PTM - CPLM Gene Name UniProt ID Type Position Code UBE4A; KIAA0126 Q14139 Acetylation 386 K UBE4A; KIAA0126 Q14139 Ubiquitination 766 K UBE4A; KIAA0126 Q14139 Ubiquitination 774 K UBE4A; KIAA0126 Q14139 Ubiquitination 104 K UBE4A; KIAA0126 Q14139 Ubiquitination 317 K UBE4A; KIAA0126 Q14139 Ubiquitination 531 K UBE4A; KIAA0126 Q14139 Ubiquitination 810 K UBE4A; KIAA0126 Q14139 Ubiquitination 468 K UBE4A; KIAA0126 Q14139 Ubiquitination 478 K UBE4A; KIAA0126 Q14139 Ubiquitination 185 K UBE4A; KIAA0126 Q14139 Ubiquitination 190 K UBE4A; KIAA0126 Q14139 Ubiquitination 487 K UBE4A; KIAA0126 Q14139 Ubiquitination 451 K UBE4A; KIAA0126 Q14139 Ubiquitination 33 K

PTM - dbPAF Gene Name UniProt ID Position Type Species UBE4A; KIAA0126 Q14139 1034 S Homo sapiens(Human) UBE4A; KIAA0126 Q14139 11 S Homo sapiens(Human) UBE4A; KIAA0126 Q14139 12 S Homo sapiens(Human) UBE4A; KIAA0126 Q14139 313 Y Homo sapiens(Human) UBE4A; KIAA0126 Q14139 46 S Homo sapiens(Human) UBE4A; KIAA0126 Q14139 464 Y Homo sapiens(Human) UBE4A; KIAA0126 Q14139 551 S Homo sapiens(Human) UBE4A; KIAA0126 Q14139 570 S Homo sapiens(Human) UBE4A; KIAA0126 Q14139 71 S Homo sapiens(Human) UBE4A; KIAA0126 Q14139 74 S Homo sapiens(Human) UBE4A; KIAA0126 Q14139 749 Y Homo sapiens(Human) UBE4A; KIAA0126 Q14139 940 S Homo sapiens(Human)

PTM - PhosphositePlus UniProt ID MOD_RSD Type SITE_+/-7_AA Q14139 K386-ac Acetylation EKIYQMLkNLLQLSP Q14139 K531-ac Acetylation RLHDQMVkINQNLHR Q14139 S71-p Phosphorylation SVAEISRsFRsQQEI Q14139 S74-p Phosphorylation EISRsFRsQQEICEQ Q14139 Y313-p Phosphorylation MAKVFVEyIQPkDPT Q14139 Y464-p Phosphorylation LLTFNPTyCALkELN Q14139 S551-p Phosphorylation RDAQQSSsPAADNLR Q14139 Y749-p Phosphorylation FNYRRPMyPILRYMW Q14139 S940-p Phosphorylation PKDGRSYsPTLFAQT Q14139 K33-ub Ubiquitination KQFAAIQkEQLKQQS Q14139 K104-ub Ubiquitination DNSDPSLkSGNGIPS Q14139 K190-ub Ubiquitination RAKEEITkVPENLLP Q14139 K317-ub Ubiquitination FVEyIQPkDPTNGQM Q14139 K468-ub Ubiquitination NPTyCALkELNDEER Q14139 K487-ub Ubiquitination VHMRGLDkETCLIPA Q14139 K531-ub Ubiquitination RLHDQMVkINQNLHR Q14139 K766-ub Ubiquitination DTYRESIkDLADYAS Q14139 K774-ub Ubiquitination DLADYASkNLEAMNP Q14139 K810-ub Ubiquitination IQYLSKIkIQQIEKD

PTM - dbPTM UniProt ID Position Code Type Resources References Q14139 386 K Acetylation Swiss-Prot 1010711 19608861 Q14139 62 D Caspase Phosphositeplus.1010730 18724940 Q14139 104 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21906983 Q14139 317 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21906983 Q14139 531 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21906983 Q14139 766 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21890473 Q14139 774 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21890473;21906983 Q14139 810 K Ubiquitylation Phosphositeplus.1010730 21906983 Q14139 386 K Acetylation Phosphositeplus.1010730 19608861 Q14139 749 Y Phosphorylation Phosphositeplus.1010730 18083107 Q14139 127 D Proteolytic Cleavage HPRD 9.0 11802788 Q14139 465 C S-nitrosylation dbSNO 1.0 19483679

PTM - HPRD Symbol Position Code Type References UBE4A 127 D Proteolytic Cleavage 11802788 UBE4A 393 K Acetylation 19608861 UBE4A 577 S Phosphorylation 20068231

PTM - UniProt UniProt ID Position Type PMIDs Q14139 386 N6-acetyllysine 19608861

PTM - PHOSIDA Symbol Accession Code Position Surrounding Sequence Type UBE4A IPI00028957 K 393 KIYQMLaKNLLQLS acetylation

PTM - BioGRID Entrez Gene BioGRID ID Position Code Type PMIDs 9354 114757 - K Ubiquitination 21139048 9354 114757 - K Ubiquitination 21890473 9354 114757 - K Ubiquitination 21906983 9354 114757 - K Ubiquitination 22505724 9354 114757 - K Ubiquitination 21963094 9354 114757 - K Ubiquitination 24816145 9354 114757 - K Ubiquitination 25147182

PTM - mUbiSiDa Gene Name Species Ubiquitination Site Ubiquitination Sequence Evidence PMID UBE4A Homo sapiens (Human) 774; 766; 531; 317; 104; 810 "774,LADYASKNLEAMN; 766,TYRESIKDLADYA; 531,LHDQMVKINQNLH; 317,VEYIQPKDPTNGQ; 104,NSDPSLKSGNGIP; 810,QYLSKIKIQQIEK" "774:21890473,21906983; 766:21890473; 531:21906983; 317:21906983; 104:21906983; 810:21906983" UBE4A Homo sapiens (Human) 324; 773; 817; 781; 104; 538 "324,VEYIQPKDPTNGQ; 773,TYRESIKDLADYA; 817,QYLSKIKIQQIEK; 781,LADYASKNLEAMN; 104,NSDPSLKSGNGIP; 538,LHDQMVKINQNLH" "324:21906983; 773:21890473; 817:21906983; 781:21890473,21906983; 104:21906983; 538:21906983" UBE4A Homo sapiens (Human) 774; 766; 317 "774,LADYASKNLEAMN; 766,TYRESIKDLADYA; 317,VEYIQPKDPTNGQ" 774:21890473; 766:21890473; 317:21906983 UBE4A Homo sapiens (Human) 774; 766 "774,LADYASKNLEAMN; 766,TYRESIKDLADYA" 774:21890473; 766:21890473