd1 mmu-miR-450b-3p beg:303 end:328 pic:3' TACGTAC-GTTTTACA-AGGGTTA 5'& || | |||| ||| |.|||| &5' -TGATGGACAAATTGTATTCCAA- 3' Nedd1 mmu-miR-455 beg:1337 end:1358 pic:3' CACATATACGGGCACCTGACG 5'& |||||||| ..||| |.| &5' GTGTATATA-TTGTGTATT-- 3' Nedd1 mmu-miR-465c-5p beg:185 end:208 pic:3' GTCTAGTCGCGGTAAGATTTAT 5'& .|||| ||||.|||. &5' -GGATCTTTATT-TTCTGAATG 3' Nedd1 mmu-miR-466a-5p beg:467 end:487 pic:3' ATACATGTACATGTGTGTGTAT 5'& .||||.||||| |.|||. &5' -GTGTATATGTA-ATACAT--- 3' Nedd1 mmu-miR-466b-5p beg:1373 end:1401 pic:3' GTACATGTA--CATG-TGTGTGTAG 5'& ||||||.|| ||| |||| ..|| &5' CATGTATATAGGTAAAACACTTGTC 3' Nedd1 mmu-miR-466e-5p beg:467 end:487 pic:3' ATACATGTACATGTGTGTGTAG 5'& .||||.||||| |.|||. &5' -GTGTATATGTA-ATACAT--- 3' Nedd1 mmu-miR-466f-5p beg:838 end:861 pic:3' GTACGTGTACGTGTGTGTGCAT 5'& |||||| | | .|||.|| &5' CATGCAGAGA-ATGTACATGT- 3' Nedd1 mmu-miR-466f-5p beg:1373 end:1396 pic:3' GTACGTGTA--CGTGTGTGTGCAT 5'& ||||.|.|| |.| |||| &5' CATGTATATAGGTAAA-ACAC--- 3' Nedd1 mmu-miR-467e beg:979 end:1005 pic:3' TGTATATGT--ACGAGT-GTGAATA 5'& |.||.|||| ||.|| ||||| &5' ATATGTACATCTGTTCCCCACTT-- 3' Nedd1 mmu-miR-470 beg:997 end:1018 pic:3' TGAGTGGTCACGGTCAGGTTCTT 5'& |||. |||. ||||.|| &5' ---CACTTTTGCTT-TCCAGGA- 3' Nedd1 mmu-miR-485 beg:798 end:817 pic:3' CTTAAG-TAGTGCCGGTCGGAGA 5'& ||| ||| | ..|||||. &5' ---TTCTATC-C--TTAGCCTT- 3' Nedd1 mmu-miR-497 beg:772 end:791 pic:3' ATGTTTGGTGTCACACGACGAC 5'& ||..|||||||||||. &5' ----AATTACAGTGTGCTGT-- 3' Nedd1 mmu-miR-500 beg:1074 end:1096 pic:3' ACTTGGGAACGGGTCCACGTAA 5'& |||.| ||. .||||.||| &5' -GAATC--TGTAAGGGTGTATT 3' Nedd1 mmu-miR-500 beg:1324 end:1346 pic:3' ACTTGGGAACGG---GTCCACGTAA 5'& ||.|| .|||||.|| &5' ----CCTTTTTTCTATAGGTGTAT- 3' Nedd1 mmu-miR-501-3p beg:1074 end:1096 pic:3' GTTTAGGAACGGGCCCACGTAA 5'& .|||| ||. |||||.||| &5' -GAATC--TGTAAGGGTGTATT 3' Nedd1 mmu-miR-540-3p beg:1009 end:1032 pic:3' GGTCCTAG--CTGGAGACTGGA 5'& |||||||| ||. |.| ||. &5' CCAGGATCAAGATGTTT-ACT- 3' Nedd1 mmu-miR-568 beg:1337 end:1357 pic:3' CACACATATGTAA-ATATGTA 5'& |||||||.||| |.||. &5' --GTGTATATATTGTGTAT-- 3' Nedd1 mmu-miR-568 beg:467 end:487 pic:3' CACACATATGTAAATATGTA 5'& |||||||..| |||||| &5' --GTGTATATGTA-ATACAT 3' Nedd1 mmu-miR-568 beg:969 end:988 pic:3' CACACATATGTAAATATGTA 5'& |||.||| ||||||..| &5' ---TGTGTAC-TTTATATGT 3' Nedd1 mmu-miR-582-3p beg:171 end:190 pic:3' AACCCAAGTCAACAAGTTGTCC 5'& |||| || |||||||| &5' -TGGGGA-AG----TCAACAGG 3' Nedd1 mmu-miR-666-5p beg:868 end:892 pic:3' CCGA---GAGTGTCGACACGGGCGA 5'& ||| .|||. ||||.||| &5' GGCCGTGTTCATC----TGCCTGCT 3' Nedd1 mmu-miR-668 beg:387 end:400 pic:3' CCATCACCCGGCTCGGCTCACTGT 5'& |. ||||.|| &5' -------------GTAAAGTGGCA 3' Nedd1 mmu-miR-669i beg:467 end:481 pic:3' CATACGTACACACATATACGT 5'& |||||||||.| &5' ----------GTGTATATGTA 3' Nedd1 mmu-miR-669i beg:969 end:989 pic:3' CATACGTACACAC---ATATACGT 5'& ||||| ||||||.| &5' -------TGTGTACTTTATATGTA 3' Nedd1 mmu-miR-669j beg:467 end:481 pic:3' ACAAACGTACACTCATATACGT 5'& | |||||||.| &5' -----------GTGTATATGTA 3' Nedd1 mmu-miR-690 beg:66 end:85 pic:3' AAACCAACACTCGGATCGGAAA 5'& |||| || |.||||| &5' -----TTGTTTGCATGGCCTT- 3' Nedd1 mmu-miR-690 beg:805 end:817 pic:3' AAACCAACACTCGGATCGGAAA 5'& |.||||||| &5' ------------CTTAGCCTT- 3' Nedd1 mmu-miR-694 beg:395 end:415 pic:3' GAAGTCCGTTGT-----AAAAGTC 5'& |||||. |||||| &5' -----GGCAATTGGATTTTTTCA- 3' Nedd1 mmu-miR-697 beg:1071 end:1093 pic:3' AGAGGTGTCCTGG----TCCTACAA 5'& |.|| |.| |||.||| &5' -----ATAGAATCTGTAAGGGTGT- 3' Nedd1 mmu-miR-704 beg:841 end:862 pic:3' GATCCTCGTCT----CGTGTACAGA 5'& ||||| |.||||||. &5' ------GCAGAGAATGTACATGTT- 3' Nedd1 mmu-miR-759 beg:60 end:82 pic:3' CAGTTTTAACAAACGTGAGACG 5'& |||. ||||||||||. || &5' -TCAGTATTGTTTGCATG--GC 3' Nedd1 mmu-miR-7b beg:150 end:171 pic:3' TGTTGTTTTAGTGTTCAGAAGGT 5'& .| |||.||| ||| |||||| &5' GC-ACAGAATACCAA-TCTTCC- 3' Nedd1 mmu-miR-871 beg:185 end:208 pic:3' GTACTGACCGT--GATT--AGACTTAT 5'& || .|| |||||||. &5' -------GGATCTTTATTTTCTGAATG 3' Nedd1 mmu-miR-873 beg:1181 end:1195 pic:3' TCCTCTGAGTGTTCAAGGACG 5'& ||||||.|||. &5' ----------CAAGTTTCTGT 3' Nedd1 mmu-miR-9 beg:946 end:965 pic:3' AGTATGTCGATCTATTGGTTTCT 5'& || |. ||||||| &5' -------GCCTCTTGCCCAAAGA 3' Nedd1 mmu-miR-433star beg:920 end:936 pic:3' CTTATTACTGTCCGAGTGGCAT 5'& |.| |||||||| &5' -------GGCTA-CTCACCGT- 3' Nedd1 mmu-miR-669f beg:1333 end:1357 pic:3' TATGCACACACACATACATATAC 5'& ||| |||| |||.||| &5' ATAGGTGTATATAT-TGTGTAT- 3' Nedd1 mmu-miR-466f-3p beg:1338 end:1357 pic:3' CACACATACACACACACATAC 5'& |||||| ||||||| &5' --GTGTATATAT-TGTGTAT- 3' Nedd1 mmu-miR-466f-3p beg:746 end:761 pic:3' CACACATACACACACACATAC 5'& ||||| ||||||| &5' -------TGTGT-TGTGTAT- 3'

DNA & RNA Element - miRNAMap Gene Name Mature miRNA Target Start Target End miRNA 3-5 Alignment Target 5-3 Nedd1; Nedd-1 mmu-let-7i 97 121 -UGUCGUGUUUGAUGA--UGGAGU :||||||: ||||:| |:||| UGCAGCACGCACUAUUCCAUCUCU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-101a 768 793 GAAGUCAAUAGUGUCA--UGACAU- ||| ||:||||| :||||: UUUCUCUAAUUACAGUGUGCUGUGA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-101b 766 793 -GAAGUCGA-UAGUGUCA--UGACAU- |||: || ||:||||| :||||: ACUUUCUCUAAUUACAGUGUGCUGUGA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-106a 777 804 -AUGG-ACGUGACAA---UCGUGAAAC ||| ||::|||| |||||||| UUACAGUGUGCUGUGAACAGCACUUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-106b 782 804 UAGACGUGACA---GUCGUGAAAU ||::|||| ||||||||| --GUGUGCUGUGAACAGCACUUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-107 865 893 ACU--AUCGGGACAUGUU-AC-GACGA- || |:||| ||| || || ||||| GGAGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-10a 1126 1147 GUGUUUAAGCCUAGAUGUCC-CAU- |||| :||| ||||| ||| -CCAAAAGUGGA---ACAGGAGUAA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-126-3p 498 522 -CGUAAUAA---UGAGUGCCAUGCU |||||:| |: ||:||||| UGCAUUGUACAGAUACAUGGUACC- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-129-3p 887 928 UACGAA----------AAAC---CCC------AUUCCCGAA |||| |||| ||| ||:||||| CUGCUGGAACCUACACUUUGAUAGGGCUGGACUAGGGGCUA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-133a 910 929 UGUCGACCAACUUCCCCUGGUU :||||| ||||| |:| -GGGCUGGACU-AGGGG-CUAC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-133b 910 929 AUCGACCAACUUCCCCUGGUU :||||| ||||| |:| GGGCUGGACU-AGGGG-CUAC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-140* 872 895 AGGCACCA--AGAUGGGACACCAU ||||| |||:||: ||| GCCGUGUUCAUCUGCCUGCUGGA- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-143 865 886 ACUCGA-UGUCACGAAGUAGAGU ||||| :| ||| ||||||| GGAGCUGGCCGUG-UUCAUCUG- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-148a 958 981 UGUUUCAAGACAU--CACGUGACU ||||| ||| |||:||| CCAAAGAUCUCAACUGUGUACUU- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-148b 778 802 -UGUUUCAAGACACUA--CGUGACU |||: || |||||| ||||| UACAGUGUGCUGUGAACAGCACUU- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-149 1130 1150 CCUCACUUCUGUGCCUCGGUCU- ||||:| ||| ||||: ||| -AAGUGGA-ACA-GGAGUAAGAC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-153 483 503 CUAGUGAAAACACUGAUACGUU ||:||||| ||| |||| --ACAUUUUUGAAACUUUGCAU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-15b 851 894 -ACAU---------------UUGGUACUAC---AC-GACGAU |||| ::||:|| || |||||: AUGUACAUGUUGGCGGAGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUGG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-16 871 894 GCGGUUAUAAAUGCAC-GACGAU- |||: |:|| |: || |||||: GGCCG-UGUUCAUCUGCCUGCUGG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-17-5p 775 804 -UGAUGG-ACGUGACAU---UCGUGAAAC |:||| ||::||||: |||||||| AAUUACAGUGUGCUGUGAACAGCACUUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-185 790 810 -CUUGACG-GAAAGAGAGGU |||| || |||||| ||| UGAACAGCACUUUCUAUCCU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-194 510 537 AGGUGUACCUC---AACGA---CAAUGU :|||||| |||: ||||| -AUACAUGGUACCUUUGUUCUGGUUACC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-195 871 894 -CGGUUAUAA--AGACACGACGAU- |||: |:|| |||| |||||: GGCCG-UGUUCAUCUGC-CUGCUGG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-19b 62 107 -AGUCA----AAACGU------------ACCUAAA----CGUGU ||||| |||||| ||||||| ||||: AUCAGUAUUGUUUGCAUGGCCUUGAAAGUGGAUUUUGCAGCACGC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-206 986 1016 GGUGU-GUGAAGG------AAUGUAAGGU- :||| | |||| ||:| ||||| GUACAUCUGUUCCCCACUUUUGCUUUCCAG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-20a 777 804 GAUGG-ACGUGAUAU---UCGUGAAAU ||| ||::||:|: |||||||| UUACAGUGUGCUGUGAACAGCACUUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-20b 777 804 -AUGG-ACGUGAUACU---CGUGAAAC ||| ||::||:||| ||||||| UUACAGUGUGCUGUGAACAGCACUUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-210 779 801 AGUCG-GCGACAG-UGUGCGUGUC |||: :||||| ||| |||| ACAGUGUGCUGUGAACA-GCACU- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-214 871 894 GACGG-ACAGAC--ACGGACGACA ||| |||: ||||||||| -GGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUGG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-22 1185 1214 UGUCAA--------GAAGUUGACCGUCGAA |||| |||: :|||||||| -AAGUUUCUGUGGCCUUUUCUUGGCAGCUA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-221 1010 1044 UUUGGGUCG----UCUG---------UUACAUCGA- :|||| |||: ||||||||| --UUCCAGGAUCAAGAUGUUUACUAAAAUGUAGCUU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-27a 862 897 -CGCCUUGAAUCGG--------------UGACACUU- |||||:| |:||| :||| ||| GGCGGAGC-UGGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUG-GAAC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-28 779 812 GAGUUAUCUGACACU---CG--------AGGAA- ||:|: :|||||| || ||||| -ACAGUGUGCUGUGAACAGCACUUUCUAUCCUUA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-291a-3p 78 106 -CCGUGUGUUUCACCU------UCGUGAAA ||| : |||||||| ||||| UGGCCUUGAAAGUGGAUUUUGCAGCACG-- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-291a-5p 864 910 -UCUCUCCCGGA----------GG-------------UGAAACUAC :||| |||| || |||||||| CGGAGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUGGAACCUACACUUUGAUA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-293 1 15 UGUGAUGUUUGAGACGCCGUGA |:|||||| ||||| -------AGACUCUG-GGCACC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-296 906 928 -UGUCCUAACUCCC-CCCCGGGA |:|||: ||: |||||: GAUAGGGCUGGACUAGGGGCUA- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-297 497 517 GUACGUGUACGUGUGUAUGUA- ||||: ||:||| |||||| -UUGCAU-UGUACAGAUACAUG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-297b 873 903 UGUACAAGU--ACG--UGUGU----AUGUA |:|||||| ||| :| : |||| CCGUGUUCAUCUGCCUGCUGGAACCUACAC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-298 861 889 -CCUUCUUG-UCGG---GAGGAGACGG- || :||:| :||| :|| |||||| UGGCGGAGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-301b 486 509 ACGAAACUGUU-AUGGUAACGUGAC :||||| | |||||:|| -UUUUUGAAACUUUGCAUUGUACA- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-302 1392 1417 AGUGGUUUUGUACCU----UCGUGAAU |||: |||||| |||||| ACACUUGU-CAUGGAUUUAAGCACUG- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-302b 1393 1417 GAUGAUUUUGUACCU----UCGUGAA ||| |||||| |||||| -CACUUGU-CAUGGAUUUAAGCACUG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-302c 1392 1417 GGUGACUUUGUACCU----UCGUGAAC |||| |||||| |||||| ACACUUGU-CAUGGAUUUAAGCACUG- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-302d 1391 1417 -UGUGAGUUUGUACCU----UCGUGAA |||||: |||||| |||||| AACACUUGU-CAUGGAUUUAAGCACUG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-30a-5p 1009 1032 GAAGGUCAGCUC-CUACAAAUGU |||||| ||||||||| UUUCCAGGAUCAAGAUGUUUACU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-30b 25 48 UCGACUCACAUCCUACAAA---UGU- ||||| |||||||||| :|| --AUGAGU-UAGGAUGUUUCUGGCAA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-30c 19 48 CGACU---CUCACAUCCUACAAA---UGU- :|| |||| |||||||||| :|| UUUGUUAUGAGU-UAGGAUGUUUCUGGCAA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-30e 1010 1032 -AGGUC--AGUUCCUACAAAUGU ||||| |||| ||||||||| UUCCAGGAUCAA-GAUGUUUACU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-31 866 890 GUCGAUACGGUC---GUAGAACGGA- ||||: |||: ||||| |||| GAGCUG-GCCGUGUUCAUCU-GCCUG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-324-5p 158 184 -GUGGUUAC-GGGAU--CCCCUACGC :|||||| :|||| ||||| |: AUACCAAUCUUCCUAGUGGGGAAGUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-328 890 929 UGCCU--------------UCCCG-UCUC--UCCCGGUC :||| ||||| :|| :||||:| CUGGAACCUACACUUUGAUAGGGCUGGACUAGGGGCUAC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-331 907 927 AAGAUCCUAUCCGGGUCCCCG- ||||: || |:|||||| --AUAGGGCUGGACUAGGGGCU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-337 830 874 -UUUCCG--UAGUA---------------UAU---CCUCGACUU |||||: ||||| :| |||||||: UAAAGGUUCAUCAUGCAGAGAAUGUACAUGUUGGCGGAGCUGGC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-338 859 896 -AGUUGUUUU----------AGU-GACU-ACGACCU- |:::|::|: ||| ||| ||||||| GUUGGCGGAGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUGGAA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-339 909 926 ACUCGAGGACCUCCUG-UCCCU- |:||| |||| ||||: AGGGCU------GGACUAGGGGC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-34b 60 85 GUUAGUCG--AUUAAUGUGACGGAU ||||||: |: ||:||: |||| GAAUCAGUAUUGUUUGCAUGGCCUU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-34c 862 890 -CGUUAGUCGAUUGAU----GU-GACGGA- ||:: ||||::| || |||||| GGCGG--AGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCUG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-351 909 933 GUCCGAGUU---UCCCGAGGAGUCCCU :|||| :| :||||| |||| AGGGCUGGACUAGGGGCUACUCAC--- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-376c 736 756 GCACUU-UAAAGGAGAUACAA- || |||||:|||:|||| --AGAUUAUUUCUUCUGUGUUG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-377 1165 1184 UGUUUUCA-ACGGAAACACACUA :||||| ||: ||||||| -AGAAAGUCUGU--UUGUGUGU- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-378 9 37 -UGUGUC-CUGGAC----CUCAGUCCUC :||| ||::|| ||||:|||| GGCACCUUGAUUUGUUAUGAGUUAGGAU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-410 726 760 -UUGUCCGGU-----------AGACACAAUAUAA ||||||| ||||||||:|:| UAACAGGCAUAGAUUAUUUCUUCUGUGUUGUGUA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-411 857 881 UGACUCCCAA-UC-ACCUGGCACAA- || || || ||| ||||||| -AUGUUGGCGGAGCUGG-CCGUGUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-422b 1214 1243 -CCGGAAG---ACUGAG----GUUCAGGUC |||| |||||: ||||||| UGGCCGCAUUAUGACUUGUAACAAGUCCC- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-423 904 928 GACUC-CCCGGAGUCUGG--CUCGA- ||| ||||: :|||: |:||| UUGAUAGGGCU--GGACUAGGGGCUA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-429 41 73 UGCCGUA------AUG-GUCU--GUCAUAAU- :|||| ||| |:|| |||||||: CUGGCAACUAUAAUACACGGAAUCAGUAUUGU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-433-3p 1206 1229 -UGUGGCUCCUCGG-GUAGUACUA :|| | :||| |||:|||| GGCAGCUAU-GGCCGCAUUAUGAC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-433-5p 848 879 -CUUAUU------ACUGUC-CGAGUGGCAU- ||||: ||:|:| ||| :||||: AGAAUGUACAUGUUGGCGGAGCUGGCCGUGU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-449 866 889 UGGUCGAUUGUUAU--GU-GACGGU ||||::| :|: || ||||| --GAGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-449b 866 890 GGUCGAUCGUUACGU---GACGGA- ||||:|| :||: |||||| -GAGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCUG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-450b* 982 1001 UACGUACGUUUU-ACAAGGGUUA :|||:| ||||||| --AUAUGUACAUCUGUUCCCC-- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-463 305 342 -ACUACCUGUU---------GUUUA-----AUCCAU- |||||||||| ||||| |||||| UUGAUGGACAAAUUGUAUUCCAAAUUUUUUUAGGUAG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-465-3p 68 88 AGAUGAAUCUUUCCGGGACUAG | || ||||:||| -AUUGUUUGCAUGGCCUUGAA- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-468 90 131 GUCUG------UGUGCGUG------------UAGUCAGUAU :||: :||||||| :|||| ||| UGGAUUUUGCAGCACGCACUAUUCCAUCUCUGUCAGACAUU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-486 173 192 GAGCCCCGUCGAGUCAUGUCCU- :|||| || ||| |||||| -GUGGGGAAG-UCA--ACAGGAU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-491 982 1005 GGAGUACCUUCC--CAAGGGGUGA- :||| |||||||||| --AUAUGUACAUCUGUUCCCCACUU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-495 1 26 UUCU----UCACGUGGUAC-AAACAAA ||| :| ||||| || |||||| -AGACUCUGG-GCACCUUGAUUUGUUA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-497 774 792 AUGUUUGGUGUCACACGACGAC ||::|||||||||||: ---UAAUUACAGUGUGCUGUG- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-501* 1076 1097 GUUUAGGAACGGGCCCACGUAA- :|||| ||: |||||:||| AGAAUC--UGUAAGGGUGUAUUU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-503 862 897 -CGUCAUGACAA------------GGGCGACGAU- ||:| :||| ||:|||| | GGCGGAGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUGGAAC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-505 845 867 -UCUUUUGGUCGUUCACAACUGC- |||:||: |:| |||||:|| CAGAGAAU--GUACAUGUUGGCGG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-546 1 16 -CUGAGGCACGGUGGUA |||||:| | |||| AGACUCUG-GGCACCU- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-665 865 895 AUUCC-CUGG-------AGUCGGAGGACCA :|| |:|| || |||| |||| GGAGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUGGA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-666 1194 1222 -CCGAGAG------UGUCGACACGGGCGA ||| ||: :||||| || |||| UGGC-CUUUUCUUGGCAGCUAUGGCCGCA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-672 150 170 GUGUGUGUCAUGUGGUUGGAGU :||||| |:|||||:||: --UGCACAGAAUACCAAUCUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-674 100 124 AUGUG-GUGA--GGGUAGAGUCACG :||| |||| :||||||| || AGCACGCACUAUUCCAUCUCUGUC- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-674* 834 873 AACAAGA-------CUCU----------ACC--CUCGACAC |||| |||| ||| |||||| -GGUUCAUCAUGCAGAGAAUGUACAUGUUGGCGGAGCUGG- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-675-5p 1190 1226 UGACACCCGGGAAA--------------GGCGUGGU- |||| ||||:||| |||||::| UCUGU-GGCCUUUUCUUGGCAGCUAUGGCCGCAUUAU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-679 1234 1254 UGGUUCUCAGUGGAGUGU-CAGG || |||| |||:||| ||| -ACA--AGUCCCCUUACAUGUCA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-682 1145 1168 GUCUGAAGUGA--CACUGACGUC- ||||||: |||||| ||| AAGACUUUUCCAAGUGACU-CAGA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-686 164 187 -AGAAGUGG-CAGACCCUUC-GUUA ||||| |: || |||||| ||| AUCUUC-CUAGUG-GGGAAGUCAAC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-687 1004 1024 AGUAACGACGUAAGGUCCUA--UC- ||||| ||||||||| || --UUUGCU---UUCCAGGAUCAAGA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-689 159 181 CCUGGGGC---GGCUCGCCCCUGC ||| || ||:||||| -UACCAAUCUUCCUAGUGGGGAA- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-693-3p 867 894 AAUG-UCGGU----GUAGACUUUCGACG :| :|||: |||||| |||| -AGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUGG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-695 940 969 -AAGU-CAGUGGAU-ACGGGU---UAGA- ||| |||:||| |||||| |||| AUUCUUGUCGCCUCUUGCCCAAAGAUCUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-697 1007 1029 AGAGGUGUCCUGGUCCUACAA- ||:: |||||:|| |||||| GCUUUCCAGGAUCAAGAUGUUU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-699 865 890 GCUCGGUCCAGCGU-----GACGGA- ||||: || ||: |||||| GGAGCU-GGCCGUGUUCAUCUGCCUG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-704 832 863 GAUCCU-------CGUCU----CGUGUACAGA ||| ||||| |:||||||: -AAGGUUCAUCAUGCAGAGAAUGUACAUGUUG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-706 25 44 AAAAAACUCUGUCC--CAAAGAGA |||| ||| |||||| ----AUGAGUUAGGAUGUUUCUG- Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-710 1207 1233 GAGUUGAGA--GGGGUU---CUGAACC ||:|| || || |||||| -GCAGCUAUGGCCGCAUUAUGACUUGU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-718 861 897 GCUGUG--GGCCGGCCCG-------------CCUUC |:|: |:||||| |: |||| UGGCGGAGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUGGAAC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-761 874 894 ACAC-AGUCAAAGUGGGACGACG ||| ||| || ||||||| CGUGUUCA---UCUGCCUGCUGG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-763 884 918 -CGG-UGACCAAGAAGGG------------UCGACC- ||| :|||| ||: :||||| UGCCUGCUGGAA---CCUACACUUUGAUAGGGCUGGA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-764-3p 1180 1204 UGUCAACGGU-----GAUACCGGAGGA- ||:|| ||:||||||::| ----GUGUCAAGUUUCUGUGGCCUUUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-7b 152 172 UUGUUUUA-GUGUUCAGAAGGU |||:||| | ||| |||||| CACAGAAUAC-CAA-UCUUCCU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-804 907 934 AGGUCCA---CU---CCUUGUUGAGUGU :||| || ||::| |||||| -AUAGGGCUGGACUAGGGGCUACUCACC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-93 882 908 -GAUGGACGUGCUUGUC-GUGAAAC- ||:||||| |||| ||||||| UCUGCCUGCUGGAACCUACACUUUGA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-99a 906 926 -UGUUCUAGCCUAGAUGCCCA |:|:|: :||| ||| ||| GAUAGGGCUGGA-CUAGGGGC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-106a 796 803 -----------------AUGG-ACGUGACAA---UCGUGAAAC ||| || |||| |||||||| CAUUAACUUUCUCUAAUUACAGUGUGCUGUGAACAGCACUUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-106b 796 803 UAG-------------------ACGUGACA---GUCGUGAAAU || |||| ||||||||| CAUUAACUUUCUCUAAUUACAGUGUGCUGUGAACAGCACUUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-129-3p 580 587 UAC----------GAAAAACCCCA-----------UUCCCGAA :|||| |||| ||||||| UAUAUAUAUAAUUUUUUUAAGGGUUUGGAAGAUUCAAGGGCUA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-17-5p 796 803 ---------------UGAUGG-ACGUGACAU---UCGUGAAAC |:||| || ||||: |||||||| CAUUAACUUUCUCUAAUUACAGUGUGCUGUGAACAGCACUUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-200c 64 71 -------------------GGUAGUAAUGGGCC---GUCAUAAU |:|| ||| ||| |||||||: GUUAGGAUGUUUCUGGCAACUAUAA-UACACGGAAUCAGUAUUGU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-20a 796 803 ----------------GAUGG-ACGUGAUAU---UCGUGAAAU :||| || ||:|: |||||||| CAUUAACUUUCUCUAAUUACAGUGUGCUGUGAACAGCACUUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-20b 796 803 -----------------AUGG-ACGUGAUAC---UCGUGAAAC ||| || ||:|| |||||||| CAUUAACUUUCUCUAAUUACAGUGUGCUGUGAACAGCACUUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-214 886 893 ------------------GAC-GG-ACAGAC--ACGGACGACA ||| || |||: ||||||||| AUGUACAUGUUGGCGGAGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUGG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-22 1206 1213 UGU---------------------CAAGAAGUUGACCGUCGAA | |||: :|||||||| UCUGUUUGUGUGUCAAGUUUCUGUGGCCUUUUCUUGGCAGCUA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-221 1035 1042 UUU--------GGGUCG----UCUG---------UUACAUCGA :|||| |||: ||||||||| CACUUUUGCUUUCCAGGAUCAAGAUGUUUACUAAAAUGUAGCUU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-222 1035 1042 C--------------UCUGGGU---CAUC-GGUC-UACAUCGA :||:| || |:| |||||||| CACUUUUGCUUUCCAGGAUCAAGAUGUUUACUAAAAUGUAGCUU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-291a-3p 795 802 C---------------------CGUGUGUUUCACCU-UCGUGAAA |:: | ||| |||||||| UCAUUAACUUUCUCUAAUUACAGUGUGCU--GUGAACAGCACUUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-291a-5p 902 909 UCUCUCCCGGAG-----------------------GUGAAACUAC || |||| ||||||||| --AGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUGGAACCUACACUUUGAUA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-291b-5p 902 909 CUCUCCCGGAG-----------------------GUGAAACUAG || |||| ||||||||| -AGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUGGAACCUACACUUUGAUA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-295 795 802 UCU--------GAGUUUUCA-UCA-----------UCGUGAAA ||| ||| |||||||| UCAUUAACUUUCUCUAAUUACAGUGUGCUGUGAACAGCACUUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-302 795 802 -----------------AGUGGUUU-UGUAC-CU--UCGUGAAU |:|| :| || || ||||||| UCAUUAACUUUCUCUAAUUACAGUGUGC-UGUGAACAGCACUUU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-302b 1409 1416 GA------------------UGAUUUUGUACC----UUCGUGAA ||| ||||| ||||||| AGCAUGUAUAUAGGUAAAACACUUGU-CAUGGAUUUAAGCACUG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-302d 1409 1416 ------------------UGUGAGUUUGUACC----UUCGUGAA |||||:: ||||| ||||||| AGCAUGUAUAUAGGUAAAACACUUGU-CAUGGAUUUAAGCACUG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-30a-5p 1024 1031 --------------------GAAGGUCAGCUC-CUACAAAUGU :|||||| ||||||||| CAUCUGUUCCCCACUUUUGCUUUCCAGGAUCAAGAUGUUUACU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-30d 1024 1031 --------------------GAAGGUCAGCCC-CUACAAAUGU :|||||| ||||||||| CAUCUGUUCCCCACUUUUGCUUUCCAGGAUCAAGAUGUUUACU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-30e 1024 1031 ----------------------AGGUC--AGUUCCUACAAAUGU ||||| |||| ||||||||| CAUCUGUUCCCCACUUUUGCUUUCCAGGAUCAA-GAUGUUUACU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-31 952 959 G-----UCGAU-----------------ACGGUCGUAGAACGGA :|||| ||:| || ||||||| ACUAGGGGCUACUCACCGUUUAUAUUCUUGUC-GCCUCUUGCCC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-429 64 71 U------------GCCGUA------AUG-GUCU--GUCAUAAU :|||| ||| |:|| |||||||: GUUAGGAUGUUUCUGGCAACUAUAAUACACGGAAUCAGUAUUGU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-433-5p 929 936 CUUAUU-----ACUGUCC----------------GAGUGGCAU |||:||| |||||||| AACCUACACUUUGAUAGGGCUGGACUAGGGGCUACUCACCGUU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-491 996 1003 -----------------GGAGUACCUUCC----CAAGGGGUGA |:|:|| |||||||||| AAGAUCUCAACUGUGUACUUUAUAUGUACAUCUGUUCCCCACUU Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-673 786 793 --------------------GAGGUUCCUGGUCU--CGACACUC |||:|| ||| ||||||| UGUUGUGUAUCAUUAACUUUCUCUAAUUA-CAGUGUGCUGUGAA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-761 886 893 AC-----ACAGUCA-------------AAGUG---GGACGACG ||| | ||||: ||||||| AUGUACAUGUUGGCGGAGCUGGCCGUGUUCAUCUGCCUGCUGG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-93 796 803 ----------------GAUGG---AC-GUGCUUGUCGUGAAAC :||| || : |||||||||||| CAUUAACUUUCUCUAAUUACAGUGUGCUGUGAACAGCACUUUC Nedd1; Nedd-1 mmu-let-7i 98 120 uGUCGUGUUUGAU--GAUGGAGu ||||||: |||| | |:||| gCAGCACGCACTATTCCATCTCt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-101b 767 791 GAAGUCGA-UAGUGU--CAUGACAu |||: || ||:||| ||:|||| CTTTCTCTAATTACAGTGTGCTGTg Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-106a 778 803 AUG-GACGUGACA---AUCGUGAAAc ||| ||::|||| |||||||| TACAGTGTGCTGTGAACAGCACTTTc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-106b 780 803 uagACGUGACA---GUCGUGAAAu ||::|||| ||||||||| cagTGTGCTGTGAACAGCACTTTc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-107 867 891 aCUAUCGGGACAUGU-UAC-GACGA | |:||| ||| || || ||||| aGCTGGCCGTGTTCATCTGCCTGCT Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-10a 1125 1145 guGUUUAAGCCUAGAUGUCC-CAU |||| :||| ||||| ||| tcCAAAAGTGGA---ACAGGAGTA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-126-3p 499 522 CGUAAUA---AUGAGUGCCAUGcu |||||:| |: ||:||||| GCATTGTACAGATACATGGTACct Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-129-3p 562 587 uacgaaAAACC--CCA--UUCCCGAa ||||| | | ||||||| taagggTTTGGAAGATTCAAGGGCTa Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-129-3p 899 927 uacGAAA--AACC---CC--AUUCCCGAa |||| | || || ||:||||| acaCTTTGATAGGGCTGGACTAGGGGCTa Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-133a 907 928 UGUCGACCAACUU--CCCCUGGUu |:|| || ||:| |||:|:| ATAG--GGCTGGACTAGGGGCTAc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-133b 908 928 AUCGACCAACUU--CCCCUGGUu ||| || ||:| |||:|:| TAG--GGCTGGACTAGGGGCTAc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-140* 872 895 aGGCACCA--AGAUGGGAC-ACCau ||||| | |||: |||| ||| gCCGTGTTCATCTG-CCTGCTGGaa Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-143 865 886 aCUCGA-UGUCACGAAGUAGAgu ||||| :| ||| ||||||| gGAGCTGGCCGTG-TTCATCTgc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-148a 958 981 uGUUUCAAGACAU--CACGUGAcu ||||| ||| | |||:||| cCAAAGATCTCAACTGTGTACTtt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-148b 779 802 UGUUUCAAGACACU--ACGUGAcu |||: || |||||| ||||| ACAGTGTGCTGTGAACAGCACTtt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-149 1129 1148 ccUCACUUCUGUGCCUCGGUCU ||||:| ||| ||||: ||| aaAGTGGA-ACA-GGAGTAAGA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-153 481 502 cuaGUGAAAACACUGAUACGUu ||:||||| ||| |||| ataCATTTTTGAAACTTTGCAt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-15b 867 892 acauuuGGUAC---UACAC-GACGAu ||:|| || || ||||| agctggCCGTGTTCATCTGCCTGCTg Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-17-5p 776 803 UGAUG-GACGUGACAU---UCGUGAAAc |:||| ||::||||: |||||||| ATTACAGTGTGCTGTGAACAGCACTTTc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-185 791 809 CUUGACG-GAAAGAGAGGu |||| || |||||| ||| GAACAGCACTTTCTATCCt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-194 509 536 aggUGUACC-U--CAAC--GA-CAAUGu |||||| | ||| || ||||| gatACATGGTACCTTTGTTCTGGTTACc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-195 872 892 CGGUUAUAAAGACAC-GACGAu ||| :|:|| | || ||||| GCC-GTGTTCATCTGCCTGCTg Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-19b 63 102 AGUCA----AAACGU------------ACCU-AAACGUgu ||||| |||||| |||| |||||| TCAGTATTGTTTGCATGGCCTTGAAAGTGGATTTTGCAgc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-200c 48 71 GGUAGUAAUGGGCC---GUCAUAAu |:|| | ||| ||| ||||||| CTAT-AATACACGGAATCAGTATTg Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-206 995 1014 gguGUGUGAAGGAAUGUAAGGU | ||||| ||:| ||||| ttcCCCACTT--TTGCTTTCCA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-20a 777 803 gAUG-GACGUGAUAU---UCGUGAAAu ||| ||::||:|: |||||||| tTACAGTGTGCTGTGAACAGCACTTTc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-20b 778 803 AUG-GACGUGAUAC---UCGUGAAAc ||| ||::||:|| |||||||| TACAGTGTGCTGTGAACAGCACTTTc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-210 779 801 aGUCG-GCGACAGUGUG-CGUGuc |||: :||||| | || |||| aCAGTGTGCTGTGA-ACAGCACtt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-214 869 893 GA-CGG-AC-AG-ACACGGACGACa || ||| || || | ||||||||| CTGGCCGTGTTCATCTGCCTGCTGg Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-22 1192 1213 ugucaaGAAGUUGACCGUCGAa |||: :|||||||| tgtggcCTTTTCTTGGCAGCTa Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-222 1014 1042 cuCUGGGUC-----AUCGGUCUACAUCGA ||:| || || : | |||||||| agGATCAAGATGTTTACTAAAATGTAGCT Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-27a 889 908 CG-CCUUGAAUCGGUGACACUu || ||||| || |||| ||| GCTGGAACCTA--CACTTTGAt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-28 778 802 gaGUUAUCUGACAC---UCGAGGAA ||:|: :||||| ||| |:|| taCAGTGTGCTGTGAACAGCACTTT Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-291a-3p 774 802 ccgugUGUUUCAC----CU--UCGUGAAA |||: ||| || |||||||| taattACAGTGTGCTGTGAACAGCACTTT Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-291a-3p 79 107 CCGUGUGUUUCACCU------UCGUGaaa ||| : |||||||| ||||| GGCCTTGAAAGTGGATTTTGCAGCACgca Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-291a-5p 886 909 ucucucCC--GGAGGUGAAACUAc || ||| ||||||||| cctgctGGAACCTACACTTTGATa Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-291b-5p 887 909 cucucCC--GGAGGUGAAACUAg || ||| ||||||||| ctgctGGAACCTACACTTTGATa Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-295 768 802 ucuGAGUUU----UCAU----CA----UCGUGAAA ||| || |||: || |||||||| tttCTCTAATTACAGTGTGCTGTGAACAGCACTTT Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-296 907 928 UGUCCU-AACUCCCCCCCGgga |:|||: | || ||||| ATAGGGCTGGACTAGGGGCtac Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-297 496 515 guACGUGUACGUGUGUAUGUA ||||: ||:||| |||||| ttTGCAT-TGTACAGATACAT Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-298 862 887 CCUUCUUG-UCGG---GAGGAGACGG || :||:| :||| :|| |||||| GGCGGAGCTGGCCGTGTTCATCTGCC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-301b 485 504 acgAAACUGUUAUGGUAACGUGAC ||||| || | |||||:|| attTTTGA-AA---CTTTGCATTG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-302 770 802 AGUGGUU-UUGU------AC-CU--UCGUGAAu || |:|| ||| || || ||||||| TCTCTAATTACAGTGTGCTGTGAACAGCACTTt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-302 1392 1417 aGUGGUUUUGUACC----UUCGUGAau |||: : ||||| ||||||| aCACT-TGTCATGGATTTAAGCACTga Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-302b 1391 1416 gaugauuuuGUACC----UUCGUGAa ||||| ||||||| aacacttgtCATGGATTTAAGCACTg Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-302c 1392 1417 gGUGACUUUGUACC----UUCGUGAac |||| : ||||| ||||||| aCACT-TGTCATGGATTTAAGCACTga Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-302d 1392 1416 UGUGAGUUUGUACC----UUCGUGAa |||||: : ||||| ||||||| ACACTT-GTCATGGATTTAAGCACTg Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-30a-5p 1009 1031 gAAGGUC--AGCUCCUACAAAUGu |||||| || | ||||||||| tTTCCAGGATC-AAGATGTTTACt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-30b 23 43 ucgACUCACAUCCUACAAAugu ||||| |||||||||| ttaTGAGT-TAGGATGTTTctg Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-30c 22 43 CGACUCUCACAUCCUACAAAugu |:| |||| |||||||||| GTTATGAGT-TAGGATGTTTctg Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-30d 1009 1031 gAAGGUC--AGCCCCUACAAAUGu |||||| || ||||||||| tTTCCAGGATC-AAGATGTTTACt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-30e 1011 1031 AGGUC--AGUUCCUACAAAUGu ||||| |||| ||||||||| TCCAGGATCAA-GATGTTTACt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-31 940 959 gucGAUACGGUCGUAGAACGGa || ||:| || ||||||| attCT-TGTC-GCCTCTTGCCc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-324-5p 159 183 gUGGUUA-CGGGAU--CCCCUACgc |||||| :|||| ||||| | tACCAATCTTCCTAGTGGGGAAGtc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-328 903 928 ugcCU-UCCCG-UCU--CUCCCGGUc || ||||| :|| :||||:| tttGATAGGGCTGGACTAGGGGCTAc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-331 905 925 aagAUCCUAUCCGGGUCCCCG ||||: || |:|||||| tgaTAGGGCTGGACTAGGGGC Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-337 849 873 uUUCCGUAGUAUA---UCCUCGACuu || |:| |||:| ||||||| gAATGTA-CATGTTGGCGGAGCTGgc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-338 870 894 aguuguuuuAGU-GAC-UACGACCU ||| ||| ||||||| tggccgtgtTCATCTGCCTGCTGGA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-339 883 913 acucGAGGACCU----------CCUGUCCCu || ||||| ||:|||| ctgcCTGCTGGAACCTACACTTTGATAGGGc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-34c 863 888 CGUUAGUCGAUUG----AUGU-GACGGA ||:: ||||::| | || |||||| GCGG--AGCTGGCCGTGTTCATCTGCCT Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-351 900 925 GUCCGAGUUUCCCGA--GGAGUCCCu || :| | |||||| || :||| CACTTTGATAGGGCTGGACTAGGGGc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-376c 735 754 gcacuuUAAAGGAGAUACAA |||||:|||:|||| tagattATTTCTTCTGTGTT Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-377 1163 1184 uGU-UUUCA-ACGGAAACACACua || ||||| || |||||||| tCAGAAAGTCTG--TTTGTGTGtc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-378 10 36 uGU-GUCCUGGAC----CUCAGUCCUc || | ||::|| ||||:|||| gCACCTTGATTTGTTATGAGTTAGGAt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-410 727 759 UUGUCCG-----------GUAGACACAAUAUAa ||||||| | ||||||||:|:| AACAGGCATAGATTATTTCTTCTGTGTTGTGTa Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-411 859 879 ugACUCCCAAUCACCUGGCACAA ||: || || |:||||||| gtTGGCGG--AGCTGGCCGTGTT Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-422b 1215 1243 CCGG---AAGACUGAG----GUUCAGGuc |||| || |||||: ||||||| GGCCGCATTATGACTTGTAACAAGTCCcc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-423 913 938 GAC----UCCCCGGAGUCUGGCucga ||| ||||||: | |||| CTGGACTAGGGGCTACTCACCGttta Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-433-3p 1207 1228 uGUGGCUCCUCGG-GUAGUACUa || | | | ||| |||:|||| gCAGCTATG-GCCGCATTATGAc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-433-5p 916 936 CUUAUUACUGUCCGAGUGGCAu || ||: |:| |||||||| GACTAGGGGC-TACTCACCGTt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-433-5p 855 877 cuUAUUACUGUC-CGAGUGGCAu ||: ||:|:| ||| :|||| acATGTTGGCGGAGCTGGCCGTg Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-449 864 888 uggUCGAUUGUUAU--GU-GACGGu ||||::| :|: || ||||| cggAGCTGGCCGTGTTCATCTGCCt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-449b 865 888 ggUCGAUCGUUAC--GU-GACGGA ||||:|| :|| || |||||| ggAGCTGGCCGTGTTCATCTGCCT Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-450b* 980 1002 uACGUACGU-UUUACAAGGGUUa | :|||:| | ||||||| | tTATATGTACATCTGTTCCCCAc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-463 306 340 ACUACCUGUU---------GUU-----UAAUCCAU |||||||||| ||| ||||||| TGATGGACAAATTGTATTCCAAATTTTTTTAGGTA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-465-3p 67 88 agaugAAUCUUUCCGGGACUag || | | ||||:||| tattgTTTGCATGGCCTTGAaa Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-468 99 130 GUC-UGUGUG----CGU----GUAGUCAGUAu ||| ||:||| || ::|||| ||| CAGCACGCACTATTCCATCTCTGTCAGACATt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-486 170 190 GAGC-CCCGUCGAGUCA--UGUCCU || | ||| | ||| |||||| CTAGTGGGGA----AGTCAACAGGA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-491 982 1003 ggaguaccuuccCAAGGGGUGA |||||||||| atatgtacatctGTTCCCCACT Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-495 3 25 uucuuCACGUGGUAC-AAACAAa | ||||| || |||||| actctGGGCACCTTGATTTGTTa Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-497 771 792 auGUUUGGUGUCACACGACgac | ||::||||||||||| ctCTAATTACAGTGTGCTGtga Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-503 868 892 CGUCAUG-ACAAG--GGC-GACGAu || | | ||||| |:| ||||| GCTGGCCGTGTTCATCTGCCTGCTg Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-505 846 865 UCUUUUGGUCGUUCACAACUGC |||:||: |:| |||||:|| AGAGAAT--GTACATGTTGGCG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-546 2 16 CUGAGGCACGGUGGua |||||:| | |||| GACTCTG-GGCACCtt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-665 872 894 auuCCCUGG-AGUCGGAGGACCa | | :| || |||| |||| gccGTGTTCATCTGCCTGCTGGa Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-666 1195 1221 CCG----AGAG-UGUCGACACGGGCGa ||| |||: :||||| || |||| GGCCTTTTCTTGGCAGCTATGGCCGCa Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-672 147 169 gUG-UGUGUCAUGUGGUUGGAgu || :||||| |:|||||:|| aACTGCACAGAATACCAATCTtc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-673 771 793 GAGGUUCCUGGU-CUCGACACUc |||:|| || : | ||||||| CTCTAATTACAGTGTGCTGTGAa Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-674 100 124 auGUG-GUG--AGGGUAGAGUCAcg ||| ||| |:||||||| || agCACGCACTATTCCATCTCTGTca Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-674* 851 873 aACAAG-ACUCUACCCUCGACac ||| | || : ||||||| aTGTACATGTTGGCGGAGCTGgc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-675-5p 1202 1224 uGACACC--CGGGAAAGGCGUGGU || ||| ||: | |||||::| tCT-TGGCAGCTATGGCCGCATTA Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-679 1233 1253 UGGUUCUCAGUGGAGUGU-CAGg | || |||| |||:||| ||| AACA--AGTCCCCTTACATGTCa Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-686 165 186 AGAAGUGGCAGACCCUUC-GUUa ||||| : || |||||| ||| TCTTCCTAGT-GGGGAAGTCAAc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-687 999 1020 aGUAACGACGUAAGGUCCUAuc || | :||| ||||||||| cCACTTTTGCTTTCCAGGATca Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-689 158 181 ccUGG---GGCGGCUCGCCCCUgc ||| |: || ||:||||| atACCAATCTTCCTAGTGGGGAag Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-693-3p 891 916 aaugUCGGUGU-AGAC--UUUCGACg | |:||| |:|| |::|||| tggaACCTACACTTTGATAGGGCTGg Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-695 941 964 AAG-UCAGUGGA-UACGGGUUaga ||| |||:||| ||||||| TTCTTGTCGCCTCTTGCCCAAaga Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-704 838 862 gauccuCGUCU----CGUGUACAga ||||| |:|||||| catcatGCAGAGAATGTACATGTtg Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-706 21 44 AAAAAACUCUGUCC--CAAAGAga | || |||| :||| |||||| TGTTATGAGTTAGGATGTTTCTgg Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-710 1206 1232 gaGUUGAGA--GGGG---UUCUGAACc ||:|| | || | | |||||| ggCAGCTATGGCCGCATTATGACTTGt Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-718 849 869 gcugugggccggcCCGCCUuc |||||| gaatgtacatgttGGCGGAgc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-761 868 893 acACAGUCA-AAGU-G--GGACGACg || | || |||| | ||||||| gcTGGCCGTGTTCATCTGCCTGCTGg Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-763 872 893 CGGUGACCAAGAAG--GGUCGACC |||:: |||| || || ||||| GCCGT--GTTCATCTGCCTGCTGG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-764-3p 1200 1222 ugucAACGGU-GAUACCGGAGga ||| || |||||||| | tttcTTGGCAGCTATGGCCGCat Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-804 912 933 aGGUCCACUCCUUGUUGAGUGu |::| |||::| |||||| gCTGGACTAGGGGCTACTCACc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-93 780 803 gauggACG-UGCUUGUCGUGAAAc ||| ::|||||||||||| cagtgTGCTGTGAACAGCACTTTc Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-93 883 906 GAUGGACGUGCUU-GUCGUGAAAC ||:||||| ||| | ||||||| CTGCCTGCTGGAACCTACACTTTG Nedd1; Nedd-1 mmu-miR-99a 907 925 UGUUCUAGCCUAGAUGCCCa |:|:|: :||| ||| ||| ATAGGGCTGGA-CTAGGGGc

DNA & RNA Element - RAID2 Gene Name RAID ID Interactor 1 Category 1 ID 1 Interactor 2 Category 2 ID 2 Methods Score Nedd1 RAID00006320 mmu-miR-1942 miRNA MIMAT0009407 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00056414 mmu-miR-92a-3p miRNA MIMAT0000539 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00063183 mmu-miR-290a-5p miRNA MIMAT0000366 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00074996 mmu-miR-5616-3p miRNA MIMAT0022360 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00126427 mmu-miR-543-5p miRNA MIMAT0017207 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00152619 mmu-miR-590-3p miRNA MIMAT0004896 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00153751 mmu-miR-669b-3p miRNA MIMAT0017250 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00168518 mmu-miR-7215-5p miRNA MIMAT0028398 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00228587 mmu-miR-206-3p miRNA MIMAT0000239 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID00417503 mmu-miR-30b-5p miRNA MIMAT0000130 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID00450139 mmu-miR-450a-5p miRNA MIMAT0001546 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00493123 mmu-miR-467a-3p miRNA MIMAT0002108 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00515246 mmu-miR-1199-5p miRNA MIMAT0005860 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00552981 mmu-miR-93-5p miRNA MIMAT0000540 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00579220 mmu-miR-669a-3p miRNA MIMAT0017243 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00691535 mmu-miR-544-5p miRNA MIMAT0017282 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.2202 Nedd1 RAID00717749 mmu-miR-6340 miRNA MIMAT0025083 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00718634 mmu-miR-380-3p miRNA MIMAT0000745 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00735096 mmu-miR-19b-3p miRNA MIMAT0000513 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID00740631 mmu-miR-106b-5p miRNA MIMAT0000386 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00754539 mmu-miR-6366 miRNA MIMAT0025110 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00800880 mmu-miR-92b-3p miRNA MIMAT0004899 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00854079 mmu-miR-181b-1-3p miRNA MIMAT0017067 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00868048 mmu-miR-20b-5p miRNA MIMAT0003187 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00885555 mmu-miR-466l-3p miRNA MIMAT0005830 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00885597 mmu-miR-18b-5p miRNA MIMAT0004858 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00887825 mmu-miR-363-3p miRNA MIMAT0000708 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID00950567 mmu-miR-148b-3p miRNA MIMAT0000580 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID01006877 mmu-miR-1a-3p miRNA MIMAT0000123 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID01044723 mmu-miR-181b-2-3p miRNA MIMAT0017084 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01059876 mmu-miR-384-5p miRNA MIMAT0004745 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID01096628 mmu-miR-16-5p miRNA MIMAT0000527 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID01105062 mmu-miR-20a-5p miRNA MIMAT0000529 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01186306 mmu-miR-17-5p miRNA MIMAT0000649 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01190164 mmu-miR-7237-3p miRNA MIMAT0028443 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01190904 mmu-miR-1668 miRNA MIMAT0031414 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01227360 mmu-miR-7015-5p miRNA MIMAT0027934 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01360673 mmu-miR-30a-5p miRNA MIMAT0000128 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID01376482 mmu-miR-223-5p miRNA MIMAT0017056 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01424214 mmu-miR-30d-5p miRNA MIMAT0000515 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID01430799 mmu-miR-761 miRNA MIMAT0003893 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID01457693 mmu-miR-376b-3p miRNA MIMAT0001092 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01475730 mmu-miR-152-3p miRNA MIMAT0000162 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID01481065 mmu-miR-704 miRNA MIMAT0003494 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01491736 mmu-miR-466f-3p miRNA MIMAT0004882 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01514510 mmu-miR-7229-3p miRNA MIMAT0028427 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01532947 mmu-miR-410-3p miRNA MIMAT0001091 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01536154 mmu-miR-200c-3p miRNA MIMAT0000657 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.2381 Nedd1 RAID01571699 mmu-miR-7007-5p miRNA MIMAT0027918 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01612033 mmu-miR-1969 miRNA MIMAT0009442 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01612293 mmu-miR-493-5p miRNA MIMAT0017276 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01701385 mmu-miR-467f miRNA MIMAT0005846 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01702728 mmu-miR-25-3p miRNA MIMAT0000652 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01706965 mmu-let-7g-3p miRNA MIMAT0004519 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01725062 mmu-miR-3572-5p miRNA MIMAT0022986 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01738657 mmu-miR-294-3p miRNA MIMAT0000372 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID01755419 mmu-miR-31-5p miRNA MIMAT0000538 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01770881 mmu-miR-9-5p miRNA MIMAT0000142 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID01792722 mmu-miR-6355 miRNA MIMAT0025098 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01917137 mmu-miR-326-3p miRNA MIMAT0000559 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq 0.5483 Nedd1 RAID01964779 mmu-miR-142a-5p miRNA MIMAT0000154 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID01982118 mmu-miR-290b-5p miRNA MIMAT0029900 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02017800 mmu-miR-18a-5p miRNA MIMAT0000528 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02147808 mmu-miR-491-5p miRNA MIMAT0003486 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6478 Nedd1 RAID02148843 mmu-miR-221-3p miRNA MIMAT0000669 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID02195477 mmu-miR-1192 miRNA MIMAT0005850 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02203043 mmu-miR-7683-5p miRNA MIMAT0029886 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02203951 mmu-miR-142a-3p miRNA MIMAT0000155 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02208819 mmu-miR-30e-5p miRNA MIMAT0000248 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID02225370 mmu-miR-340-5p miRNA MIMAT0004651 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02252055 mmu-miR-654-3p miRNA MIMAT0004898 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02294096 mmu-miR-383-3p miRNA MIMAT0017082 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02388197 mmu-miR-96-5p miRNA MIMAT0000541 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02394811 mmu-miR-20a-3p miRNA MIMAT0004627 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02403095 mmu-miR-690 miRNA MIMAT0003469 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02410524 mmu-miR-154-5p miRNA MIMAT0000164 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02436290 mmu-miR-1264-3p miRNA MIMAT0014803 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02675160 mmu-miR-331-3p miRNA MIMAT0000571 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq 0.5483 Nedd1 RAID02700301 mmu-miR-429-3p miRNA MIMAT0001537 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.2381 Nedd1 RAID02707914 mmu-miR-148a-3p miRNA MIMAT0000516 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID02783962 mmu-miR-367-3p miRNA MIMAT0003181 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02786416 mmu-miR-224-5p miRNA MIMAT0000671 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02787982 mmu-miR-6985-3p miRNA MIMAT0027873 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02843163 mmu-miR-338-5p miRNA MIMAT0004647 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02845626 mmu-miR-302b-3p miRNA MIMAT0003374 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID02933970 mmu-miR-129-5p miRNA MIMAT0000209 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02968699 mmu-miR-335-5p miRNA MIMAT0000766 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02971044 mmu-miR-193b-3p miRNA MIMAT0004859 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID02980894 mmu-miR-495-3p miRNA MIMAT0003456 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03002718 mmu-miR-3971 miRNA MIMAT0019356 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03069463 mmu-miR-673-5p miRNA MIMAT0003739 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03076007 mmu-miR-106a-5p miRNA MIMAT0000385 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03094220 mmu-miR-7085-5p miRNA MIMAT0028076 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03182501 mmu-miR-217-5p miRNA MIMAT0000679 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03232782 mmu-miR-22-3p miRNA MIMAT0000531 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.2202 Nedd1 RAID03247040 mmu-miR-124-3p miRNA MIMAT0000134 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03248588 mmu-miR-19a-3p miRNA MIMAT0000651 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID03285900 mmu-miR-1928 miRNA MIMAT0009391 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03305608 mmu-miR-291a-3p miRNA MIMAT0000368 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID03320459 mmu-miR-3966 miRNA MIMAT0019350 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03345095 mmu-miR-669f-3p miRNA MIMAT0005839 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03364865 mmu-miR-878-3p miRNA MIMAT0004933 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03400476 mmu-miR-669o-3p miRNA MIMAT0017347 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03403168 mmu-miR-214-3p miRNA MIMAT0000661 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID03441967 mmu-miR-223-3p miRNA MIMAT0000665 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03453649 mmu-miR-7041-5p miRNA MIMAT0027986 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03456354 mmu-miR-374c-5p miRNA MIMAT0014953 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03464117 mmu-miR-361-5p miRNA MIMAT0000704 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03475207 mmu-miR-295-3p miRNA MIMAT0000373 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID03532762 mmu-miR-222-3p miRNA MIMAT0000670 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID03566639 mmu-miR-6946-3p miRNA MIMAT0027793 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03605081 mmu-miR-125b-2-3p miRNA MIMAT0004529 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03614827 mmu-miR-302a-3p miRNA MIMAT0000380 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID03670118 mmu-miR-193a-3p miRNA MIMAT0000223 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03700227 mmu-miR-374b-5p miRNA MIMAT0003727 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03708051 mmu-miR-30c-5p miRNA MIMAT0000514 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID03717671 mmu-miR-292a-5p miRNA MIMAT0000369 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03743017 mmu-miR-32-5p miRNA MIMAT0000654 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03792553 mmu-miR-7243-3p miRNA MIMAT0029911 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03810282 mmu-miR-7652-5p miRNA MIMAT0029810 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03831190 mmu-miR-494-3p miRNA MIMAT0003182 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03868497 mmu-miR-7003-5p miRNA MIMAT0027910 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03874350 mmu-miR-200b-3p miRNA MIMAT0000233 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.2381 Nedd1 RAID03956519 mmu-miR-669a-3-3p miRNA MIMAT0017251 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID03995313 mmu-miR-3473f miRNA MIMAT0031390 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID04018805 mmu-miR-205-5p miRNA MIMAT0000238 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID04036547 mmu-miR-302d-3p miRNA MIMAT0003377 Nedd1 mRNA 17997 CLIP-seq//Prediction 0.6308 Nedd1 RAID04037938 mmu-miR-448-5p miRNA MIMAT0017176 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828 Nedd1 RAID04044448 mmu-miR-539-5p miRNA MIMAT0003169 Nedd1 mRNA 17997 Prediction 0.1828