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iUUCD ID | IUUC-Ath-006603 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Protein ID | AT3G13300.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Accession | Q9LTT8; F4JC94; Q0WLC5; Q56YT1; Q8L7N9; VCS_ARATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Protein ID | BAB02799.1; AEE75330.1; AEE75331.1; AAM91544.1; BAF02082.1; BAD93855.1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Name | Enhancer of mRNA-decapping protein 4; Protein VARICOSE | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genbank Nucleotide ID | AB024034; CP002686; CP002686; AY128341; AK230280; AK221240 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | VCS; EDC4; At3g13300; MDC11.13 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Information |
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Annotation |
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Status | Unreviewed | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Classification |
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Active Site |
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Domain Profile | S: 1 gHtdsvtclaf..sd.tllvsGsdDgtikvWDlrt 32 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Arabidopsis thaliana | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Functional Description (View) |
As a component of the decapping complex, involved in the degradation of mRNAs. Essential for postembryonic development, especially during the formation of the shoot (SAM) and root apical meristems. Required for normal patterning of internal tissues of leaves. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Sequence (Fasta) |
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Nucleotide Sequence (Fasta) |
CCCAATTTAA TATTTTCATT AAAGAAGAAG AAAAAATAGC TAAGTCTCCA AAAGTTCTCT 60
ACCTGTTCTC ACTTTCAAGT CATCATCGTC TCTCTCTCTC TATTGTTGCT CTCTCTCTCG 120 It may take some time, please wait.
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Sequence Source | Ensembl | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Keyword | KW-0025--Alternative splicing |
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Interpro | IPR032401--EDC4_WD40 |
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PROSITE | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pfam | PF16529--Ge1_WD40 |
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SMART | SM00320--WD40 |
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Gene Ontology | GO:0005829--C:cytosol |
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KEGG | ath:AT3G13300 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Orthology |
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Created Date | 25-Jun-2017 |